Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 3,622,422 | C→G | 5.9% | A1077A (GCC→GCG) | rhsB → | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,622,422 | 0 | C | G | 5.9% | 3608.0 / 178.6 | 1048 | A1077A (GCC→GCG) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (556/430); new base G (28/33); total (585/463) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.13e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 1097 total aligned reads displayed.
CGGCTGGGACGGCGACCGGCTGACCACGATACAGAACGACAGGAGCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACCGTGGA > NC_000913/3622272‑3622571 | ggCTGGGACGGCGACCGGCTGACCACGATACAGAACGACAGGAGCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGcc > 1:9557673/1‑150 (MQ=255) gCTGGGACGGCGACCGGCTGACCACGATACAGAACGACAGGAGCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGccc < 1:8163929/150‑1 (MQ=255) tGGGACGGCGACCGGCTGACCACGATACAGAACGACAGGAGCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCtt > 1:5711644/1‑150 (MQ=255) tGGGACGGCGACAGGCTGACCACGATACAGAACGACAGCAGCCGCATCCAGACCAATTATCAGCCGGGTAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGCATTACCtt > 1:11448897/1‑150 (MQ=14) gggACGGCGACCGGCTGACCACGATACAGAACGACAGGAGCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTc < 2:1690390/150‑1 (MQ=255) ggACGGCGACCGGCTGACCACGATACAGAACGACAGGAGCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTca < 1:119821/150‑1 (MQ=255) gACGGCGACCGGCTGACCACGATACAGAACGACAGGAGCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTcag < 2:4990947/150‑1 (MQ=255) ggCGACCGGCTGACCACGATACAGAACGACAGGAGCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTcagcag > 1:6080787/1‑150 (MQ=255) 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aCCACGATACAGAACGACAGGAGCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGaa > 2:4316411/1‑150 (MQ=255) ccACGATACAGAACGACAGGAGCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAg < 2:11830018/150‑1 (MQ=255) cACGATACAGAACGACAGGAGCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGa > 1:11589107/1‑150 (MQ=255) cACGATACAGAACGACAGGAGCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGa > 1:10751857/1‑150 (MQ=255) cACGATACAGAACGACAGGAGCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGa > 1:5170938/1‑150 (MQ=255) 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ccTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACCGTGGa < 2:5395930/150‑1 (MQ=11) ccTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACCGTGGa > 2:3728744/1‑150 (MQ=11) | CGGCTGGGACGGCGACCGGCTGACCACGATACAGAACGACAGGAGCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACCGTGGA > NC_000913/3622272‑3622571 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |