| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,766,414 | 0 | G | A | 5.3% | 669.0 / 16.1 | 188 | R166Q (CGA→CAA) | rnlA | CP4‑57 prophage; RNase LS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (100/78); new base A (5/5); total (105/83) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.52e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.71e-01 | |||||||||||
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
TGAGCTATCAGCAGATGAATCGCATATAGAGTTCAGAGAACACTCTCGTAACGCTCATACCGTAGTGTGGAAAATTATTTCCACCAGCTATCAGGACGAATTGACTGTGAGCCTGCATATCACAACAGGTAAGCTCCAGATTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCGCACTTACTTGCAGACTG > NC_000913/2766265‑2766557 | tGAGCTATCAGCAGATGAATCGCATATAGAGTTCAGAGAACACTCTCGTAACGCTCATACCGTAGTGTGGAAAATTATATCCACCAGCTATCAGGACGAATTGACTGTGAGCCTGCATATCACAACAGGTAAGCTCCAGATTCAGGGCCg > 2:1859038/1‑150 (MQ=255) aTCAGCAGATGAATCGCATATAGAGTTCAGAGAACACTCTCGTAACGCTCATACCGTTGTGTGGAAAATTATTTCCACCAGCTATCAGGACGAATTGACTGTGAGCCTGCATATCACAACAGGTAAGCTCCAGATTCAGGGCCGACCGCt < 1:2419509/150‑1 (MQ=255) aTCAGCAGATGAATCGCATATAGAGTTCAGAGAACACTCTCGTAACGCTCATACCGTAGTGTGGAAAATTATTTCCACCAGCTATCAGGACGAATTGACTGTGAGCCTGCATATCACAACAGGTAAGCTCCAGATTCAGGGCCGACCGCt > 2:1092713/1‑150 (MQ=255) 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gATTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCGCACTTACTTGCa < 1:1572323/150‑1 (MQ=255) gATTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCGCACTTACTTGCa < 1:1112269/150‑1 (MQ=255) gATTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCGCACTTACTTGCa < 2:1288666/150‑1 (MQ=255) gATTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCGCACTTACTTGCa < 2:1334315/150‑1 (MQ=255) gATTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCGCACTTACTTGCa < 1:2116898/150‑1 (MQ=255) aTTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCGCACTTACTTGCAg > 1:246853/1‑150 (MQ=255) aTTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCGCACTTACTTGCAg > 1:727194/1‑150 (MQ=255) aTTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCGCACTTACTTGCAg > 1:727215/1‑150 (MQ=255) aTTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCGCACTTACTTGCAg > 1:254000/1‑150 (MQ=255) ttCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCATGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCGCACTTACTTGCAGa < 1:498286/150‑1 (MQ=255) ttCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCGCACTTACTTGCAGa < 2:2738094/150‑1 (MQ=255) ttCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCGCACTTACTTGCAGa < 1:897090/150‑1 (MQ=255) cAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCGCACTTACTTGCAGACt > 1:856405/1‑150 (MQ=255) cAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCGCACTTACTTGCAGACt < 1:840541/150‑1 (MQ=255) cAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCGCACTTACTTGCAGACt > 2:1096403/1‑150 (MQ=255) cAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCGCACTTACTTGCAGACt > 2:1738369/1‑150 (MQ=255) aGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCGCACTTACTTGCAGACTg < 2:1284538/150‑1 (MQ=255) | TGAGCTATCAGCAGATGAATCGCATATAGAGTTCAGAGAACACTCTCGTAACGCTCATACCGTAGTGTGGAAAATTATTTCCACCAGCTATCAGGACGAATTGACTGTGAGCCTGCATATCACAACAGGTAAGCTCCAGATTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCGCACTTACTTGCAGACTG > NC_000913/2766265‑2766557 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |