| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,577,333 | C→A | 6.6% | C209F (TGC→TTC) | mcrC ← | 5‑methylcytosine‑specific restriction enzyme McrBC, subunit McrC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,577,333 | 0 | C | A | 6.6% | 552.5 / 17.2 | 153 | C209F (TGC→TTC) | mcrC | 5‑methylcytosine‑specific restriction enzyme McrBC, subunit McrC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (74/68); new base A (9/2); total (83/70) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.63e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
CAACGATAAGTATTTTTTCTGATGAGCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGACACTGATAACGAATTTATAATAACGC > NC_000913/4577190‑4577482 | cAACGATAAGTATTTTTTCTGATGAGCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAAtt < 1:1116115/150‑1 (MQ=255)cAACGATAAGTATTTTTTCTGATGAGCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAAtt < 1:724888/150‑1 (MQ=255) cGATAAGTATTTTTTCTGATGAGCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCAt > 2:331109/1‑150 (MQ=255) gATAAGTATTTTTTCTGATGAGCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATa > 2:1725616/1‑150 (MQ=255) gATAAGTATTTTTTCTGATGAGCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATa > 1:2167990/1‑150 (MQ=255) aTAAGTATTTTTTCTGATGAGCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATaa > 1:1094048/1‑150 (MQ=255) aTAAGTATTTTTTCTGATGAGCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATaa > 1:1932908/1‑150 (MQ=255) gTATTTTTTCTGATGAGCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGaa < 1:1856658/150‑1 (MQ=255) tttCTGATGAGCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACtttt < 2:1214343/150‑1 (MQ=255) ttCTGATGAGCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTg < 1:2325645/150‑1 (MQ=255) atgaGCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATaaa < 1:339131/150‑1 (MQ=255) tgaGCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAg < 2:2172117/150‑1 (MQ=255) gaGCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGt > 1:140525/1‑150 (MQ=255) gaGCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGt > 1:1310375/1‑150 (MQ=255) gaGCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGt > 1:2109206/1‑150 (MQ=255) gaGCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGt > 2:2588206/1‑150 (MQ=255) aGCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTa > 2:672193/1‑150 (MQ=255) aGCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTa > 2:162494/1‑150 (MQ=255) aGCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTa > 2:162565/1‑150 (MQ=255) aGCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTa > 2:455830/1‑150 (MQ=255) gCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTaa > 1:1226491/1‑150 (MQ=255) cGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAAt > 1:122382/1‑150 (MQ=255) aaTGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGa < 1:1512883/150‑1 (MQ=255) aGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTc > 1:2251960/1‑150 (MQ=255) tttCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGt < 2:274083/150‑1 (MQ=255) tttCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGt < 2:1176816/150‑1 (MQ=255) ttCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGtttcttt < 2:1959607/150‑1 (MQ=255) ttCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGtttcttt < 1:316879/150‑1 (MQ=255) ttCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGtttcttt < 2:1930272/150‑1 (MQ=255) ttCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGtttcttt < 2:2280550/150‑1 (MQ=255) gTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAAt > 1:790363/1‑150 (MQ=255) gTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAAt > 1:2451684/1‑150 (MQ=255) gTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAAt > 1:1678854/1‑150 (MQ=255) gTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAAt > 1:2106445/1‑150 (MQ=255) gTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGAAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAAt > 2:2496959/1‑150 (MQ=255) gTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGAAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAAt > 2:1762291/1‑150 (MQ=255) gTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGAAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAAt > 2:20874/1‑150 (MQ=255) gTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGAAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAAt > 2:667948/1‑150 (MQ=255) gTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGAAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAAt > 2:1002537/1‑150 (MQ=255) gTAACAAATTAAGAGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGAAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAAt > 2:2496907/1‑150 (MQ=255) aCAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGTGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCAt < 1:1428892/150‑1 (MQ=255) aCAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCAt < 1:34380/150‑1 (MQ=255) aCAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCAt < 2:622809/150‑1 (MQ=255) aCAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCAt < 2:239430/150‑1 (MQ=255) cAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATa > 1:1660322/1‑150 (MQ=255) aaGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACg < 1:1780035/150‑1 (MQ=255) tGACTGATCCGATATACTCGATGGATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTa < 2:492263/150‑1 (MQ=255) tGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTa < 1:185152/150‑1 (MQ=255) tGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTa < 1:2695185/150‑1 (MQ=255) tGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAgtgt > 1:545386/1‑150 (MQ=255) tGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAgtgt > 1:792598/1‑150 (MQ=255) tGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAgtgt > 1:738746/1‑150 (MQ=255) gATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTc < 2:400078/150‑1 (MQ=255) atatACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGt > 2:249021/1‑150 (MQ=255) atatACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGt > 2:1278621/1‑150 (MQ=255) ataCTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGttt < 2:2701925/150‑1 (MQ=255) ataCTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGttt < 2:2701933/150‑1 (MQ=255) ataCTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGttt < 2:781702/150‑1 (MQ=255) taCTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGtttt < 1:575578/150‑1 (MQ=255) cTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGa < 2:608212/150‑1 (MQ=255) atccctCCCATATTAAATACGACCGGGTGGTGCTCGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATCCATAAAGAAACATTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTg < 2:2170014/145‑1 (MQ=255) ccATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGa > 2:2546734/1‑150 (MQ=255) aTTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAat < 2:1355360/150‑1 (MQ=255) aTTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAat > 2:2405913/1‑150 (MQ=255) ttttAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAatt > 2:2302789/1‑150 (MQ=255) ttttAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAatt > 1:190463/1‑150 (MQ=255) ttttAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAatt > 1:2217393/1‑150 (MQ=255) ttttAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAatt > 1:2217398/1‑150 (MQ=255) ttttAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAatt < 1:331109/150‑1 (MQ=255) ttttAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATAATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGTCCTGGAATAGAatt > 1:2191437/1‑150 (MQ=255) ttAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAattat < 1:1083589/150‑1 (MQ=255) tAAATAAGAGCGTGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAattatt < 2:2567797/150‑1 (MQ=255) tAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTGTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAattatt < 2:1752896/150‑1 (MQ=255) aTAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGAc > 2:1935521/1‑150 (MQ=255) aTAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGAc < 1:1088990/150‑1 (MQ=255) aaGAGCGGGTTGTGTTGGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGa < 1:634951/150‑1 (MQ=255) agagCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGAt < 2:1249527/150‑1 (MQ=255) cgCGTGTTGTGTTTGGAGACTTTAATTCAAGTCGTAAAAATTCATAAAGTATGTTTTGATAATGTAATGACTTCTCTTTTTCGTTTCTTTCAATATCTTAGAAAAGGTATTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATTGAATTATTGACGATgt < 1:1694527/149‑2 (MQ=255) agCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGa < 2:546515/150‑1 (MQ=255) agCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGa < 2:834152/150‑1 (MQ=255) tttGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGaca > 2:912143/1‑150 (MQ=255) tttGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGaca > 2:320428/1‑150 (MQ=255) tttGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGaca > 2:226756/1‑150 (MQ=255) tttGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGaca > 2:1475106/1‑150 (MQ=255) tttGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGaca > 2:1032961/1‑150 (MQ=255) tttGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGAAGaaa > 1:2571770/1‑148 (MQ=255) tttGCAGACGTTAATACACGACGCAAAAATTCAAAAACAAACTATTGATAAACTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCATTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGaca < 1:2208671/150‑1 (MQ=255) cAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGACACTGa < 2:212981/150‑1 (MQ=255) cAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGACACTGa < 1:2624029/150‑1 (MQ=255) cAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGACACTGa < 1:2406663/150‑1 (MQ=255) gTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTCGTGTCCTTTGGTGTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGACCCTGATAACg > 2:344350/1‑150 (MQ=255) ttAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGACACTGATAACGa > 2:118130/1‑150 (MQ=255) ttAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGACACTGATAACGa > 1:928948/1‑150 (MQ=255) ttAAGTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGACACTGATAACGa < 1:530284/150‑1 (MQ=255) acgacgGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGACACTGATAACGAATTtata > 2:2585129/1‑150 (MQ=255) acgacgGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGACACTGATAACGAATTtata < 1:403848/150‑1 (MQ=255) gacgGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGACACTGATAACGAATTTataat > 2:1636756/1‑150 (MQ=255) cAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGACACTGATAACGAATTTATAATAAcgc > 1:1485723/1‑150 (MQ=255) cAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGACACTGATAACGAATTTATAATAAcgc > 1:1485736/1‑150 (MQ=255) cAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGACACTGATAACGAATTTATAATAAcgc > 1:531836/1‑150 (MQ=255) | CAACGATAAGTATTTTTTCTGATGAGCGAATGGTGATGTCAGTTTCCATTCGAGGTAACAAATTAAGTGACTGATCCGATATACTCGATGCATCCCATTTTAAATAAGAGCGGGTTGTGTTTGCAGACGTTAATTCACGACGGCAAAATTCATAAAGAAACTTTTGATAAAGTAATGACATCTCTTTTTCGTTTCTTTCAAAATCATAGAAACGGTAGTGTCCTTTGTTTTGACCTGGAATAGAATTATTGACGATGAATTTGCAGACACTGATAACGAATTTATAATAACGC > NC_000913/4577190‑4577482 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |