Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,894,980 | C→A | 7.8% | P110Q (CCG→CAG) | chrR → | chromate reductase, Class I, flavoprotein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,894,980 | 0 | C | A | 7.8% | 262.7 / 7.4 | 77 | P110Q (CCG→CAG) | chrR | chromate reductase, Class I, flavoprotein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/33); new base A (3/3); total (41/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 |
GAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTT > NC_000913/3894841‑3895119 | gAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAAcc < 2:129110/140‑1 (MQ=255) ctctGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTa < 2:311750/140‑1 (MQ=255) ccctGGCGTAAGAGATCCGTCAGGCTTACGGTGTGGTGATCCTCACGCCGGAAGATAACCACTCGGTTCCGGGTGGCCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGAACAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTa < 2:39856/138‑1 (MQ=255) tctGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTAt < 1:876014/140‑1 (MQ=255) tctGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTAt < 1:876397/140‑1 (MQ=255) tctGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTAt < 2:1553651/140‑1 (MQ=255) cGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGAtt < 2:598710/140‑1 (MQ=255) cGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGAtt < 1:1715084/140‑1 (MQ=255) cAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGAc < 1:183837/140‑1 (MQ=255) tCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCaa > 1:518308/1‑140 (MQ=255) tCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCaa > 2:417676/1‑140 (MQ=255) tCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCaa > 2:417687/1‑140 (MQ=255) tCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCaa > 1:1287499/1‑140 (MQ=255) ggCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATTTAACGTCTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATgg < 2:377840/140‑1 (MQ=255) ggCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATgg < 2:647276/140‑1 (MQ=255) ggCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATgg < 2:1107765/140‑1 (MQ=255) ggCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACAGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATgg > 1:213355/1‑140 (MQ=255) ggCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACAGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATgg > 1:304159/1‑140 (MQ=255) ggCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACAGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATgg > 1:394482/1‑140 (MQ=255) cTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGc > 2:1013339/1‑140 (MQ=255) aCGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTg > 2:756981/1‑140 (MQ=255) cGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGgcgcgc < 2:712008/140‑1 (MQ=255) cGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGgcgcgc > 2:925350/1‑140 (MQ=255) gTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGgcgcgcg < 2:1667867/140‑1 (MQ=255) gTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGgcgcgcg < 1:42933/140‑1 (MQ=255) gTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGgcgcgcg < 1:1114517/140‑1 (MQ=255) gTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGgcgcgcg < 1:42703/140‑1 (MQ=255) gTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGgcgcgcg > 2:277474/1‑140 (MQ=255) gTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGgcgcgcg < 1:42783/140‑1 (MQ=255) gTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGgcgcgcg > 1:176701/1‑140 (MQ=255) gTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGgcgcgcg < 1:42910/140‑1 (MQ=255) cACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCt < 2:1509671/140‑1 (MQ=255) cACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCt < 2:907817/140‑1 (MQ=255) cACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCt > 1:601955/1‑140 (MQ=255) cACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCt > 1:468728/1‑140 (MQ=255) aaCTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCt > 1:1649020/1‑140 (MQ=255) tactCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATAGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTgcg < 2:1658528/140‑1 (MQ=255) ctCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAGTGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGcc > 2:33789/1‑140 (MQ=255) ctCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGcc > 2:20286/1‑140 (MQ=255) ctCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGcc > 2:1593755/1‑140 (MQ=255) ctCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGcc > 1:51481/1‑140 (MQ=255) ctCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGcc > 1:769057/1‑140 (MQ=255) tCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCa > 2:1190947/1‑140 (MQ=255) tACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGAtt > 1:411490/1‑140 (MQ=255) cGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTg > 2:1354850/1‑140 (MQ=255) ggTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGt > 2:1802385/1‑140 (MQ=255) ggTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGGGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGt > 2:11926/1‑140 (MQ=255) ggTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGAGTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGt > 2:1802313/1‑140 (MQ=255) gCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTcc > 2:5880/1‑140 (MQ=255) gCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTcc > 2:6018/1‑140 (MQ=255) gCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTcc > 1:974158/1‑140 (MQ=255) gAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCg > 2:495596/1‑140 (MQ=255) gAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCg > 1:793637/1‑140 (MQ=255) gAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCg > 1:702297/1‑140 (MQ=255) aaaTGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATg > 1:1452163/1‑140 (MQ=255) aaaTGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATg > 2:1424799/1‑140 (MQ=255) tGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCaa < 1:1285221/140‑1 (MQ=255) tGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCaa < 1:1825805/140‑1 (MQ=255) tGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCaa > 2:491202/1‑140 (MQ=255) tGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGACAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCaa < 1:1881414/140‑1 (MQ=255) tGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGAACAACCGATGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCaa < 1:1880555/140‑1 (MQ=255) tCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGtg > 1:1590342/1‑140 (MQ=255) cTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACaa > 2:199346/1‑140 (MQ=255) ttCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGc < 2:1870817/140‑1 (MQ=255) ttCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGc < 2:1869569/140‑1 (MQ=255) ccGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCgg < 2:727875/140‑1 (MQ=255) ccGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCgg < 2:576438/140‑1 (MQ=255) cTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAAtt > 2:1291805/1‑140 (MQ=255) aCCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGgcggcg < 1:558566/140‑1 (MQ=255) tGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGAtt < 1:1734957/140‑1 (MQ=255) tGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGAtt < 2:1647229/140‑1 (MQ=255) tGGCCGGTAAACCGGTATTGAGTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGAtt < 2:483699/140‑1 (MQ=255) tGGCCGGTAAACAGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGAtt < 2:394482/140‑1 (MQ=255) tGGCCGGTAAACAGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGAtt < 2:304159/140‑1 (MQ=255) tGGCCGGTAAACAGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGAtt < 2:213355/140‑1 (MQ=255) gCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCa > 1:355742/1‑140 (MQ=255) tAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACa > 1:1460708/1‑140 (MQ=255) aCCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAg > 2:1883709/1‑140 (MQ=255) cGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGtt > 1:804110/1‑140 (MQ=255) | GAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTT > NC_000913/3894841‑3895119 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |