Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 737,928 | C→G | 6.4% | pseudogene (1104/1137 nt) | ybfL → | pseudogene, DDE domain transposase family;putative factor; Not classified; putative receptor protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 737,928 | 0 | C | G | 6.4% | 562.8 / 24.9 | 155 | pseudogene (1104/1137 nt) | ybfL | pseudogene, DDE domain transposase family;putative factor; Not classified; putative receptor protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (63/82); new base G (7/3); total (70/85) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.87e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
CAAAATAAGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACT > NC_000913/737790‑738067 | cAAAAAAAGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTcg > 1:190903/1‑140 (MQ=255) aTACGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTc < 1:1326166/140‑1 (MQ=255) aTAAGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTc < 1:1326229/140‑1 (MQ=255) tAAGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCa > 2:1398295/1‑140 (MQ=255) tAAGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCa < 2:714902/140‑1 (MQ=255) aagcagAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAg < 2:1205604/140‑1 (MQ=255) aagaagAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAg < 1:1673301/140‑1 (MQ=255) aagaagAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAg < 1:1300/140‑1 (MQ=255) aagaagAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTATCTGGCGTCAg < 1:971116/140‑1 (MQ=21) gAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCg < 2:357772/140‑1 (MQ=255) gAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCg < 2:211377/140‑1 (MQ=255) aaCGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCggg > 2:1706486/1‑140 (MQ=255) cgccgcAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGa > 2:1797948/1‑140 (MQ=255) cAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCggg < 1:1236136/140‑1 (MQ=40) cAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCggg < 2:70487/140‑1 (MQ=40) cAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCggg < 2:548299/140‑1 (MQ=40) cAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCggg < 1:236360/140‑1 (MQ=40) cAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCggg < 2:1626422/140‑1 (MQ=40) cAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCggg < 2:327169/140‑1 (MQ=40) cAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCggg < 2:327011/140‑1 (MQ=40) gAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCt > 1:140354/1‑140 (MQ=40) tataTTCAGGGATACGGCACATAGCTATAAATATTTTGACGCATGATACGGTATTCAACGCAGGGTTAAGCCGTAAGATGCGAACAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCg < 2:1887718/140‑1 (MQ=11) tCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATc < 2:664245/140‑1 (MQ=40) aGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCtt > 2:133567/1‑140 (MQ=40) tACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCt > 1:644259/1‑140 (MQ=255) tACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCt < 2:1458296/140‑1 (MQ=255) cacaTCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCttt < 1:411520/140‑1 (MQ=255) cacaTCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCttt < 1:703289/140‑1 (MQ=255) aTCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTg > 2:863891/1‑140 (MQ=255) aTCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTg < 2:919749/140‑1 (MQ=255) tCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGt > 1:909607/1‑140 (MQ=255) tCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGt < 2:508889/140‑1 (MQ=255) cTATTAATATTTTAACGAATGATACGGTATTCATGGCAGGTTTAAGACGTAAGCTGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGATCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACt < 2:1769113/140‑1 (MQ=17) tATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTa > 1:873681/1‑140 (MQ=255) ttAATATTTTGACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTATCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTaaa > 1:657549/1‑140 (MQ=255) atatTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGACCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAaataa > 2:5027/1‑140 (MQ=255) tttAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCg > 1:1894455/1‑140 (MQ=255) tATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGGAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCATTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTaaaaa < 2:1614040/140‑1 (MQ=255) tATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGTATAGAAACTATCTCGCTTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATTTTTaaaaa < 2:1613993/140‑1 (MQ=255) tATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTaaaaa < 2:1819024/140‑1 (MQ=255) tATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTaaaaa < 2:1819416/140‑1 (MQ=255) tATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTaaaaa < 2:1223392/140‑1 (MQ=255) tATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTaaaaa < 2:1644227/140‑1 (MQ=255) tATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTAGCATTTTATGTTTaaaaa < 2:1138627/140‑1 (MQ=255) tATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAAATATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTTTGTTTaaaaa < 2:85244/140‑1 (MQ=255) aTTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAAt < 2:1560181/140‑1 (MQ=255) aTTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAAt < 2:1558971/140‑1 (MQ=255) aTTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTACGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAAt < 2:1657389/140‑1 (MQ=255) aTTCAAGGAAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCTTGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCATTGTGGGGAGCGGGATTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATGCGCATTTTATGTTTAAAAAt < 2:1723961/140‑1 (MQ=21) ttCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTATAAAtt > 1:1608451/1‑140 (MQ=255) tCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTg > 2:1847791/1‑140 (MQ=255) ggCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGat > 2:1653711/1‑140 (MQ=255) cAGGGTTTCGACGTAAGCGGCGAATAGCAGCCATGGATAGAAACTCTCTCGCGTCTGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGatat < 2:1793077/140‑1 (MQ=25) cAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCTTTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGatat < 2:1578411/140‑1 (MQ=255) cAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAACAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGatat > 1:1168635/1‑140 (MQ=255) aGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTTAAAATTGAGATCtt > 1:1015796/1‑140 (MQ=255) aGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATAtt > 1:1005161/1‑140 (MQ=255) aGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATAtt > 1:1005487/1‑140 (MQ=255) tAAGACGTTAGATGCGTAAAGCAGCCTTGGATTGTAACTTTGTCGCGTCAGTACTTGGGTGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCGCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCtta < 2:291001/140‑1 (MQ=25) tAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCtta < 2:929820/140‑1 (MQ=255) tAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCtta < 2:930532/140‑1 (MQ=255) tAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCtta < 2:1324973/140‑1 (MQ=255) agtcttAAGATGCGTATAGCAGCCTTGGATAGTTTCTATCTCGCGTGAGTCCTTGCGGGGTGCGGGCTTTCGTATTCTTTCCGTGCTTTTTGTTCTAAATTTTTTGCTTTTTATGTTTAAAAATTGAGTTATTCattatt < 1:1467585/135‑1 (MQ=255) aGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCttatt < 1:1467594/140‑1 (MQ=255) aGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCttatt < 1:1467252/140‑1 (MQ=255) tAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTg > 2:782230/1‑140 (MQ=255) tAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTg > 1:1607961/1‑140 (MQ=255) tAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTg > 2:821496/1‑140 (MQ=255) tAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTg > 2:83362/1‑140 (MQ=255) tAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTg > 1:1362944/1‑140 (MQ=255) tAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTg > 2:197492/1‑140 (MQ=255) tAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTg > 1:643529/1‑140 (MQ=255) aaGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGa > 1:518587/1‑140 (MQ=255) aaGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGa > 1:1489675/1‑140 (MQ=255) aaGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGa > 1:729799/1‑140 (MQ=255) aaGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGa > 1:1022268/1‑140 (MQ=255) aaGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAACAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCtaa > 1:626451/1‑138 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGaa > 1:450933/1‑140 (MQ=255) gATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAg < 2:754752/140‑1 (MQ=255) gATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAg < 2:529769/140‑1 (MQ=255) gATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAg < 2:754927/140‑1 (MQ=255) cGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGt > 2:1576671/1‑140 (MQ=255) gcagcCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTa < 1:1605632/140‑1 (MQ=255) gcagcCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTa < 1:1885447/140‑1 (MQ=255) gcagcCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTa < 1:289916/140‑1 (MQ=255) ccATGTATAGAAACTTTCTCGATTCAGTCCTTGCTTGGAGAGGGATTTAGTAATCTTTCCCTGATTTTTGTAATAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGc < 1:1757699/140‑1 (MQ=18) ccAAGGATTGTAACCTTCTCGATTCAGTCCGTTGGTGGCGAGGGCATTCTTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGTGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGc < 1:1757677/140‑1 (MQ=14) aTGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCtt > 1:548736/1‑140 (MQ=255) tAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACa < 1:1530501/140‑1 (MQ=255) tAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACa < 1:113095/140‑1 (MQ=255) tAGAAACTATATCGCGTCATTACTTGCGGTGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACa < 2:802898/140‑1 (MQ=255) aaaCTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGa > 1:1086921/1‑140 (MQ=255) aaaCTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGa > 2:1430392/1‑140 (MQ=255) aaaCTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGa > 2:288834/1‑140 (MQ=255) tATCTCGCGTCATTCCTTTAGGGTAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTTTACTAAATAATTAGCTTTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTACTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCaa < 2:1131997/140‑1 (MQ=18) aTCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCaaa > 1:1632267/1‑140 (MQ=255) aTCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCaaa > 1:618014/1‑140 (MQ=255) tctcGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAAt > 1:1105505/1‑140 (MQ=255) tctcGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTAGTACTAAATAATTCGAATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAAt > 1:167503/1‑140 (MQ=255) cgcgTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATAct < 2:1263467/140‑1 (MQ=255) | CAAAATAAGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACT > NC_000913/737790‑738067 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |