| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,449,960 | G→T | 6.2% | R92S (CGT→AGT) | rplV ← | 50S ribosomal subunit protein L22 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,449,960 | 0 | G | T | 6.2% | 354.3 / 6.8 | 96 | R92S (CGT→AGT) | rplV | 50S ribosomal subunit protein L22 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/52); new base T (3/3); total (41/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.34e-01 | |||||||||||
GTAGAGTTCCATGGTTTTACAATACCCAGGCGAATACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGTTCAGCGTTAGCAATGGCAGATTCCAGAACTTTCTTGAC > NC_000913/3449822‑3450095 | gTAGAGTTCCATGGTTTTACAATACCCAGGCGAATACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGa > 1:785420/1‑140 (MQ=255)gTAGAGTTCCATGGTTTTACAATACCCAGGCGAATACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGa > 1:784414/1‑140 (MQ=255) gTTCCATGGTTTTACAATACCCAGGCGAATACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCttt > 1:1706696/1‑140 (MQ=255) gTTCCATGGTTTTACAATACCCAGGCGAATACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCttt > 1:1705443/1‑140 (MQ=255) cATGGTTTTACAATACCCAGGCGAATACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCa < 2:1379636/140‑1 (MQ=255) aTGGTTTTACAATACCCAGGCGAATACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCAc > 1:503921/1‑140 (MQ=255) aTGGTTTTACAATACCCAGGCGAATACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCAc < 2:718259/140‑1 (MQ=255) aTGGTTTTACAATACCCAGGCGAATACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCAc > 1:220528/1‑140 (MQ=255) tGGTTTTACAATACCCAGGCGAATACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCAcg < 1:120993/140‑1 (MQ=255) tGGTTTTACAATACCCAGGCGAATACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCAcg < 1:1245782/140‑1 (MQ=255) tGGTTTTACAATACCCAGGCGAATACCATTAGGAGGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGTGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCAcg < 1:686592/140‑1 (MQ=255) gTTTTACAATACCCAGGCGAATACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCAcgcg < 1:839224/140‑1 (MQ=255) ccaTACCCCGGCGAATACCACTAGGCTGAACTTTCTGCCCCATTGCCAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGTTGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATaa < 2:21188/138‑1 (MQ=255) cccAGGCGAATACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATgcgc > 2:558023/1‑140 (MQ=255) cccAGGCGAATACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATgcgc > 1:13502/1‑140 (MQ=255) cccAGGCGAATACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATgcgc > 2:560175/1‑140 (MQ=255) cccAGGCGAATACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATgcgc > 1:1094629/1‑140 (MQ=255) ccAGGCGAATACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCt < 2:1642409/140‑1 (MQ=255) ggCGAATACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCa < 2:1566018/140‑1 (MQ=255) gCGAATACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCAt > 2:1817740/1‑140 (MQ=255) aaTACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCt > 1:895028/1‑140 (MQ=255) aaTACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCt > 1:895220/1‑140 (MQ=255) aaTACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCt > 1:114615/1‑140 (MQ=255) aTACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTc < 1:10611/140‑1 (MQ=255) aTACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTc > 1:1539945/1‑140 (MQ=255) tACCATTAGGATGTCCTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGTTCGGACTCAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCCCGTCCTTTTGCTCGCGGCAGAATGCGCTTCATGcgcg > 2:1683233/1‑140 (MQ=255) tACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCg > 2:1405522/1‑140 (MQ=255) tACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTAc > 1:1472743/1‑140 (MQ=255) tACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCAGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCATCGTCTAc > 2:589397/1‑140 (MQ=255) tACCTTCTTACCCATTGCTAGTCACCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTTGCTGGTGCGCTTAAGGATGCGATCTGCACGACCGTGTGCACGCCGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCGACGTCTAc > 2:589396/1‑140 (MQ=255) tCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGaaaa > 1:871486/1‑140 (MQ=255) tCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGaaaa > 1:1708188/1‑140 (MQ=255) tCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGaaaa > 1:1708285/1‑140 (MQ=255) tCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGaaaa > 2:503121/1‑140 (MQ=255) tCTGACCCATTGCTACACTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGAGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTATGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGaaaa > 1:770149/1‑140 (MQ=255) gACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTTCGCTTCAGGATGCGATCTGCACTACCTTTTGCATGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAAttt > 2:1263662/1‑140 (MQ=255) gACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTTCGCTTCAGGATGCGATCTGCACTACCTTTTGCATGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAAttt > 2:1263678/1‑140 (MQ=255) gACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCCCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTTCGCTTCAGGATGCGATCTGCACTACCTTTTGCATGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAAttt > 2:1264501/1‑140 (MQ=255) cATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGt < 1:272669/140‑1 (MQ=255) cATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGt < 1:1817740/140‑1 (MQ=255) tGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAAc > 1:1411564/1‑140 (MQ=255) gTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCa > 2:962488/1‑140 (MQ=255) ctcCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGa < 1:1010476/140‑1 (MQ=255) ctcCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGa < 1:1395457/140‑1 (MQ=255) ctcCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGa < 1:661888/140‑1 (MQ=255) gagTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTTCGCTTCAGGATGCGATCTGCACTACCTTTTGCATGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTc < 1:1263662/140‑1 (MQ=255) gagTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTTCGCTTCAGGATGCGATCTGCACTACCTTTTGCATGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTc < 1:1263678/140‑1 (MQ=255) gagTCCCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTTCGCTTCAGGATGCGATCTGCACTACCTTTTGCATGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTc < 1:1264501/140‑1 (MQ=255) agTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCa < 2:936611/140‑1 (MQ=255) agTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCa < 2:503865/140‑1 (MQ=255) tctcAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAAt > 1:60921/1‑140 (MQ=255) tcAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTACATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGAAACTGTCAGATCGTCAATGt > 2:649278/1‑140 (MQ=255) ccgCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGTCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTc < 2:1381147/138‑1 (MQ=255) cAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTc > 2:674774/1‑140 (MQ=255) gCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAg < 1:1440941/140‑1 (MQ=255) gCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAg < 1:1440969/140‑1 (MQ=255) gCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAg < 1:1546938/140‑1 (MQ=255) aTCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAgcgc < 1:482226/140‑1 (MQ=255) cGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCa < 1:346909/140‑1 (MQ=255) cGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCa < 1:346768/140‑1 (MQ=255) cGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCa < 1:756252/140‑1 (MQ=255) cGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGAGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTAAATGTCAGCGCCa < 1:1080046/140‑1 (MQ=255) cacaACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGt < 1:245415/140‑1 (MQ=255) acaACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGAAGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGtt < 2:1660759/140‑1 (MQ=255) caACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTtg < 2:1077498/140‑1 (MQ=255) aCCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTtgtg > 1:762729/1‑140 (MQ=255) cacaGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGtt < 2:762729/140‑1 (MQ=255) cacaGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGtt < 1:63849/140‑1 (MQ=255) cacaGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGtt < 1:92280/140‑1 (MQ=255) cacaGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGtt < 1:1465104/140‑1 (MQ=255) aGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGTTCAg > 1:664098/1‑140 (MQ=255) tGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGTTCAGCg < 2:789702/140‑1 (MQ=255) aTGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCCATGTCAGCGCCATCGTTGTGTTCAGCGtt > 2:852735/1‑140 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2:1378233/140‑1 (MQ=255) ggCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGTTCAGCGTTAGCa < 2:1418795/140‑1 (MQ=255) tGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGTTCAGCGTTAGCAATGGCa > 2:45013/1‑140 (MQ=255) ttCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCTTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGTTCAGCGTTAGCAATGGCAGATTc > 1:648165/1‑140 (MQ=255) ggATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGTTCAGCGTTAGCAATGGCAGATTCCAGa < 1:190798/140‑1 (MQ=255) gATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGTTCAGCGTTAGCAATGGCAGATTCCAGaa < 2:555506/140‑1 (MQ=255) gATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGTTCAGCGTTAGCAATGGCAGATTCCAGaa < 1:871204/140‑1 (MQ=255) gATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGTTCAGCGTTAGCAATGGCAGATTCCAGaa < 1:279285/140‑1 (MQ=255) cGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGTTCAGCGTTAGCAATGGCAGATTCCAGAACttt > 2:1353460/1‑140 (MQ=255) cGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGTTCAGCGTTAGCAATGGCAGATTCCAGAACttt > 2:1118088/1‑140 (MQ=255) gATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGTTCAGCGTTAGCAATGGCAGATTCCAGAACTTTc < 1:920707/140‑1 (MQ=255) gATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGTTCAGCGTTAGCAATGGCAGATTCCAGAACTTTc < 1:530863/140‑1 (MQ=255) gATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGAGCTTCATGGTCGGGACTTCGTCTACGATAATTTTCGTAACTTTCAGATAGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGTTCAGCTTTAGCTATGGCAGATTCCAGAACTTTc < 1:18768/140‑1 (MQ=255) gCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGTTCAGCGTTAGCAATGGCAGATTCCAGAACTTTCTTGAc < 1:760974/140‑1 (MQ=255) gCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGTTCAGCGTTAGCAATGGCAGATTCCAGAACTTTCTTGAc < 2:959057/140‑1 (MQ=255) gCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGTTCAGCGTTAGCAATGGCAGATTCCAGAACTTTCTTGAc < 2:959034/140‑1 (MQ=255) gCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGTTCAGCGTTAGCAATGGCAGATTCCAGAACTTTCTTGAc < 1:863465/140‑1 (MQ=255) gCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTACATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTATCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGTTCAGCGTTAGCAATGGCAGATTCCAGAACTTTCTTGAc < 2:959146/140‑1 (MQ=255) | GTAGAGTTCCATGGTTTTACAATACCCAGGCGAATACCATTAGGATGTACTTTCTGACCCATTGCTAGTCTCCAGAGTCTCAGCGATCGGACACAACCACAGTGATGTGGCTGGTGCGCTTCAGGATGCGATCTGCACGACCTTTTGCACGCGGCATAATGCGCTTCATGCTCGGGCCTTCGTCTACGAAAATTTTCGTAACTTTCAGATCGTCAATGTCAGCGCCATCGTTGTGTTCAGCGTTAGCAATGGCAGATTCCAGAACTTTCTTGAC > NC_000913/3449822‑3450095 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |