| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 1,500,679 | T→C | 5.3% | V36A (GTC→GCC) | tehA → | potassium‑tellurite ethidium and proflavin transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,500,679 | 0 | T | C | 5.3% | 640.6 / 17.9 | 190 | V36A (GTC→GCC) | tehA | potassium‑tellurite ethidium and proflavin transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (116/64); new base C (5/5); total (121/69) | |||||||||||
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Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
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tttGCCTGGCGCTATGCCAGCCAGGTTTGGCAGGTCAGCCACTGGTTAGGGGATGGGCTGGTGATTCTGGCGATGATCATCTGGGGATTATTGACTAGCGCATTTATTGCCCGACTCATACGCTTTCCGCATAGCGTGCTGGCGGAAGtt > 2:2196456/1‑150 (MQ=255) tttGCCTGGCGCTATGCCAGCCAGGTTTGGCAGGTCAGCCACTGGTTAGGGGATGGGCTGGTGATTCTGGCGATGATCATCTGGGGATTATTGACTAGCGCATTTATTGCCCGACTCATACGCTTTCCGCATAGCGTGCTGGCGGAAGtt > 2:2172666/1‑150 (MQ=255) tttGCCTGGCGCTATGCCAGCCAGGTTTGGCAGGTCAGCCACTGGTTAGGGGATGGGCTGGTGATTCTGGCGATGATCATCTGGGGATTATTGACTAGCGCATTTATTGCCCGACTCATACGCTTTCCGCATAGCGTGCTGGCGGAAGtt > 2:455569/1‑150 (MQ=255) tttGCCTGGCGCTATGCCAGCCAGGTTTGGCAGGTCAGCCACTGGTTAGGGGATGGGCTGGTGATTCTGGCGATGATCATCTGGGGATTATTGACTAGCGCATTTATTGCCCGACTCATACGCTTTCCGCATAGCGTGCTGGCGGAAGtt > 1:28494/1‑150 (MQ=255) tttGCCTGGCGCTATGCCAGCCAGGTTTGGCAGGTCAGCCACTGGTTAGGGGATGGGCTGGTGATTCTGGCGATGATCATCTGGGGATTATTGACTAGCGCATTTATTGCCCGACTCATACGCTTTCCGCATAGCGTGCTGGCGGAAGtt > 2:1739179/1‑150 (MQ=255) 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cTGGCGCTATGCCAGCCAGGTTGGGCAGGTCAGCCACTGGTTAGGGGATGGGCTGGTGATTCTGGCGATGATCATCTGGGGATTATTGACTAGCGCATTTATTGCCCGACTCATACGCTTTCCGCATAGCGTGCTGGCGGAAGTTCGCCa < 2:2128135/150‑1 (MQ=255) tATGCCAGCCAGGTTTGGCAGGTCAGCCACTGGTTAGGGGATGGGCTGGTGATTCTGGCGATGATCATCTGGGGATTATTGACTAGCGCATTTATTGCCCGACTCATACGCTTTCCGCATAGCGTGCTGGCGGAAGTTCGCCATCCAGTg > 2:789229/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCCAGGTTTGGCAGGTCAGCCACTGGTTAGGGGATGGGCTGGTGATTCTGGCGATGATCATCTGGGGATTATTGACTAGCGCATTTATTGCCCGACTCATACGCTTTCCGCATAGCGTGCTGGCGGAAGTTCGCCATCCAGTGCt > 2:1698142/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCCAGGTTTGGCAGGTCAGCCACTGGTTAGGGGATGGGCTGGTGATTCTGGCGATGATCATCTGGGGATTATTGACTAGCGCATTTATTGCCCGACTCATACGCTTTCCGCATAGCGTGCTGGCGGAAGTTCGCCATCCAGTGCt > 2:1661874/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCCAGGTTTGGCAGGTCAGCCACTGGTTAGGGGATGGGCTGGTGATTCTGGCGATGATCATCTGGGGATTATTGACTAGCGCATTTATTGCCCGACTCATACGCTTTCCGCATAGCGTGCTGGCGGAAGTTCGCCATCCAGTGCt > 2:1122178/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCCAGGTTTGGCAGGTCAGCCACTGGTTAGGGGATGGGCTGGTGATTCTGGCGATGATCATCTGGGGATTATTGACTAGCGCATTTATTGCCCGACTCATACGCTTTCCGCATAGCGTGCTGGCGGAAGTTCGCCATCCAGTGCt > 2:986910/1‑150 (MQ=255) agccagGTTTGGCAGGTCAGCCACTGGTTAGGGGATGGGCTGGTGATTCTGGCGATGATCATCT‑GGGATTATTGACTAGCGCATTTATTGCCCGACTCATACGCTTTCCGCATAGCGTGCTGGCGGAAGTTCGCCATCCAGTGCTGAGCa < 1:1229068/150‑1 (MQ=255) gTTTGGCAGGTCAGCCACTGGTTAGGGGATGGGCTGGTGATTCTGGCGATGATCATCTGGGGATTATTGACTAGCGCATTTATTGCCCGACTCATACGCTTTCCGCATAGCGTGCTGGCGGAAGTTCGCCATCCAGTGCTGAGCAGtttt > 2:182860/1‑150 (MQ=255) gTTTGGCAGGTCAGCCACTGGTTAGGGGATGGGCTGGTGATTCTGGCGATGATCATCTGGGGATTATTGACTAGCGCATTTATTGCCCGACTCATACGCTTTCCGCATAGCGTGCTGGCGGAAGTTCGCCATCCAGTGCTGAGCAGtttt > 2:138201/1‑150 (MQ=255) cAGGTCAGCCACTGGTTAGGGGATGGGCTGGTGATTCTGGCGATGATCATCTGGGGATTATTGACTAGCGCATTTATTGCCCGACTCATACGCTTTCCGCATAGCGTGCTGGCGGAAGTTCGCCATCCAGTGCTGAGCAGTTTTGTGAgt > 1:880809/1‑150 (MQ=255) tCAGCCACTGGTTAGGGGATGGGCTGGTGATTCTGGCGATGATCATCTGGGGATTATTGACTAGCGCATTTATTGCCCGACTCATACGCTTTCCGCATAGCGTGCTGGCGGAAGTTCGCCATCCAGTGCTGAGCAGTTTTGTGAgtttgt > 2:2543477/1‑150 (MQ=255) tCAGCCACTGGTTAGGGGATGGGCTGGTGATTCTGGCGATGATCATCTGGGGATTATTGACTAGCGCATTTATTGCCCGACTCATACGCTTTCCGCATAGCGTGCTGGCGGAAGTTCGCCATCCAGTGCTGAGCAGTTTTGTGAgtttgt > 2:626157/1‑150 (MQ=255) | TTCAAATATACTTTATAAATTAAACAAAATGAGTAAGAAGATGCAGAGCGATAAAGTGCTCAATTTGCCGGCAGGCTACTTTGGTATTGTGTTGGGGACGATAGGGATGGGATTTGCCTGGCGCTATGCCAGCCAGGTTTGGCAGGTCAGCCACTGGTTAGGGGATGGGCTGGTGATTCTGGCGATGATCATCTGGGGATTATTGACTAGCGCATTTATTGCCCGACTCATACGCTTTCCGCATAGCGTGCTGGCGGAAGTTCGCCATCCAGTGCTGAGCAGTTTTGTGAGTTTGT > NC_000913/1500533‑1500828 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |