| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3304504 | NA (NA) | 5 (0.020) | 5/266 | NT | NA | noncoding (1/29 nt) | REP241 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP241 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 3304536 | NA (NA) | intergenic (+81/+37) | yhbW/mtr | putative luciferase‑like monooxygenase/tryptophan transporter of high affinity | |||||
AACCGACGCCGATGAGATTATGGTCAACGGGCAGATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTCGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3304350‑3304504‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctacaCAATGCCTGATGCGCTTCGCTTATCAGGTCTATGTAGGACAGCGTTGCCAGCTCGGATAAGGCTTCCCGCGTTAAGACACACTATCCCAACAACTCTTCCTTAACATCCATCGCCAGCTCAAACGAATGCAGCCGCGCCTGGTGGTCGA < NC_000913/3304536‑3304388 AACCGACGCCGATGAGATTATGGTCAACGGGCAGATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTCGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTC > 2:5757830/1‑150AACCGACGCCGATGAGATTATGGTCAACGGGCAGATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTCGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTC < 1:2403985/150‑1AACCGACGCCGATGAGATTATGGTCAACGGGCAGATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTCGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTC < 1:5506913/150‑1AACCGACGCCGATGAGATTATGGTCAACGGGCAGATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTCGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTC < 1:5291742/150‑1 ACCGACGCCGATGAGATTATGGTCAACGGGCAGATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTCGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCC < 2:2799472/150‑1 CCGACGCCGATGAGATTATGGTCAACGGGCAGATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTCGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCT > 1:1647169/1‑150 CCGACGCCGATGAGATTATGGTCAACGGGCAGATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTCGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCT > 2:5269328/1‑150 CCGACGCCGATGAGATTATGGTCAACGGGCAGATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTCGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCT < 2:1836931/150‑1 CCGACGCCGATGAGAGTATGGTCAACGGGCAGATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTCGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCT < 1:5184233/150‑1 CGACGCCGATGAGATTATGGTCAACGGGCAGATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTCGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGTGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCTA < 2:4621474/150‑1 GACGCCGATGAGATTATGGTCAACGGGCAGATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTCGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCTAC < 1:4069940/150‑1 GACGCCGATGAGATTATGGTCAACGGGCAGATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTCGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCTAC > 1:2969667/1‑150 GACGCCGATGAGATTATGGTCAACGGGCAGATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTCGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCTAC < 1:5788478/150‑1 cCGCCGATGAGATGATGGTCAACGGGCAGATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTCGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGTAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCTACA < 2:3011992/149‑1 ACGCCGATGAGATTATGGTCAACGGGCAGATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTCTTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCTACA < 1:3046189/150‑1 ACGCCGATGAGATTATGGTCAACGGGCAGATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTCGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCTACA < 2:5351912/150‑1 ACGCCGATGAGATTATGGTCAACGGGCAGATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTCGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCTACA < 2:5178317/150‑1 ACGCCGATGAGATTATGGTCAACGGGCAGATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTCGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCTACA < 2:3576735/150‑1 ACGCCGATGAGATTATGGTCAACGGGCAGATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTCGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCTACA < 2:2463846/150‑1 GCAGATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTAGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCTACACAATGCCTGATGCGCTTCGCTTATC < 2:2915347/150‑1 GATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTCGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCTACA‑TAGACCTGATGCGCTTCGCTTATCAGGT < 1:4248909/150‑1 ACCACCAGGCGCGGCTGCATTCGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCTACA‑TAGACCTGATGCGCTTCGCTTATCAGGTCTATGTAG < 1:4645935/150‑1 GTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCT > 1:3776110/1‑89 GTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCT < 2:3776110/89‑1 GCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCTACACAATGCCTGATGCGCTTCGCTTATCAGGTCTATGTAGGACAGC < 1:445248/81‑1 GCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCTACACAATGCCTGATGCGCTTCGCTTATCAGGTCTATGTAGGACAGC > 2:445248/1‑81 CCTACACAATGCCTGATGCGCTTCGCTTATCAGGTCTATGTAGGACAGCGTTGCCAGCTCGGATAAGGCTTCCCGCGTTAAGACACACTATCCCAACAACTCTTCCTTAACATCCATCGCCAGCTCAAACGAATGCAGCCGCGCCTGGTG > 2:298632/1‑150 CCTACACAATGCCTGATGCGCTTCGCTTATCAGGTCTATGTAGGACAGCGTTGCCAGCTCGGATAAGGCTTCCCGCGTTAAGACACACTATCCCAACAACTCTTCCTTAACATCCATCGCCAGCTCAAACGAATGCAGCCGCGCCTGGTG > 2:4373951/1‑150 CCTACACAATGCCTGATGCGCTTCGCTTATCAGGTCTATGTAGGACAGCGTTGCCAGCTCGGATAAGGCTTCCCGCGTTAAGACACACTATCCCAACAACTCTTCCTTAACATCCATCGCCAGCTCAAACGAATGCAGCCGCGCCTGGTG < 1:3786924/150‑1 CTACACAATGCCTGATGCGCTTCGCTTATCAGGTCTATGTAGGACAGCGTTGCCAGCTCGGCTACGGCTTCCCGCGTTAAGACACACTATCCCAACAACTCTTCCTTAACATCCATCGCCAGCTCAAACGAATGCAGCCGCGCCTGGTGG > 2:5238779/1‑150 CTACACAATGCCTGATGCGCTTCGCTTATCAGGTCTATGTAGGACAGCGTTGCCAGCTCGGATAAGGCTTCCCGCGTTAAGACACACTATCCCAACAACTCTTCCTTAACATCCATCGCCAGCTCAAACGAATGCAGCCGCGCCTGGTGG > 1:5253441/1‑150 CTACACAATGCCTGATGCGCTTCGCGTATCAGGTCTATGTAGGACCGCGTTGCCAGCTCGGATAAGGCTTCCCGCGTTAAGACACACTATCCCAACAACTCTTCCTTAACATCCATCGCCCGCTCAAACGAATGCAGCCGCGCCTGGTGG > 2:5238783/1‑150 TACACAATGCCTGATGCGCTTCGCTTATCAGGTCTATGTAGGACAGCGTTGCCAGCTCGGATAAGGCTTCCCGCGTTAAGACACACTATCCCAACAACTCTTCCTTAACATCCATCGCCAGCTCAAACGAATGCAGCCGCGCCTGGTGGT > 2:2011579/1‑150 TACACAATGCCTGATGCGCTTCGCTTATCAGGTCTATGTAGGACAGCGTTGCCAGCTCGGATAAGGCTTCCCGCGTTAAGACACACTATCCCAACAACTCTTCCTTAACATCCATCGCCAGCTCAAACGAATGCAGCCGCGCCTGGTGGT > 2:5140645/1‑150 TACACAATGCCTGATGCGCTTCGCTTATCAGGTCTATGTAGGACAGCGTTGCCAGCTCGGATAAGGCTTCCCGCGTTAAGACACACTATCCCAACAACTCTTCCTTAACATCCATCGCCAGCTCAAACGAATGCAGCCGCGCCTGGTGGT < 1:3180418/150‑1 ACACAATGCCTGATGCGCTTCGCTTATCAGGTCTATGTAGGACAGCGTTGCCAGCTCGGATAAGGCTTCCCGCGTTAAGACACACTATCCCAACAACTCTTCCTTAACATCCATCGCCAGCTCAAACGAATGCAGCCGCGCCTGGTGGTC < 2:2265045/150‑1 ACACAATGCCTGATGCGCTTCGCTTATCAGGTCTATGTAGGACAGCGTTGCCAGCTCGGATAAGGCTTCCCGCGTTAAGACACACTATCCCAACAACTCTTCCTTAACATCCATCGCCAGCTCAAACGAATGCAGCCGCGCCTGGTGGTC < 1:1283884/150‑1 CACACTGCCTGATGCGCTTCGCTTATCAGGTCTATGTAGGACAGCGTTGCCAGCTCGGATAAGGCTTCCCGCGTTAAGACACACTATCCCAACAACTCTTCCTTAACATCCATCGCCAGCTCAAACGAATGCAGCCGCGCCTGGTGGTCG < 2:1224460/150‑1 ACAATGCCTGATGCGCTTCGCTTATCAGGTCTATGTAGGACAGCGTTGCCAGCTCGGATAAGGCTTCCCGCGTTAAGACACACTATCCCAACAACTCTTCCTTAACATCCATCGCCAGCTCAAACGAATGCAGCCGCGCCTGGTGGTCGA > 1:5805125/1‑150 ACAATGCCTGATGCGCTTCGCTTATCAGGTCTATGTAGGACAGCGTTGCCAGCTCGGATAAGGCTTCCCGCGTTAAGACACACTATCCCAACAACTCTTCCTTAACATCCATCGCCAGCTCAAACGAATGCAGCCGCGCCTGGTGGTCGA > 2:5277308/1‑150 AACCGACGCCGATGAGATTATGGTCAACGGGCAGATTTTCGACCACCAGGCGCGGCTGCATTCGTTTGAGCTGGCGATGGATGTTAAGGAAGAGTTGTTGGGATAGTGTGTCTTAACGCGGGAAGCCTTATCCGAGCTGGCAACGCTGTCCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3304350‑3304504‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctacaCAATGCCTGATGCGCTTCGCTTATCAGGTCTATGTAGGACAGCGTTGCCAGCTCGGATAAGGCTTCCCGCGTTAAGACACACTATCCCAACAACTCTTCCTTAACATCCATCGCCAGCTCAAACGAATGCAGCCGCGCCTGGTGGTCGA < NC_000913/3304536‑3304388 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |