Predicted mutation | |||||||
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New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 60 (0.880) | 50/274 | NT | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | = 4640559 | 0 (0.000) | intergenic (+17/‑383) | yjjY/yjtD | uncharacterized protein/putative methyltransferase |
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
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gggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaatt > 1:464591‑M2/1‑1 (MQ=255) gggtaatgactccaacttattgatagtcttttatgttcagataatgcccgctgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaatt > 1:1144789‑M2/1‑1 (MQ=255) | GTACGTAATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTATTTTAATAATCCAACTAGTTGCATCATACAACTAATAAACGTG > NC_000913/4640411‑4640707 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |