New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3619766 | NA (NA) | 3 (0.000) | 3/272 | NT | 100% | coding (575/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
? | NC_000913 | = 3619843 | 0 (0.000) | coding (652/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
TAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCACCGGCGTGACGGATGGTGCCTGGCGTCACTTCCGGCTGGTACTGACCACGCAGGCGCAGCGGGCAGAAGAAGCCCGGCAGCAGGCCATTTCCGGCGGG > NC_000913/3619694‑3619992 | tAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGC > 1:3099131‑M2/1‑150 (MQ=255) tAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGC > 1:7839424‑M2/1‑150 (MQ=255) tAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGC > 1:7702406‑M2/1‑150 (MQ=255) tAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGC > 1:7470170‑M2/1‑150 (MQ=255) tAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGC > 2:2986096‑M2/1‑150 (MQ=255) tAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGC > 2:4034774‑M2/1‑150 (MQ=255) tAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGC > 2:1958603‑M2/1‑150 (MQ=255) tAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGC < 1:3371133‑M2/150‑1 (MQ=255) tAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGC < 1:3371127‑M2/150‑1 (MQ=255) tAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGC < 1:3371110‑M2/150‑1 (MQ=255) tAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGC > 2:6823840‑M2/1‑150 (MQ=255) tAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGC > 2:7065372‑M2/1‑150 (MQ=255) tAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGC > 2:8375804‑M2/1‑150 (MQ=255) tAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGC > 2:1060945‑M2/1‑150 (MQ=255) tAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGC > 1:11498840‑M2/1‑150 (MQ=255) tAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGC > 1:10874641‑M2/1‑150 (MQ=255) tAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGC > 1:10355091‑M2/1‑150 (MQ=255) gggTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcgga < 1:10744605‑M2/150‑70 (MQ=255) ggTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggac < 2:1836132‑M2/150‑71 (MQ=255) gTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggact < 2:8577578‑M2/150‑72 (MQ=255) aggcacccgctcacaccaaccgagcagccaccaaggcaccagcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagctccagcaagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttctccacgccgcc < 2:1293463‑M2/149‑147 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggtctgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagcgtgcggccagccggtgaccgtcatccagtttcgccacgccgccg < 1:1213108‑M2/150‑148 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg < 2:1566842‑M2/150‑148 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg < 2:5608691‑M2/150‑148 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg < 2:3054245‑M2/150‑148 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg < 2:3054516‑M2/150‑148 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg > 2:11037629‑M2/1‑3 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg < 2:3418000‑M2/150‑148 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg < 2:3609633‑M2/150‑148 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg > 2:3833628‑M2/1‑3 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg < 2:4306128‑M2/150‑148 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg < 2:10352715‑M2/150‑148 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg < 2:7315694‑M2/150‑148 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg < 2:8183601‑M2/150‑148 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg < 2:8543407‑M2/150‑148 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg > 2:8959023‑M2/1‑3 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg > 1:10337222‑M2/1‑3 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg > 2:11037298‑M2/1‑3 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg < 1:3951090‑M2/150‑148 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg < 1:3134409‑M2/150‑148 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg < 1:2955286‑M2/150‑148 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg < 1:2360761‑M2/150‑148 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg > 1:10892967‑M2/1‑3 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg > 1:10335672‑M2/1‑3 (MQ=255) ggCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggacggtttgtcgccagatcccgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgcccgagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccg < 2:3635958‑M2/150‑148 (MQ=255) gCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataatgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccgc < 1:4529464‑M2/150‑149 (MQ=255) gCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccgc < 1:1891936‑M2/150‑149 (MQ=255) gCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccgc > 1:2914458‑M2/1‑2 (MQ=255) gCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccgc < 1:11873303‑M2/150‑149 (MQ=255) gCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccgc < 2:5178909‑M2/150‑149 (MQ=255) gCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccgc < 2:4427700‑M2/150‑149 (MQ=255) gCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccgc < 1:4326313‑M2/150‑149 (MQ=255) gCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccgc < 1:6796719‑M2/150‑149 (MQ=255) gCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccgc < 2:4169059‑M2/150‑149 (MQ=255) gCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccgc > 2:3392636‑M2/1‑2 (MQ=255) gCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccgc > 1:8449405‑M2/1‑2 (MQ=255) gCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccgc > 1:8708869‑M2/1‑2 (MQ=255) gCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccgc > 1:900844‑M2/1‑2 (MQ=255) gCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccgc > 2:2191936‑M2/1‑2 (MQ=255) gCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccgc > 1:9592746‑M2/1‑2 (MQ=255) gCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccgc < 2:10281450‑M2/150‑149 (MQ=255) gCacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccgc < 2:10343662‑M2/150‑149 (MQ=255) ccacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccgc > 1:7253172‑M2/2‑2 (MQ=255) cacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccgcg < 2:6047160‑M2/150‑150 (MQ=255) cacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccgcg > 2:1415588‑M2/1‑1 (MQ=255) cacccgctcacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccgcg > 2:11638921‑M2/1‑1 (MQ=255) cacccgctaacaccaaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggtgaccttcatccagtttcgccacgccgccgcg < 1:7651978‑M2/150‑150 (MQ=255) | TAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCACCGGCGTGACGGATGGTGCCTGGCGTCACTTCCGGCTGGTACTGACCACGCAGGCGCAGCGGGCAGAAGAAGCCCGGCAGCAGGCCATTTCCGGCGGG > NC_000913/3619694‑3619992 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |