| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,086,485 | G→T | 6.2% | P12Q (CCA→CAA) | pgaD ← | biofilm PGA synthase PgaCD, regulatory subunit; c‑di‑GMP‑stimulated activity and dimerization |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,086,485 | 0 | G | T | 6.2% | 228.1 / 2.7 | 64 | P12Q (CCA→CAA) | pgaD | biofilm PGA synthase PgaCD, regulatory subunit; c‑di‑GMP‑stimulated activity and dimerization |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/25); new base T (2/2); total (37/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.03e-01 | |||||||||||
GGCTTCTGGCCTCGCTTTGCCAGTAATAACCCGTCAGCAGATCCATGGCGAATAAGAATATGAACAACGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACTCGTGTAAATGATACCAATGTCGTTGCCAGGCTCAG > NC_000913/1086363‑1086625 | ggCTTCTGGCCTCGCTTTGCCAGTAATAACCCGTCAGCAGATCCATGGCGAATAAGAATATGAACAACGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGta > 1:1128823/1‑140 (MQ=255) gCTTCTGGCCTCGCTTTGCCAGTAATAACCCGTCAGCAGATCCATGGCGAATAAGAATATGAACAACGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGtaa < 2:909505/140‑1 (MQ=255) cTTCTGGCCTCGCTTTGCCAGTAATAACCCGTCAGCAGATCCATGGCGAATAAGAATATGAACAACGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGtaat > 1:661267/1‑140 (MQ=255) cTGGCCTCGCTTTGCCAGTAATAACCCGTCAGCAGATCCATGGCGAATAAGAATATGAACAACGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTaataat > 2:1330268/1‑140 (MQ=255) gCTTTGCCAGTAATAACCCGTCAGCAGATCCATGGCGAATAAGAATATGAACAACGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGt < 1:1844044/140‑1 (MQ=255) gTAATAACCCGTCAGCAGATCCATGGCGAATAAGAATATGAACAACGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTaa < 2:1354711/140‑1 (MQ=255) aataaCCCGTCAGCAGATCCATGGCGAATAAGAATATGAACAACGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTTATAATTAAATTGTTCATATTAAcc < 1:286935/140‑1 (MQ=255) ataaCCCGTCAGCAGATCCATGGCGAATAAGAATATGAACAACGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACct > 1:818915/1‑140 (MQ=255) tCAGCAGATCCATGGCGAATAAGAATATGAACAACGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAAt > 1:1774833/1‑140 (MQ=255) cagATCCCTGGCGAATAAGAATCTGAACACCGCAAATAATGTCCACAAGTTGGTTGAGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGACGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCcg < 2:386403/140‑1 (MQ=255) aTCCATGGCGAATAAGAATATGAACAACGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTTGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGa > 2:169920/1‑140 (MQ=255) aTCCATGGCGAATAAGAATATGAACAACGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTTGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGa > 2:170247/1‑140 (MQ=255) tCCATGGCGAATAAGAATATGAACAACGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt < 1:399250/140‑1 (MQ=255) tCCATGGCGAATAAGAATATGAACAAAGCAAATATTGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATCTTAACCTCTCAGAATCCCGCGAt < 1:398351/140‑1 (MQ=255) ccATGGCGAATAAGAATATGAACAACGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATc < 2:1922425/140‑1 (MQ=255) ccATGGCGAATAAGAATATGAACAACGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATc < 2:1404195/140‑1 (MQ=255) aaTAAGAATATGAACAACGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTa > 1:1560109/1‑140 (MQ=255) aaTAAGAATATGAACAACGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTa > 1:585127/1‑140 (MQ=255) aaTAAGAATATGAACAACGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTa > 1:29802/1‑140 (MQ=255) aTAAGAATATGAACAACGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTAc > 1:508946/1‑140 (MQ=255) tGAACAACGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTTTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGTGTCGTAATAATTAAATTTTTCATATTAACATCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTCCCCAACGGgc > 2:829462/1‑140 (MQ=255) tGAACAACGCAAATAATGTCCACAAGAAGGTTGTGGCAACATAATCAACCATTAAACGTACTGGTTATTTTCGGGTAGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCGCTCAGAAACCCGCGATCGGGACTTACCCAAAGGgc > 2:829157/1‑140 (MQ=255) acaacGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGcgcg > 1:419078/1‑140 (MQ=255) acaacGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGcgcg > 1:630652/1‑140 (MQ=255) acaacGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGcgcg < 1:694867/140‑1 (MQ=255) acaacGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGcgcg > 1:774859/1‑140 (MQ=255) caacGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTTGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGt < 1:170247/140‑1 (MQ=255) caacGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTTGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGt < 1:169920/140‑1 (MQ=255) aacGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGtt < 1:911873/140‑1 (MQ=255) acGCAAATAATGTCCACACGATGGTGGGGGCAGCATACTCAACCAGGAAGCGTCCGGGTGGTTGGCGGGTCGTGAGAGGTCAGTTGGTCAGCTTCAGCGCGCAGATTCCCGGGAGCGGGACTTACCCATGGGGCGCGGTg > 2:1493414/1‑140 (MQ=255) acGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTATCCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTg > 1:1087758/1‑140 (MQ=255) acGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTg > 1:935279/1‑140 (MQ=255) acGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTg > 2:1662261/1‑140 (MQ=255) acGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTg > 1:696713/1‑140 (MQ=255) acGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTg > 1:1559037/1‑140 (MQ=255) acGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTg > 1:1300829/1‑140 (MQ=255) ctcAAATAATCTCCAAAATATGTTTTAGTCAACAAAAAAAAACAGAAAACTTAATGTTGAAAGTCGGGTCGTAATAATTAAATATTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCTCGATCGGTACTTACCCAACTGGCGCGTTga > 2:1923624/3‑139 (MQ=255) cGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGc > 1:1697406/1‑140 (MQ=255) aataatGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCtttt < 2:189878/140‑1 (MQ=255) aataatGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCtttt < 2:189697/140‑1 (MQ=255) aataatGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCtttt < 2:73309/140‑1 (MQ=255) tattGTCCACAAGATTGTTGTGGCATCATAATCATCCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTATTATTTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGACTCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTa < 1:680702/137‑1 (MQ=255) taatGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTa < 1:1294266/140‑1 (MQ=255) atGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAgg > 2:189430/1‑140 (MQ=255) tGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGc < 1:1860647/140‑1 (MQ=255) tGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGc < 2:243837/140‑1 (MQ=255) gTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCa < 1:1698405/140‑1 (MQ=255) tCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCAt > 1:1054383/1‑140 (MQ=255) tCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCAt > 1:875751/1‑140 (MQ=255) tCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGACGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGTGCGCGTTGCTTTTTAGGCAt > 1:1054342/1‑140 (MQ=255) aTGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACATCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGa > 1:1097115/1‑140 (MQ=255) ggTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACt > 1:1363197/1‑140 (MQ=255) ttGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACTCg > 2:1651374/1‑140 (MQ=255) gtgGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACTCgtg < 2:1640127/140‑1 (MQ=255) gtgGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACTCgtg < 2:704650/140‑1 (MQ=255) gCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACTCGTGTaa > 1:1859057/1‑140 (MQ=255) aCATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATATTTAACTTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACTCGTGTAAATg < 1:75590/140‑1 (MQ=255) cATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACTCGTGTAAATGa > 2:272948/1‑140 (MQ=255) aTAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATTTTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGAATCGTGTAAATGAt > 1:687399/1‑140 (MQ=255) tAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTATGCATCAACATGACTCGTGTAAATGATACCAATGTCGtt > 2:258270/1‑140 (MQ=255) tAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACTCGTGTAAATGATACCAATGTCGtt > 2:776753/1‑140 (MQ=255) acttACTGGTGTTTGTCGGTTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACTCGTGTAAATGATACCAATGTCGTTGcc < 2:1066241/137‑1 (MQ=255) aCGTCCTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACTCGTGTAAATGATACCAATGTCGTTGcc < 2:1599186/140‑1 (MQ=255) aCGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACTCGTGTAAATGATACCAATGTCGTTGcc < 2:587980/140‑1 (MQ=255) ggTTATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGC‑TTTTAGGCATCAACATGACTCGTGTAAATGATACCAATGTCGTTGCCAGGCTCAg > 2:796479/1‑140 (MQ=255) ggTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGCCTTACCCACCGGCCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACTCGTGTAAATGATACCAATGTCGTTGCCAGGCTCa > 2:493509/1‑140 (MQ=255) ggTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACTCGTGTAAATGATACCAATGTCGTTGCCAGGCTCa > 2:525493/1‑140 (MQ=255) ggTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACTCGTGTAAATGATACCAATGTCGTTGCCAGGCTCa > 2:527190/1‑140 (MQ=255) ggTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACTCGTGTAAATGATACCAATGTCGTTGCCAGGCTCa > 2:501143/1‑140 (MQ=255) ggTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACTCGTGTAAATGATACCAATGTCGTTGCCAGGCTCa > 2:795979/1‑140 (MQ=255) ggTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACTCGTGTAAATGATACCAATGTCGTTGCCAGGCTCa > 2:796450/1‑140 (MQ=255) ggTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACTCGTGTAAATGATACCAATGTCGTTGCCAGGCTCa > 2:1373053/1‑140 (MQ=255) ggTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACTCGTGTAAATGATACCAATGTCGTTGCCAGGCTCa > 1:151387/1‑140 (MQ=255) ggTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACTCGTGTAAATGATACCAATGTCGTTGCCAGGCTCa > 2:909779/1‑140 (MQ=255) ggTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACTCGTGTAAATGATACCAAAGTCGTTGCCAGGCTCa > 2:512697/1‑140 (MQ=255) ggTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTGTTTAGGCATCAACATGACTCGTGTAAATGATACCAATGTCGTTGCCAGGCTCa > 2:402342/1‑140 (MQ=255) | GGCTTCTGGCCTCGCTTTGCCAGTAATAACCCGTCAGCAGATCCATGGCGAATAAGAATATGAACAACGCAAATAATGTCCACAAGATGGTTGTGGCAACATAATCAACCAGTAAACGTACTGGTGATTGTCGGGTCGTAATAATTAAATTGTTCATATTAACCTCTCAGAATCCCGCGATCGGGACTTACCCAACGGGCGCGTTGCTTTTTAGGCATCAACATGACTCGTGTAAATGATACCAATGTCGTTGCCAGGCTCAG > NC_000913/1086363‑1086625 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |