| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3493765 | NA (NA) | 6 (0.030) | 5/262 | NT | NA | noncoding (8/26 nt) | REP248 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP248 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 3493775 | NA (NA) | noncoding (18/26 nt) | REP248 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP248 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
CCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3493610‑3493765‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccggacgACGATAGTGCCGTCCGGCATGAGCAATTAATGAGAGGTCAGGGTGTTATGCTGACGGTGACGGCTGACGAAACCTAACAGGAAGCACATCACAAAGACGACAGCGTACAGACCGTTTGCTGTAAGCAGTGCCGCCTGCGGACCGCTATG < NC_000913/3493775‑3493627 CCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGC > 2:903487/1‑150CCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGC > 2:1736767/1‑150CCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGC > 2:1736752/1‑150CCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGC < 1:619617/150‑1CCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGC < 1:3314949/150‑1CCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGC < 1:3036494/150‑1 CGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCC > 2:2351930/1‑150 CGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCC > 2:1206669/1‑150 CGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCC > 1:3297150/1‑150 CGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCC < 2:3865875/150‑1 GGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCG < 1:373768/150‑1 GCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGG > 2:1763908/1‑150 GCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGG > 1:1756786/1‑150 GCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGG < 2:730415/150‑1 CCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGA < 2:2032193/150‑1 CCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGA < 1:3855652/150‑1 CCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCTGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGAC < 1:2808981/150‑1 CCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGAC < 1:3034424/150‑1 CCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGAC < 1:2809002/150‑1 CGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCTTGCCGGACG > 2:3395774/1‑150 CGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACG > 2:1857864/1‑150 CGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGACGATAGTGCCGTCCG < 1:629948/150‑1 CCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGACGATAGTGCCGTCCGGCAT < 1:779933/150‑1 GCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCGTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGACGATAGTGCCGTCCGGCATGA < 1:955423/150‑1 GTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCAGGCCGGACGACGATAGTGCCGTACGGCATGAGCAATTAATGAGAGGTCAGGGTGTTATGCTGACGGTGACGGCTGACGAAACCTCCCAGGCAGCACATCACACAGACG > 2:763062/1‑150 AGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGACGATAGTGCCGTCCG > 1:418585/1‑58 AGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGACGATAGTGCCGTCCG < 2:418585/58‑1 GCCGGACGACGATAGTGCCGTCCGGCATGAGCAATTAATGAGAGGTCAGGGTGTTATGCTGACGGTGACGGCTGACGAAACCTAACAGGAAGCACATCACAAAGACGACAGCGTACAGACCGTTTGCTGTAAGCAGTGCCGCCTGCGGAC < 2:2612574/150‑1 GCCGGACGACGATAGTGCCGTCCGGCATGAGCAATTAATGAGAGGTCAGGGTGTTATGCTGACGGTGACGGCTGACGAAACCTAACAGGAAGCACATCACAAAGACGACAGCGTACAGACCGTTTGCTGTAAGCAGTGCCGCCTGCGGAC < 2:975262/150‑1 GCCGGACGACGATAGTGCCGTCCGGCATGAGCAATTAATGAGAGGTCAGGGTGTTATGCTGACGGTGACGGCTGACGAAACCTAACAGGAAGCACATCACAAAGACGACAGCGTACAGACCGTTTGCTGTAAGCAGTGCCGCCTGCGGAC > 2:2022673/1‑150 GCCGGACGACGATAGTGCCGTCCGGCATGAGCAATTAATGAGAGGTCAGGGTGTTATGCTGACGGTGACGGCTGACGAAACCTAACAGGAAGCACATCACAAAGACGACAGCGTACAGACCGTTTGCTGTAAGCAGTGCCGCCTGCGGAC < 2:1380254/150‑1 GCCGGACGACGATAGTGCCGTCCGGCATGAGCAATTAATGAGAGGTCAGGGTGTTATGCTGACGGTGACGGCTGACGAAACCTAACAGGAAGCACATCACAAAGACGACAGCGTACAGACCGTTTGCTGTAAGCAGTGCCGCCTGCGGAC < 1:3653596/150‑1 GACGACGATAGTGCCGTCCGGCATGAGCAATTAATGAGAGGTCAGGGTGTTATGCTGACGGTGACGGCTGACGAAACCTAACAGGAAGCACATCACAAAGACGACAGCGTACAGACCGTTTGCTGTAAGCAGTGCCGCCTGCGGACCGCT > 2:424734/1‑150 GACGACGATAGTGCCGTCCGGCATGAGCAATTAATGAGAGGTCAGGGTGTTATGCTGACGGTGACGGCTGACGAAACCTAACAGGAAGCACATCACAAAGACGACAGCGTACAGACCGTTTGCTGTAAGCAGTGCCGCCTGCGGACCGCT < 1:1899279/150‑1 GACGACGATAGTGCCGTCCGGCATGAGCAATTAATGAGAGGTCAGGGTGTTATGCTGACGGTGACGGCTGACGAAACCTAACAGGAAGCACATCACAAAGACGACAGCGTACAGACCGTTTGCTGTAAGCAGTGCCGCCTGCGGACCGCT < 1:1275347/150‑1 ACGACGATAGTGCCGTCCGGCATGAGCAATTAATGAGAGGTCAGGGTGTTATGCTGACGGTGACGGCTGACGAAACCTAACAGGAAGCACATCACAAAGACGACAGCGTACAGACCGTTTGCTGTAAGCAGTGCCGCCTGCGGACCGCTA > 1:3238237/1‑150 ACGACGATAGTGCCGTCCGGCATGAGCAATTAATGAGAGGTCAGGGTGTTATGCTGACGGTGACGGCTGACGAAACCTAACAGGAAGCACATCACAAAGACGACAGCGTACAGACCGTTTGCTGTAAGCAGTGCCGCCTGCGGACCGCTA > 1:1263067/1‑150 GACGATAGTGCCGTCCGGCATGAGCAATTAATGAGAGGTCAGGGTGTTATGCTGACGGTGACGGCTGACGAAACCTAACAGGAAGCACATCACAAAGACGACAGCGTACAGACCGTTTGCTGTAAGCAGTGCCGCCTGCGGACCGCTATG < 2:2536562/150‑1 GACGATAGTGCCGTCCGGCATGAGCAATTAATGAGAGGTCAGGGTGTTATGCTGACGGTGACGGCTGACGAAACCTAACAGGAAGCACATCACAAAGACGACAGCGTACAGACCGTTTGCTGTAAGCAGTGCCGCCTGCGGACCGCTATG > 1:3229353/1‑150 GACGATAGTGCCGTCCGGCATGAGCAATTAATGAGAGGTCAGGGTGTTATGCTGACGGTGACGGCTGACGAAACCTAACAGGAAGCACATCACAAAGACGACAGCGTACAGACCGTTTGCTGTAAGCAGTGCCGCCTGCGGACCGCTATG > 1:1196447/1‑150 CCGGCCCGATCGTTGAACATAGCGGTCCGCAGGCGGCACTGCTTACAGCAAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3493610‑3493765‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccggacgACGATAGTGCCGTCCGGCATGAGCAATTAATGAGAGGTCAGGGTGTTATGCTGACGGTGACGGCTGACGAAACCTAACAGGAAGCACATCACAAAGACGACAGCGTACAGACCGTTTGCTGTAAGCAGTGCCGCCTGCGGACCGCTATG < NC_000913/3493775‑3493627 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |