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                                                                                    aTCAATTTTGGTATGACCAATGCACCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGattccg    >  1:1150880/1‑145 (MQ=255)
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                                                                                     tCAATTTTGGTATGACCAATGCACCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGattccgg   <  2:2177574/150‑7 (MQ=255)
                                                                                     tCAATTTTGGTATGACCAATGCACCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGattccgg   <  2:3457431/150‑7 (MQ=255)
                                                                                     tCAATTTTGGTATGACCAATGCACCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGattccgg   <  2:5708086/150‑7 (MQ=255)
                                                                                     tCAATTTTGGTATGACCAATGCACCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATGGGTTAATAAAGTTAAGGGGGTCACGTTGattccgg   >  1:3390073/1‑144 (MQ=255)
                                                                                     tCAATTTAGGTATCACCAATGCACCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGATAATTAAGAGCTAAGTTAATAAACATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGaatccgg   >  1:5362827/1‑144 (MQ=255)
                                                                                      cAATTTTGGTATGACCAATGCACCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGattccggg  >  1:632638/1‑143 (MQ=255)
                                                                                      cAATTTTGGTATGACCAATGCACCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGGTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGattccggg  >  1:1941269/1‑143 (MQ=255)
                                                                                                                                                     |                                                                                      
CGCTCAAATAATAAACAATAAACTCTGTTTTTTGATCTCACCCGGTAAAGTCGCCTATCTTTTCAGCAACAAAACTTGATTAACATCAATTTTGGTATGACCAATGCACCATTCATGTTATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTACGCC  >  NC_000913/1165860‑1166095

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: