| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 737,043 | 0 | T | C | 5.6% | 396.4 / 9.4 | 122 | pseudogene (219/1137 nt) | ybfL | pseudogene, DDE domain transposase family;putative factor; Not classified; putative receptor protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (48/66); new base C (4/3); total (52/70) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.61e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
GGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGA > NC_000913/736906‑737182 | gtcATACTACTCTTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTAt < 2:1038680/138‑1 (MQ=255) aTCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGc < 1:1229356/140‑1 (MQ=255) gctactcTTGACTTTTTGTGCCGTTTTTTCTGGTGCAGATAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCa < 2:13678/139‑1 (MQ=11) ccTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCa < 1:1690272/140‑1 (MQ=255) 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GGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGA > NC_000913/736906‑737182 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |