| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 4217165 | 775 (1.070) | 4 (0.010) | 3/262 | NT | 0.56% | coding (57/1305 nt) | aceA | isocitrate lyase |
| ? | NC_000913 | = 4217212 | 691 (1.010) | coding (104/1305 nt) | aceA | isocitrate lyase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGGAACAGATCACCACTTCCGATGAGTTAATTGATTTCCTGACCCTGCCAGGCTACCGCCTGTTAGCGTAAACCACCACATAACTATGGAGCATCTGCACATGAAAACCCGTACACAACAAATTGAAGAATTACAGAAAGAGTGGACTCAACCGCGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4217009‑4217165‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaccgcgtAATTTCACCACATCTTCCGCACTGTATGGGCGAGTAATGCCTTCCCAACGCGGTTGAGTCCACTCTTTCTGTAATTCTTCAATTTGTTGTGTACGGGTTTTCATGTGCAGATGCTCCATAGTTATGTGGTGGTTTACGCTAACAGGCGG < NC_000913/4217212‑4217064 TGGAACAGATCACCACTTCCGATGAGTTAATTGATTTCCTGACCCTGCCAGGCTACCGCCTGTTAGCGTAAACCACCACATAACTATGGAGCATCTGCACATGAAAACCCGTACACAACAAATTGAAGAATTACAGAAAGAGTGGACTCA > 1:7088887/1‑150TGGAACAGATCACCACTTCCGATGAGTTAATTGATTTCCTGACCCTGCCAGGCTACCGCCTGTTAGCGTAAACCACCACATAACTATGGAGCATCTGCACATGAAAACCCGTACACAACAAATTGAAGAATTACAGAAAGAGTGGACTCA > 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2:8415252/1‑150 AACAGATCACCACTTCCGATGAGTTAATTGATTTCCTGACCCTGCCAGGCTACCGCCTGTTTGCGTAAACCACCACATAACTATGGAGCATCTGCACATGAAAACCCGTACACAACAAATTGAAGAATTACAGAAAGAGTGGACTCAACC > 2:797213/1‑150 AACAGATCACCACTTCCGATGAGTTAATTGATTTCCTGACCCTGCCAGGCTACCGCCTGTTAGCGTAAACCACCACATAACTATGGAGCATCTGCACATGAAAACCCGTACACAACAAATTGAAGAATTACAGAAAGAGTGGACTCAACC < 1:2863550/150‑1 AACAGATCACCACTTCCGATGAGTTAATTGATTTCCTGACCCTGCCAGGCTACCGCCTGTTAGCGTAAACCACCACATAACTATGGAGCATCTGCACATGAAAACCCGTACACAACAAATTGAAGAATTACAGAAAGAGTGGACTCAACC > 2:2076289/1‑150 AACAGATCACCACTTCCGATGAGTTAATTGATTTCCTGACCCTGCCAGGCTACCGCCTGTTAGCGTAAACCACCACATAACTATGGAGCATCTGCACATGAAAACCCGTACACAACAAATTGAAGAATTACAGAAAGAGTGGACTCAACC > 2:4148301/1‑150 ACAGATCACCACTTCCGATGAGTTAATTGATTTCCTGACCCTGCCAGGCTACCGCCTGTTAGCGTAAACCACCACATAACTATGGAGCATCTGCACATGAAAACCCGTACACAACAAATTGAAGAATTACAGAAAGAGTGGACTCAACCG > 1:11241346/1‑150 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2:1135098/1‑150 TGGAACAGATCACCACTTCCGATGAGTTAATTGATTTCCTGACCCTGCCAGGCTACCGCCTGTTAGCGTAAACCACCACATAACTATGGAGCATCTGCACATGAAAACCCGTACACAACAAATTGAAGAATTACAGAAAGAGTGGACTCAACCGCGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4217009‑4217165‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaccgcgtAATTTCACCACATCTTCCGCACTGTATGGGCGAGTAATGCCTTCCCAACGCGGTTGAGTCCACTCTTTCTGTAATTCTTCAATTTGTTGTGTACGGGTTTTCATGTGCAGATGCTCCATAGTTATGTGGTGGTTTACGCTAACAGGCGG < NC_000913/4217212‑4217064 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |