| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 4427 | 134 (0.820) | 8 (0.050) | 3/264 | NT | 6.0% | coding (694/1287 nt) | thrC | L‑threonine synthase |
| ? | NC_000913 | = 4443 | 122 (0.790) | coding (710/1287 nt) | thrC | L‑threonine synthase | |||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
TCGACGGCGATTTCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATACCGTGCCACG > NC_000913/4278‑4575 | cGGCGATTTCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCt < 1:763402/150‑1 (MQ=255) ggCGATTTCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTg > 2:373236/1‑150 (MQ=255) ggCGATTTCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTg > 2:1762609/1‑150 (MQ=255) gCGATTTCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGc > 1:1209419/1‑150 (MQ=255) ttCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCgtctcctgcgg < 1:2455509‑M1/150‑12 (MQ=255) ttCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCgtctcctgcgg < 1:2297356‑M1/150‑12 (MQ=255) ttCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCgtctcctgcgg < 1:1420442‑M1/150‑12 (MQ=255) ttCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGAAGGAGTTTGATTATGAAGAACTGAAAGTGGCGATAGGGTTATACTCGGATAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCttctcctgcgg < 1:319556‑M1/150‑12 (MQ=255) tCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAgg < 1:193040/150‑1 (MQ=255) gATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGgag > 2:1722949/1‑150 (MQ=255) gATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGgag > 2:2432022/1‑150 (MQ=255) ccggTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGCAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATGTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGAcgc < 2:34369/147‑1 (MQ=255) ccTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACgc > 2:2624259‑M2/1‑148 (MQ=255) ccTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACgc > 1:1569119‑M2/1‑148 (MQ=255) tGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACgcgc < 2:2500953‑M2/150‑5 (MQ=255) tGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACgcgc < 2:844268‑M2/150‑5 (MQ=255) gcgcTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAg > 1:1498240/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAg > 1:2525018/1‑150 (MQ=255) tGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTgg < 1:266205/150‑1 (MQ=255) gTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAAATCGGCTAACACGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTAATTTGAATCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGtt > 1:2657240/1‑150 (MQ=255) aaGCAGGCGTTTGTTGATGAATAACTGATAGGGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTgcg < 1:2374198/150‑3 (MQ=255) aaGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTTGGGTTAAACTCGTCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGTAGCTGTTGCGCTGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTgcg < 1:1184637/150‑3 (MQ=255) cAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCg > 2:1753623/1‑150 (MQ=255) 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aGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCgg < 2:1066569/150‑1 (MQ=255) aGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCgg < 2:745941/150‑1 (MQ=255) aGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCgg < 1:463255/150‑1 (MQ=255) gCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTg > 2:1295376/1‑150 (MQ=255) tttGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCa < 1:252489/150‑1 (MQ=255) atgatgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCg > 2:1625687/1‑150 (MQ=255) atgatgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCg > 2:309787/1‑150 (MQ=255) gatgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGa > 1:664930/1‑150 (MQ=255) atgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGaa > 1:1106883/1‑150 (MQ=255) tgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGaaa < 1:508042/150‑1 (MQ=255) 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tactacTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACAAAc > 1:1384466/1‑150 (MQ=255) tactTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTg > 1:638747/1‑150 (MQ=255) tactTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTg > 1:885355/1‑150 (MQ=255) ttGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACg > 2:601545/1‑150 (MQ=255) aaGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATa > 2:1607998/1‑150 (MQ=255) aaGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATa > 1:2122942/1‑150 (MQ=255) aaGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATa > 2:2371585/1‑150 (MQ=255) cTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACgcgcaacagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaac < 1:591970‑M2/99‑75 (MQ=255) tGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGaaa > 1:2537360/1‑115 (MQ=255) tGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGaaa < 2:2537360/115‑1 (MQ=255) tGCGCgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaaccctagcgccactttcagttcttcatcatcaaacgcctgcttcaccagcgcctgac < 2:1291581‑M1/150‑146 (MQ=255) tGCGCgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaaccctagcgccactttcagttcttcatcatcaaacgcctgcttcaccagcgcctgac < 2:1146837‑M1/150‑146 (MQ=255) gcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaaccctagcgccactttcagttcttcatcatcaaacgcctgcttcaccagcgcctgaca < 2:2410404‑M1/150‑147 (MQ=255) gcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaaccctagcgccactttcagttcttcatcatcaaacgcctgcttcaccagcgcctgaca < 2:2500953‑M1/150‑147 (MQ=255) gcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttaaaagtagtagcaactctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaaccctagcgccactttcagttcttcatcatcaaacgcctgcttcaccagcgcctgaca < 2:1119926‑M1/150‑147 (MQ=255) gcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaaccctagcgccactttcagttcttcatcatcaaacgcctgcttcaccagcgcctgacagg > 2:1515706‑M1/1‑2 (MQ=255) gcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaaccctagcgccactttcagttcttcatcatcaaacgcctgcttcaccagcgcctgacagg > 1:1569119‑M1/1‑2 (MQ=255) gcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaaccctagcgccactttcagttcttcatcatcaaacgcctgcttcaccagcgcctgacagg > 2:2624259‑M1/1‑2 (MQ=255) gcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgaggtagccgagtttaaccctagcgccactttcagttcttcatcatcaaacgcctgcttcaccagcgcctgacagg > 2:34373‑M1/1‑2 (MQ=255) gcAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATACCGTGCCACg > 2:113066/1‑150 (MQ=255) | TCGACGGCGATTTCGATGCCTGTCAGGCGCTGGTGAAGCAGGCGTTTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCGACCAACGTGAACGATACCGTGCCACG > NC_000913/4278‑4575 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |