New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 4184513 = | 68 (0.990) | 4 (0.060) | 3/256 | NT | 6.0% | coding (3269/4029 nt) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit |
? | NC_000913 | 4184558 = | 62 (0.980) | coding (3314/4029 nt) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit |
TTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGCGTACGATCTGGGCGCTGAC > NC_000913/4184411‑4184706 | ttAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGtct < 2:1145780/149‑1 (MQ=255) ggacttcttgctgctgtttcagcatggcgttgatcttgtcgccgatacctttcgcagccatacccaggtgggtttcgaggatctgaccgatgttcatacgagACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGtct > 2:464399‑M1/103‑149 (MQ=255) tAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGtctc < 2:1128494/149‑1 (MQ=255) 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tATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACa > 2:1160767/1‑149 (MQ=255) tCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGACTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGGCGCGTATGACCATc > 2:875703/1‑149 (MQ=255) aGCCTGGTGACAAGATGGCATGTCGTCACTGTAATAAGTGTGTAATTTCTCAGTTCAACCCGATCGATGATATGCCTTACGATGAAAACGGTATTCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGt < 1:794394/149‑1 (MQ=255) aGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCGGGGCGTACCGTCTCGTATGCACATCggg > 1:103742/1‑148 (MQ=255) ggTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGAt > 2:198985/1‑149 (MQ=255) 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gCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGCTCCTCGAAACCCACCGGGGGATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGAGCAACGCCATGCTGAAACAGCCGCAAGAAGTCGCGAAACGGCGCGAATTCATCCAgcgggcggccg > 2:1163974/1‑145 (MQ=255) gCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGCGTACg > 1:103702/1‑149 (MQ=255) gggCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCGGCGTGCGTCCGATc > 2:618400/1‑149 (MQ=255) gggCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGCGTACGATc < 2:396688/149‑1 (MQ=255) cgtaccgtCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGCGTACGATCTgg < 2:599183‑M2/141‑1 (MQ=255) taccgtCTCTTATTAACATCGTTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGTCTGCGAAATGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGCGTACGATCTGGgc < 1:195782‑M2/143‑1 (MQ=255) cgtCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGATACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGGGACAAGAACAACGCCATGCTGAAACAGCCGCATGAAGTCGCGAACCTGCGCGAATTCATCCAGCGTGCGTGCGATCTCTGCGCt > 1:546330‑M2/4‑149 (MQ=255) tCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGCGTACGATCTGGGCGCTGa < 1:198985‑M2/148‑1 (MQ=255) ctcGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGCGTACGATCTGGGCGCTGAc < 2:1148654/149‑1 (MQ=255) | TTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGCGTACGATCTGGGCGCTGAC > NC_000913/4184411‑4184706 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |