New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 584 total aligned reads displayed.
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2:1995474/1‑150 CCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAAT < 1:8143672/150‑1 CCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAAT < 2:3810448/150‑1 CCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAAT > 2:3420482/1‑150 CCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAAT < 1:10033146/150‑1 CCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAAT < 1:7354800/150‑1 CCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAAT > 1:5955412/1‑150 CCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCAACTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAAT > 1:9365549/1‑150 CCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATGTCTTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAAT < 1:9278677/150‑1 CCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGAGGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATATCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAAT < 1:12282526/150‑1 CAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGTGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATG > 2:9271119/1‑150 CAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATG < 2:8386956/150‑1 CAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATG < 2:8693255/150‑1 CAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATG > 2:9401396/1‑150 CAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATG > 2:8101471/1‑150 CAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATG < 2:1096586/150‑1 CAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATG > 2:9780332/1‑150 CAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATG > 2:7389681/1‑150 CAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATG > 1:8854381/1‑150 CAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATG < 1:3359659/150‑1 CAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATG < 2:6010263/150‑1 CAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATG < 1:3527271/150‑1 CAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATG > 2:3209942/1‑150 CAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATG < 2:4878262/150‑1 CAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATG > 1:4827392/1‑150 CAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATG > 1:5596672/1‑150 CAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATG < 2:4539933/150‑1 GCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCTGGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/274844‑274692 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggccAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATAACCGGGCAAACAGACGCATGGAGGCGATTTCGTACAGAGCATCTTCCATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATG > NC_000913/274732‑274880 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |