| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4512054 = | 883 (1.220) | 6 (0.010) | 3/258 | NT | 0.72% | coding (361/957 nt) | fecD | ferric citrate ABC transporter permease |
| ? | NC_000913 | 4512149 = | 836 (1.240) | coding (266/957 nt) | fecD | ferric citrate ABC transporter permease | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CGGGCGTGCTGATACAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4512212‑4512054‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACATAATAATGCTCGTGTCC > NC_000913/4512149‑4512297 CGGGCGTGCTGATACAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG < 1:6052946/150‑1CGGGCGTGCTGATACAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG < 1:7636986/150‑1CGGGCGTGCTGATACAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG < 1:9437852/150‑1 GGGCGTGCTGATACTGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGG < 2:12023218/150‑1 GGGCGTGCTGATACAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGG > 1:2763453/1‑150 GGGCGTGCTGATACAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGG > 2:7327576/1‑150 GGGCGTGCTGATACAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGG > 1:1956533/1‑150 GGGCGTGCTGATACAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGG > 2:5781523/1‑150 GGGCGTGCTGATACAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGG < 2:11459386/150‑1 GGGCGTGCTGATACAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGG < 2:11459176/150‑1 GGGCGTGCTGATACAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGGGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGG > 2:4370830/1‑150 GCGTGCTGATACAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:5161940/150‑1 GCGTGCTGATACAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:5162081/150‑1 GCGTGCTGATACAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG > 2:4478615/1‑150 CGTGCTGATACAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGTTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGG < 2:9688117/150‑1 CGTGCTGATACAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGG < 1:2910557/150‑1 GCTGATACAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCAT > 2:6047270/1‑150 GCTGATACAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCAT > 2:9206406/1‑150 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2:6001182/1‑150 GGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACATAATAATG > 2:8794595/1‑150 GGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACATAATAATG < 1:10845017/150‑1 GCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACATAATAATGC > 2:7485186/1‑150 GCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACATAATAATGC > 1:8786556/1‑150 GCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACATAATAATGC > 1:6187268/1‑150 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1:6441509/1‑150 TGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACATAATAATGCTCGTGT < 2:8880696/150‑1 TGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACATAATAATGCTCGTGT > 1:6442388/1‑150 TGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACATAATAATGCTCGTGT > 1:6441673/1‑150 GGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACATAATAATGCTCGTGTC < 2:10404833/150‑1 GTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCACGCGCGGCAGTCGGTCCTCCATCAATACATAATAATGCTCGTGTCC > 2:8401702/1‑150 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2:5152602/1‑150 GTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACATAATAATGCTCGTGTCC > 2:4659922/1‑150 GTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACATAATAATGCTCGTGTCC < 2:3730799/150‑1 GTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACATAATAATGCTCGTGTCC > 2:8394948/1‑150 GTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACATAATAATGCTCGTGTCC > 2:8394965/1‑150 GTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACATAATAATGCTCGTGTCC > 2:368070/1‑150 GTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACATAATAATGCTCGTGTCC < 1:310345/150‑1 GTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACATAATAATGCTCGTGTCC > 1:1305714/1‑150 GTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACATAATAATGCTCGTGTCC > 2:10398095/1‑150 GTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACATAATAATGCTCGTGTCC < 1:3288120/150‑1 GTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACATAATAATGCTCGTGTCC > 1:10257975/1‑150 CGGGCGTGCTGATACAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4512212‑4512054‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACATAATAATGCTCGTGTCC > NC_000913/4512149‑4512297 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |