| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1654352 = | 59 (0.860) | 3 (0.050) | 3/264 | NT | 5.2% | coding (790/1215 nt) | rspA | bifunctional D‑altronate/D‑mannonate dehydratase |
| ? | NC_000913 | 1654370 = | 52 (0.790) | coding (772/1215 nt) | rspA | bifunctional D‑altronate/D‑mannonate dehydratase | |||||
CAGCGAAGCAAAATCGGCAATCCGGCGCATACCGGTAATTCCGCCTGCATGGGTCAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATGCGATAATCTTCAATGCTTTTACCAAAGCGCGCCGCTTCAATAGGCGTTAAGCGATGGTGCATGTCATGCAGCAA > NC_000913/1654224‑1654517 | tcgcttaacgcctattgaagcggcgcgctttggtaaaagcattgaagattatcgcatgttctggatggaagacccgacgcctgcggaaaaccaggaatgcttccgtctcattcgccaacataccgtcaCACCCACTGCGATGGGTGTGa > 1:756479‑M1/129‑149 (MQ=255)cAGCGAAGCAAAATCGGCAATCCGGCGCATACCGGTAATTCCGCCTGCATGGGTCAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCGGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGa < 1:554670/149‑1 (MQ=255) aGCGAAGCAAAATCGGCACTCCGGCGCATACCGGTAATTCCGCCTGCATGGGGCAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGAc < 2:1026126/149‑1 (MQ=255) aGCGAAGCAAAATCGGCAATCCGGCGCATACCGGTAATTCCGCCTGCATGGGTCACCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCAACCACTGCGATGGGTGTGAc > 1:922750/1‑149 (MQ=255) aGCGAAGCAAAATCGGCAATCCGGCGCATACAGGTAATTCCGCCTGCATGGGTCAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACACACTGCGATGGGTGTGAc > 1:740423/1‑149 (MQ=255) cGAAGCAAAATCGGCAAACCGGCGCATACCGGTAATTCCGCCTGCATGGGGCAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACgg < 1:195774/149‑1 (MQ=255) cGAAGCAAAATCCGCAAGCCGTCGCATACCGGTAATTCCGCCTGCATGGGTCAGCGTGGGGCGGATCTAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTGGTTGGCAGGCCCAGATGCGGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACgg < 2:848043/149‑1 (MQ=255) cAAAATCGGCAATCCGGCGCATACCGGTAAATCCGCCTGCATGGGTCAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGt > 2:253459/1‑149 (MQ=255) aaaTCGGCAATCCGGCGCATACCGGTAATTCCGCCTGCATGGGTCAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGGTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGAGGGTttgttg > 1:740689/1‑149 (MQ=255) aaaTCGGCAATCCGGCGCATACCGGTAATTCCGCCTGCATGGGTCAGCGGGGTGCGGATTTAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTg > 1:809746/1‑149 (MQ=255) aTCGGCAATCCGGCGCATACCGGTAATTCCGCCTGCATGGGTCAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGc < 2:717151/149‑1 (MQ=255) gCAATCCGGCGCATACCGGTAATTCCGCCTGCATGGGTCAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAAt > 1:531124/1‑149 (MQ=255) gCAATCCGGCGCATACCGGTAATTCCGCCTGCATGGGTCAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGGTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAAt < 2:383865/149‑1 (MQ=255) tCCGGCGCATACCGGTAATTCCGCCTGCATGGGTCAGAGTGGGGCGGATAAAATCGATGAGTGGCTCGTCAATCAGTTGGTTGCAGTCCCCGAGGCTGTTGAAGACTTCCCCAACTGCGATGGGTGGGACGGTAAGGTGGCGAATgagc > 2:767119/1‑148 (MQ=255) tACCGGTAATTCCGCCTGCATGGGGCAGCGGGGTGCGGATCTAATCGAGGAGCTGCTCTTCACTCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCAt < 1:989748/149‑1 (MQ=255) ccGGTAATTCCGCCTGCATGGGTCAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGCTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTc > 1:1185517/1‑149 (MQ=255) ggTAATTCCGCCTGCATGGGTCAGCGTGGTGCGGATATACTCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGGTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCt < 2:559433/149‑1 (MQ=255) ggTAATTCCGCCGGCATGGGTCAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCt < 1:590501/149‑1 (MQ=255) aTTCCGCCTGCATGGGTCAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGGTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGtt < 2:299003/149‑1 (MQ=255) tCCGCCTGCATGGGTCAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGtttt > 1:955542/1‑149 (MQ=255) tCCGCCTGCATGGGTCAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGtttt < 2:456049/149‑1 (MQ=255) gCCTGCATGGGTCAGCGTGGTGCGGATATAATCTCTGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGACGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCg < 2:848717/149‑1 (MQ=255) cTGCATGGGTCAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCa > 2:606731/1‑149 (MQ=255) cTGCATGGGTCAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCa > 1:33336/1‑149 (MQ=255) cTGCATGGGTCAGAGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCATTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGCTGTGAAGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCATGGTTTTCCGCa > 2:1089024/1‑149 (MQ=255) aTGGGTCAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGCCGGAAGCATTCCTGGATTTCCGCAGGCg > 1:1171604/1‑149 (MQ=255) aTGGGTCAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCg > 2:108528/1‑149 (MQ=255) gggTCAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTc > 1:277851/1‑149 (MQ=255) tCAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCTCAGGCGTCggg > 2:267676/1‑149 (MQ=255) cAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGt > 1:371686/1‑149 (MQ=255) gtgCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGACGCAATACTGGGTTTCGGCAGGCGTCGGGTCTtccat > 1:799508/1‑149 (MQ=255) tgCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGGCGGGTCTtccatc < 2:304554/149‑1 (MQ=255) ggCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTtccatc < 2:203859/148‑1 (MQ=255) tataATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCGAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGCCGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCAGTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAAc > 2:673661/1‑149 (MQ=255) aataATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAAc < 1:1129566/148‑1 (MQ=255) aaTCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATg < 1:854884/149‑1 (MQ=255) tCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTTCAGTCCCAGATGCTGTGGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGTGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATGCg < 2:963696/149‑1 (MQ=255) cGATGAGTTGCTCTTCAATAAGTTGTTTGCAGTCCCAGCTGCTGATGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATGCGa < 2:809746/149‑1 (MQ=255) gATGAGTTGCTCTTAAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATTGGTGTGACGGGATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATGCGAt > 2:679043/1‑149 (MQ=255) tGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCTTCCAGAACATGCGATaa < 2:740423/149‑1 (MQ=255) gTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATGCGATAATCt < 2:839660/149‑1 (MQ=255) ttGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATGCGATAATCtt < 1:253459/149‑1 (MQ=255) cAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATGCGATAATCTTCAATGCtt > 2:1033754/1‑149 (MQ=255) aTCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACTGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATGCGATAATCTTCAATGCtttt < 1:369950/149‑1 (MQ=255) tCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATGCGATAATCTTCAATGCTTTTa > 2:462538/1‑149 (MQ=255) tCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATGCGATAATCTTCAATGCTTTTa > 2:557269/1‑149 (MQ=255) aggaatgcttccgtctcattcgccaacataccgtcaCACCCACTGCGATGGGtgtg < 2:222223‑M1/20‑1 (MQ=255) aggaatgcttccgtctcattcgccaacataccgtcaCACCCACTGCGATGGGtgtg > 1:222223‑M1/37‑56 (MQ=255) aGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATGCGATAATCTTCAATGCTTTTAcc > 2:587684/1‑149 (MQ=255) gttgttTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATGCGATAATCTTCAATGCTTTTACCa < 1:587684/149‑1 (MQ=255) ttgttTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCTGGTCTTCCATCCAGAACATTCGATAATCTTCAATGCTTTTACCaa > 1:930995/1‑149 (MQ=255) gttTGCAGTCCCTGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGAGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGTTCTTCCATCCAGAACATGCGATAATCTTCAATGCTTTTACCAAAg < 2:945669/149‑1 (MQ=255) tGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCAGCCAGAACATGCGTTAATCTTCAATGCTTTTACCAAAgcgc > 2:137146/1‑149 (MQ=255) aGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATGCGATAATCTTCAATGCTTTTACCAAAGCGcgcc > 1:469395/1‑149 (MQ=255) ccAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATGCGATAATCTTCAATGCTTTTACCAAAGCGCGCCGCtt > 2:108318/1‑149 (MQ=255) ttGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGATCATGCGATAATCTTCAATGCTTTTACCATCGCGCGCCGCTTCAATAgtggt > 2:1049206/1‑145 (MQ=255) aGACTTCACCCACTGCGATGGGTGAGACGGTATGTTGGCGACGGAGACGGAAGAATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGGCTTCCATCCAGAACATGCGATAATCTTCAATGCTTTTACCAAAGCGCGCCGCTTCAATAGGCGTTAAg < 1:781280/149‑1 (MQ=255) gACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATGCGATAATCTTCAATGCTTTTACCAAAGCGCGCCGCTTCAATAGGCGTTAAGc < 2:955542/149‑1 (MQ=255) aCTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATGCGATAATCTTCAATGCTTTTACCAAAGCGCGCCGCTTCAATAGGCGTTAAGCg > 1:836870/1‑149 (MQ=255) tcacacccatcgcagtgggtgTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATGCGATAATCTTCAATGCTTTTACCAAAGCGCGCCGCTTCAATAGGCGTTAAGCGa > 1:756479‑M2/22‑149 (MQ=255) cacacccatcgcagtgggtgTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCt > 1:222223‑M2/21‑56 (MQ=255) cacacccatcgcagtgggtgTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCt < 2:222223‑M2/36‑1 (MQ=255) CCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGGCGGGTCTTCCATCCAGAACATGCGATAATCTTCAATGCTTTTACCAAAGCGCGCCGCTTCAATAGGCGTTAAGCGATGGTGc > 1:243084‑M1/1‑149 (MQ=255) CCACGGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGATTGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCAGCCAGAACCTGCGATAATCTTCAATGCTTTTACCAAAGCGCGCCGCTTCAGTTGGCGGTAAGCGATGGTGc < 2:1074078‑M1/149‑1 (MQ=255) ACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATGCGATAATCTTCAATGCTTTTACCAAAGCGCGCCGCTTCAAAAGGCGTTAAGCGATGGTGCAt < 2:720677‑M1/149‑1 (MQ=255) tGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATGCGATAATCTTCAATGCTTTTACCAAAGCGCGCCGCTTCAATAGGCGTAAAGCGATGGTGCATGt > 1:567420/1‑149 (MQ=255) gggtgTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATCCGATAATCTTCAATGCTTTTACCAAAGCGCGCCGCTTCAATAGGCGTTAAGCGATGGTGCATGTCATgca < 2:531124‑M2/144‑1 (MQ=255) gTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATGCGATAATCTTCAATGCTTTTACCAAAGCGCGCCGCTTCAATAGGCGTTAAGCGATGGTGCATGTCATGCAGCaa > 1:351106‑M2/2‑149 (MQ=255) | CAGCGAAGCAAAATCGGCAATCCGGCGCATACCGGTAATTCCGCCTGCATGGGTCAGCGTGGTGCGGATATAATCGATGAGTTGCTCTTCAATCAGTTGTTTGCAGTCCCAGATGCTGTTGAAGACTTCACCCACTGCGATGGGTGTGACGGTATGTTGGCGAATGAGACGGAAGCATTCCTGGTTTTCCGCAGGCGTCGGGTCTTCCATCCAGAACATGCGATAATCTTCAATGCTTTTACCAAAGCGCGCCGCTTCAATAGGCGTTAAGCGATGGTGCATGTCATGCAGCAA > NC_000913/1654224‑1654517 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |