| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2877791 | 196 (1.200) | 5 (0.040) | 5/242 | NT | 2.5% | intergenic (+173/+778) | iap/ygbF | aminopeptidase in alkaline phosphatase isozyme conversion/CRISPR adaptation ssRNA endonuclease |
| ? | NC_000913 | 2878097 = | 219 (1.550) | intergenic (+479/+472) | iap/ygbF | aminopeptidase in alkaline phosphatase isozyme conversion/CRISPR adaptation ssRNA endonuclease | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
TTCTACCGCAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGC > NC_000913/2877644‑2877940 | tACCGCAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGtt > 2:482696/1‑150 (MQ=255) cGCAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAg < 1:1085898/150‑1 (MQ=255) cGCAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAg < 1:2267077/150‑1 (MQ=255) agagGCGGGGGACCTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCg > 2:454240/1‑150 (MQ=255) agagGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCg > 2:1815639/1‑150 (MQ=255) agagGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCg > 2:2214613/1‑150 (MQ=255) tCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGACCTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCt > 2:955041/1‑150 (MQ=255) tCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGACCTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCt > 2:2364388/1‑150 (MQ=255) cAAGTGATCTCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGGTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTAc > 1:617786/1‑150 (MQ=255) aGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCg < 2:1238476/150‑1 (MQ=255) aGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCg < 2:1515020/150‑1 (MQ=255) tGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCggg < 1:1141375/150‑1 (MQ=255) tatCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCgg < 2:633225/150‑1 (MQ=255) tatCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCgg < 2:1166560/150‑1 (MQ=255) tatCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCgg < 2:1266147/150‑1 (MQ=255) tatCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCgg < 2:1762535/150‑1 (MQ=255) tatCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCgg < 2:2323488/150‑1 (MQ=255) tatCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCgg < 1:1261707/150‑1 (MQ=255) 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ccGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAAc > 2:2059282/1‑150 (MQ=255) ccGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACAGGGCGGTTTATACCCGCTAACGCGGGGAAc > 1:1070926/1‑150 (MQ=255) ccGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAAACTGTATACCTGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAAc > 2:1475332/1‑150 (MQ=255) tttATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGt < 2:2697800/150‑1 (MQ=255) ttATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTa < 1:992737/150‑1 (MQ=255) 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ttATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCg < 2:1294357/150‑1 (MQ=255) tATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGGGGGGAACTCCCgg < 1:528988/150‑1 (MQ=255) tATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCgg < 2:22913/150‑1 (MQ=255) tATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCgg < 2:1543459/150‑1 (MQ=255) tATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGATAACGCGGGTAACTCGTAGTCAATCATTCCACCTATGTCTTAACTCCCGTTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCgg < 1:2388524/150‑1 (MQ=255) 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ggggAACTCTagtttccgtatctccggatttataaagctgacggtttatccccgctggcgcggggaactcgcaggcggcgacgcgcagggtatgcgcgattcgcggtttatccccgctggcgcggggaactcgcgaccgctcagaaattc < 2:884991‑M1/150‑141 (MQ=255) ggAACTCTagtttccgtatctccggatttataacgctgagggtttatccccgcgggcgcggggaactcaccggcggcgacgcgctgggtatgcgcgtttgggggtttatccccgctggcgcggggaactcgcgaccgctcagaaattcca < 1:1024723‑M1/150‑143 (MQ=255) ggAACTCTagtttccgtatctccggatttataaagctgacggtttatccccgctggcgcggggaactcgcaggcggcgacgcgcagggtttgcgcgtttcgcggtttatccccgctggcgcggggaactcgcgaccgctcagaaattcca < 1:1588101‑M1/150‑143 (MQ=255) ggAACTCTagtttccgtatctccggatttataaagctgacggtttatccccgctggcgcggggaactcgcaggcggcgacgcgcagggtatgcgcgattcgcggtttatccccgctggcgcggggaactcgcgaccgctcagaaattcca > 1:2599339‑M1/1‑8 (MQ=255) aCTCTagtttccgtatctccggatttataaagctgacggtttatccccgctggcgcggggaactcgcaggcggcgacgcgcagggtatgcgcgattcgcggtttatccccgctggcgcggggaactcgcgaccgctcagaaattccagac < 2:2518534‑M1/150‑146 (MQ=255) aCTCTagtttccgtatctccggatttataaagctgacggtttatccccgctggcgcggggaactcgcaggcggcgacgcgcagggtatgcgcgattcgcggtttatccccgctggcgcggggaactcgcgaccgctcagaaattccagac < 2:738081‑M1/150‑146 (MQ=255) aCTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCAt < 1:1575732/150‑1 (MQ=255) tctcGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATgc > 1:1815160/1‑150 (MQ=255) tctcGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATgc > 1:390822/1‑150 (MQ=255) tctcGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATgc > 1:2429519/1‑150 (MQ=255) tagtttccgtatctccggatttataaagctgacggtttatccccgctggcgcggggaactcgcaggcggcgacgcgcagggtatgcgcgattcgcggatgatccccgctcgcgcggggacctcgcgaccgcgcagaaagtccagacccga > 1:1286557‑M1/1‑1 (MQ=255) | TTCTACCGCAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGCTACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGC > NC_000913/2877644‑2877940 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |