| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,904,212 | G→A | 100% | intergenic (+838/+535) | ygcE → / ← queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,904,212 | 0 | G | A | 100.0% | 3401.9 / ‑6.7 | 926 | intergenic (+838/+535) | ygcE/queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/2); major base A (446/461); minor base T (1/8); total (450/476) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 939 total aligned reads displayed.
GTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTT > NC_000913/2904065‑2904358 | gTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGacg > 1:1751905/1‑150 (MQ=255) ccGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAac > 1:10044831/1‑150 (MQ=255) ggTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAacac < 1:8137753/150‑1 (MQ=255) tCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTCGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGACTCCAAAGCCGTGTATCTGCTCGGGTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACCCTGGctc > 2:1962217/1‑150 (MQ=255) ccccGCTGGCGCGGGGACCACCTGTTGTCGCAAATCTATGGACTCGGGCTATTCGGTTTCTCCCCGCGGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACACTGGctct < 2:1731800/150‑1 (MQ=255) cccGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACACTGGctcag > 1:376918/1‑148 (MQ=255) cccGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACACTGGCTCTg < 1:8704212/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTTACGCGGGGAACACTGGCTCTGc < 1:7264475/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACACTGGCTCTGc > 1:8338913/1‑150 (MQ=255) gCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACACTGGCTCTGCaa < 1:2842815/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACACTGGCTCTGCAAc < 2:960301/150‑1 (MQ=255) ggCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTAGTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACACTGGCTCTGCAAcag < 1:2676002/150‑1 (MQ=255) ggCGCGGGGAACACCTGTTGTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACACTGGCTCTGCAAcag < 2:2654104/150‑1 (MQ=255) ggggAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAgcagca < 1:5821425/150‑1 (MQ=255) ggggAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAgcagca < 1:6913296/150‑1 (MQ=255) ggAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCCATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTAGCTGCTCGGTTTATCACCGCTGACGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCTcc > 1:7870160/1‑150 (MQ=255) aagacgtGTTTTCGCAAATCTATGGTCTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCTCGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCa < 1:7375725/144‑1 (MQ=255) aaCACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCa > 1:2459941/1‑150 (MQ=255) acCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGTCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTTCTAGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACACTGGATCAGCAACAGCAGCACCAATGa > 2:543668/1‑150 (MQ=255) acCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGa > 2:6411922/1‑150 (MQ=255) cTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGAcc > 1:11352000/1‑150 (MQ=255) cTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGAcc > 2:5773569/1‑150 (MQ=255) cTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGATCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGAcc > 2:10888146/1‑150 (MQ=255) 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aaaTCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGttt > 2:3618104/1‑150 (MQ=255) tATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATccc < 2:2796945/150‑1 (MQ=255) aTGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATcccc < 2:10538796/150‑1 (MQ=255) tGGACTATTGCTATACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCg > 1:10164051/1‑150 (MQ=255) aCTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCGCACCGAAAACAAATCCCTGGATCTCCTCGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACACTGGCTCATCAACAGCAGCACCCATGACCACTTAGGTTTATCCCCGCTg > 2:3279292/1‑150 (MQ=25) 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cGCTGACGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCtt > 2:1217364/1‑150 (MQ=255) | GTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTT > NC_000913/2904065‑2904358 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |