Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,005,308 | 0 | A | T | 5.9% | 2566.2 / 17.6 | 801 | A149A (GCA→GCT) | pldA | outer membrane phospholipase A |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.49e-18 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 823 total aligned reads displayed.
GGGATTTTAGGCCCGAACTCGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGT > NC_000913/4005159‑4005457 | ggATTTTAGGCCCGAACTCGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAg < 1:6423331/150‑1 (MQ=255) ggATTTTAGGCCCGAACTCGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCAATTACCGTTTTGCAg > 1:7796252/1‑150 (MQ=255) aTTTTAGGCCCGAACTCGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGt < 2:7581689/150‑1 (MQ=255) 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ttGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTAtg < 1:1102740/150‑1 (MQ=255) aGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATgtggt < 2:6413930/150‑1 (MQ=255) | GGGATTTTAGGCCCGAACTCGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGT > NC_000913/4005159‑4005457 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |