| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,755,531 | IS2 (–) +5 bp | 15.6% | intergenic (‑390/‑163) | ydhZ ← / → pykF | uncharacterized protein/pyruvate kinase I |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | 31 (0.130) | 24/276 | NT | 16.5% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1755531 = | 151 (0.650) | intergenic (‑390/‑167) | ydhZ/pykF | uncharacterized protein/pyruvate kinase I | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | 25 (0.100) | 19/278 | NT | 13.8% | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1755535 | 151 (0.640) | intergenic (‑394/‑163) | ydhZ/pykF | uncharacterized protein/pyruvate kinase I | |||||
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
AACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTGTTTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGTAATACCGGATTCGCTTTCCGGCAGTGCGCCCAGAAAGCAAGTTTCTCCCATCCTTCTCAACT > NC_000913/1755382‑1755680 | aaCAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTGTTTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCAc > 2:3230922/1‑150 (MQ=255) cAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTGTTTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTc > 1:921377/1‑150 (MQ=255) ttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTCACg > 1:1511301‑M2/145‑150 (MQ=255) tGTCTAACAATTTGTATATTTTTTGAAACGCTGTTTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACtggatt > 2:3848176‑M2/1‑144 (MQ=255) tAACATGTTGTATATTTTTTGAAACGCTGTTTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATATGGCGCGCCAATTGACGCTTGAAGGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTga < 1:3894382/150‑1 (MQ=255) tAACAATTTGTATATTTTTTGAAACGCTGTTTTTGTTTTCCTTTTGTATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTga < 1:3731400/150‑1 (MQ=255) ggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTCACGTTGGGCTgaga < 1:1321646‑M2/17‑1 (MQ=255) aCAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTGTTTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGATGGGCTgaga > 2:2665869/1‑150 (MQ=255) tacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTCACGTTGGGCTGAGaca > 2:1730121‑M2/132‑150 (MQ=255) gTTGTATATTTTTTGAAACGCTGTTTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGAcaca > 1:2996099/1‑150 (MQ=255) gTTGTATATTTTTTGAAACGCTGTTTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGAcaca > 1:1007102/1‑150 (MQ=255) gTTGTATATTTTTTGAAACGCTGTTTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGAGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGAcaca > 1:2463284/1‑150 (MQ=255) ttGTATATTTTTTGAAACGCTGTTTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGTACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACaa < 2:2044794/150‑1 (MQ=255) 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aaaCGCTGTTTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCctct > 1:2104279/1‑150 (MQ=255) aCGCTGTTTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGc < 1:2798447/150‑1 (MQ=255) ttttgttttCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCttt < 1:1056009/150‑1 (MQ=255) tgttttCATTTTGTATTAATTTCAGCTTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTc < 2:3629045/150‑1 (MQ=255) tgttttCAAATTGGATTAATTTCAGCGAATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTc < 2:4076024/150‑1 (MQ=255) gttatCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCg < 1:3126499/150‑1 (MQ=255) tttCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccat > 1:2217530‑M2/1‑104 (MQ=255) tCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTGTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGt < 1:3857324/150‑1 (MQ=255) ccTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTc > 1:2378845/1‑150 (MQ=255) ttttGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaa < 1:1721580‑M2/150‑52 (MQ=255) 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gtctggagattcagggggccagtctaCTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGTAATACCGGATTCGCTTTCCGGCAGTGCGCCCAGaaa < 2:1247939‑M2/124‑1 (MQ=255) gtctggagattcagggggccagtctaCTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGTAATACCGGATTCGCTTTCCGGCAGTGCGCCCAGaaa > 1:552822‑M2/27‑150 (MQ=255) aGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGTAATACCGGATTCGCTTTCCGGCAGTGCGCCCAGaaa < 2:3567247/150‑1 (MQ=255) aaCGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGTAATACCGGATTCGCTTTCCGGCAGTGCGCCCAGAAAGCAAGtt > 1:1450484/1‑150 (MQ=255) aaCGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGTAATACCGGATTCGCTTTCCGGCAGTGCGCCCAGAAAGCAAGtt > 1:4000465/1‑150 (MQ=255) cGACTCAAAAACAGGCACTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaa > 2:2242619‑M2/1‑22 (MQ=255) gACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGTAATACCGGATTCGCTTTCCGGCAGTGCGCCCAGAAAGCAAGTTtct < 2:1748991/150‑1 (MQ=255) cagggggccagtctaCTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGTAATACCGGATTCGCTTTCCGGCAGTGCGCCCAGAAAGCAAGTTtctc < 2:705963‑M2/135‑1 (MQ=255) aCTCAAAAACAGGCACTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacg < 1:489923‑M2/150‑131 (MQ=255) aCTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGTAATACCGGATTCGCTTTCCGGCAGTGCGCCCAGAAAGCAAGTTtctc < 2:4014347/150‑1 (MQ=255) tCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGTAATACCGGATTCGCTTTCCGGCAGTGCGCCCAGAAAGCAAGTTTCTccc > 2:54168/1‑150 (MQ=255) tCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGTAATACCGGATTCGCTTTCCGGCAGTGCGCCCAGAAAGCAAGTTTCTccc > 2:860055/1‑150 (MQ=255) cAAAAACAGTCACTCACtgtatttgcccctatatttccagacatcttttatcacttaccccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactttgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcct > 1:3502610‑M2/1‑17 (MQ=255) cAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGTAATACCGGATTCGCTTTCCGGCAGTGCGCCCAGAAAGCAAGTTTCTCCCa > 1:3375815/1‑150 (MQ=255) aaaCAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGTAATACCGGATTCGCTTTCCGGCAGTGCGCCCAGAAAGCAAGTTTCTCCCATcc > 2:533993/1‑150 (MQ=255) aaaCAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGTAATACCGGATTCGCTTTCCGGCAGTGCGCCCAGAAAGCAAGTTTCTCCCATcc > 2:2788476/1‑150 (MQ=255) cagtctaCTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGTAATACCGGATTCGCTTTCCGGCAGTGCGCCCAGAAAGCAAGTTTCTCCCATCCtt > 1:787322‑M2/8‑150 (MQ=255) cagtctaCTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGTAATACCGGATTCGCTTTCCGGCAGTGCGCCCAGAAAGCAAGCTTCTCCCATCCtt < 2:3782610‑M2/143‑1 (MQ=255) aCAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGTAATACCGGATTCGCTTTCCGGCAGTGCGCCCAGAAAGCAAGTTTCTCCCATCCtt < 1:703714/150‑1 (MQ=255) cactcactggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggtt > 1:2261953‑M2/1‑7 (MQ=255) cACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGTAATACCGGATTCGCTTTCCGGCAGTGCGCCCAGAAAGCAAGTTTCTCCCATCCTTCTCaa > 2:2828336/1‑150 (MQ=255) cTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGTAATACCGGATTCGCTTTCCGGCAGTGCGCCCAGAAAGCAAGTTTCTCCCATCCTTCTCAACt < 1:1371847/150‑1 (MQ=255) | AACAATTTATTGTCTAACAAGTTGTATATTTTTTGAAACGCTGTTTTTGTTTTCCTTTTGGATTAATTTCAGCGTATAATGCGCGCCAATTGACTCTTGAATGGTTTCAGCACTTTGGACTGTAGAACTCAACGACTCAAAAACAGGCACTCACGTTGGGCTGAGACACAAGCACACATTCCTCTGCACGCTTTTTCGATGTCACCTATCCTTAGAGCGAGGCACCACCACTTTCGTAATACCGGATTCGCTTTCCGGCAGTGCGCCCAGAAAGCAAGTTTCTCCCATCCTTCTCAACT > NC_000913/1755382‑1755680 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |