Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,013,898 | G→T | 5.5% | G224W (GGG→TGG) | fliF → | flagellar basal‑body MS‑ring and collar protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,013,898 | 0 | G | T | 5.5% | 271.0 / 2.6 | 72 | G224W (GGG→TGG) | fliF | flagellar basal‑body MS‑ring and collar protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/30); new base T (2/2); total (40/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 |
TTACCCGGCCGCGCACTCGATGAAGGGCAAATTAGCGCCATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAATATTCACGCCCAGGTTACGGCGCAGCTGGACTTC > NC_000913/2013760‑2014035 | ttACCCGGCCGCGCACTCGATGAAGGGCAAATTAGCGCCATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCgg > 2:1374171/1‑140 (MQ=255) ttACCCGGCCGCGCACTCGATGAAGGGCAAATTAGCGCCATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCgg > 2:1258579/1‑140 (MQ=255) cccGGCCGCGCACTCGATGAAGGGCAAATTAGCGCCATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGgcg < 1:1256756/140‑1 (MQ=255) ggCCGCGCACTCGATGAAGGGCAAATTAGCGCCATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGa > 2:255778/1‑140 (MQ=255) ggCCGCGCACTCGATGAAGGGCAAATTAGCGCCATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGa > 1:1587917/1‑140 (MQ=255) gCCGCGCACTCGATGAAGGGCAAATTAGCGCCATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGAt > 1:880543/1‑140 (MQ=255) cGATGAAGGGCAAATTAGCGCCATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACg < 1:1597376/140‑1 (MQ=255) cGATGAAGGGCAAATTAGCGCCATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACg < 1:1597217/140‑1 (MQ=255) atgggCAATTTTGCGCCTTTGTGCATCTGGATTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAATCGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAAGACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAg < 2:1490867/138‑1 (MQ=255) gCAAATTAGCGCCATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGa > 2:913639/1‑140 (MQ=255) gCAAATTAGCGCCATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGa > 2:461036/1‑140 (MQ=255) aaaTTAGCGCCATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGaaa > 1:270878/1‑140 (MQ=255) aaaTTAGCGCCATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGaaa > 2:320551/1‑140 (MQ=255) aaaTTAGCGCCATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGaaa < 2:904938/140‑1 (MQ=255) aaaTTAGCGCCATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGaaa > 1:131298/1‑140 (MQ=255) gcCATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAg < 2:384305/140‑1 (MQ=255) cATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCTATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCg < 1:193555/140‑1 (MQ=255) cATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCg < 1:1402177/140‑1 (MQ=255) cATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCg < 2:617605/140‑1 (MQ=255) cATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCg < 1:1199243/140‑1 (MQ=255) cATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCg < 1:813877/140‑1 (MQ=255) cATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATCCCAGCg < 1:900122/140‑1 (MQ=255) cATTGTGCATCTGGTGTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCg < 1:1366289/140‑1 (MQ=255) ttGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGAt > 1:1478532/1‑140 (MQ=255) gCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCg > 1:64448/1‑140 (MQ=255) cATCTGGTTTCGAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCgt < 1:261783/140‑2 (MQ=255) cATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGa < 1:1146660/140‑1 (MQ=255) cATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGa < 1:261777/140‑1 (MQ=255) cATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGa < 1:261978/140‑1 (MQ=255) gTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCg > 2:388960/1‑140 (MQ=255) tttCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGt > 2:290952/1‑140 (MQ=255) aGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCTCGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCa < 2:1872076/140‑1 (MQ=255) gcgcCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCTGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAg > 1:1272648/1‑140 (MQ=255) gcgcCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCTGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAg > 1:1276874/1‑140 (MQ=255) gcCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAgcg < 1:118112/140‑1 (MQ=255) gcCGTTGCGGGTCTGCCGCCGGGCACCGTCCCGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTAAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAgcg < 1:941036/140‑1 (MQ=255) gTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGaa > 2:1797/1‑140 (MQ=255) tCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCTGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAg < 2:1276874/140‑1 (MQ=255) tCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCTGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAg < 2:1272648/140‑1 (MQ=255) ccgGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGTCATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTTAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCt < 1:489087/140‑1 (MQ=255) acgGGAAACGTCTAGCTGGTGTATCAGGGCGGACATCTGTTTACCCAGTCGAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGTAATATGCCAGCGATGTCGAAGGACGTATTCTGCGGCGTATTGAAGCGATCCt < 1:1917100/139‑1 (MQ=255) agTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTa < 2:1880521/139‑1 (MQ=255) tCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTAtt < 1:1038574/140‑1 (MQ=255) tCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTAtt < 1:1402479/140‑1 (MQ=255) tCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTAAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTAtt < 1:1402144/140‑1 (MQ=255) tggtggATCAGGGCGGTCATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGATGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGt < 1:1230737/140‑1 (MQ=255) gtggATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTaa < 1:913639/140‑1 (MQ=255) cAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTaa > 2:1414568/1‑140 (MQ=255) cAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTaa > 1:750425/1‑140 (MQ=255) gggCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAata > 2:1050155/1‑140 (MQ=255) gggCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAata > 2:440158/1‑140 (MQ=255) gggCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAata > 2:368908/1‑140 (MQ=255) ggCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAatat < 1:1797/140‑1 (MQ=255) gCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAATAtt > 1:1687743/1‑140 (MQ=255) gACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAATATTCAc > 1:273149/1‑140 (MQ=255) aTCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAATATTCACGcc < 1:832193/140‑1 (MQ=255) tGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAATATTCACGCCCAg > 1:1072997/1‑140 (MQ=255) ccAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAATATTCACGCCCAGGTTACgg > 1:982372/1‑140 (MQ=255) aGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAATATTCACGCCCAGGTTACGgcg > 2:1719960/1‑140 (MQ=255) gTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCATCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAATATTCACGCCCAGGTTACGgcgc > 1:1060813/1‑140 (MQ=255) gTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAATATTCACGCCCAGGTTACGgcgc > 2:1717958/1‑140 (MQ=255) gTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAATATTCACGCCCAGGTTACGgcgc > 1:970445/1‑140 (MQ=255) gTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAATATTCACGCCCAGGTTACGgcgc > 1:970440/1‑140 (MQ=255) gTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAATATTCACGCCCAGGTTACGgcgc > 1:1061897/1‑140 (MQ=255) gTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAATATTCACGCCCAGGTTACGgcgc > 2:916772/1‑140 (MQ=255) gTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAATATTCACGCCCAGGTTACGgcgc > 2:961188/1‑140 (MQ=255) gTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGGTGGTAACGGTAATATTCACGCCCAGGTTACGgcgc > 2:1519220/1‑140 (MQ=255) tCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAATATTCACGCCCAGGTTACGGCGCa > 2:1677666/1‑140 (MQ=255) cAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAATATTCACGCCCAGGTTACGGCGCAGCTGGACt > 1:918876/1‑140 (MQ=255) gCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAATATTCACGCCCAGGTTACGGCGCAGCTGGACTTc > 2:1693445/1‑140 (MQ=255) gCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAATATTCACGCCCAGGTTACGGCGCAGCTGGACTTc > 2:1603989/1‑140 (MQ=255) gCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAATATTCACGCCCAGGTTACGGCGCAGCTGGACTTc > 1:1294169/1‑140 (MQ=255) gCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAATATTCACGCCCAGGTTACGGCGCAGCTGGACTTc > 1:1294075/1‑140 (MQ=255) gCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAATATTCACGCCAAGGTTACGGCGCAGCTGGACTTc > 1:1282119/1‑140 (MQ=255) | TTACCCGGCCGCGCACTCGATGAAGGGCAAATTAGCGCCATTGTGCATCTGGTTTCCAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTGTTAACCCAGTCCAATACCAGCGGGCGCGATCTTAATGACGCTCAGTTGAAATATGCCAGCGATGTCGAAGGCCGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTAACGGTAATATTCACGCCCAGGTTACGGCGCAGCTGGACTTC > NC_000913/2013760‑2014035 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |