New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 4523068 | 461 (1.180) | 5 (0.010) | 3/260 | NT | 1.1% | coding (1027/1968 nt) | yjhG | putative dehydratase |
? | NC_000913 | = 4523128 | 452 (1.240) | coding (967/1968 nt) | yjhG | putative dehydratase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 573 total aligned reads displayed.
TTCTTTCAGCGTGCTGCCGGTAACCGTCATAACGTCTTCATGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTAT > NC_000913/4522919‑4523217 | tttcAGCGTGCTGCCGGTAACCGTCATAACGTCTTCATGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCg < 2:1820892/150‑1 (MQ=255) ttcAGCGTGCTGCCGGTAACCGTCATAACGTCTTCATGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCgg > 1:4386061/1‑150 (MQ=255) tcAGCGTGCTGCCGGTAACCGTCATAACGTCTTCATGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCggg > 2:4274924/1‑150 (MQ=255) tcAGCGTGCTGCCGGTAACCGTCATAACGTCTTCATGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATAAGGCAGTACGCTCACCAGTCggg > 2:3551188/1‑150 (MQ=255) gCGTGCTGCCGGTAACCGTCATAACGTCTTCATGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCa < 1:4004658/150‑1 (MQ=255) ctgcCGGTAACCGTCATAACGTCTTCATGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACgcgc < 2:4487881/150‑1 (MQ=255) ccGGTAACCGTCATAACGTCTTCATGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCttg > 2:5752260/1‑150 (MQ=255) cGGTAACCGTCATAACGTCTTCATGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCttgt < 1:4232665/150‑1 (MQ=255) cGTCATAACGTCTTCATGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCg > 1:2060777/1‑150 (MQ=255) cATAACGTCTTCATGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGAt < 2:6288307/150‑1 (MQ=255) ttCATGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGtcatc > 1:5665670/1‑150 (MQ=255) tGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACg > 2:727831/1‑150 (MQ=255) caacaaTCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGt < 1:5946840/150‑1 (MQ=255) aacaaTCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTc < 2:2834820/150‑1 (MQ=255) aacaaTCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTc > 1:3554356/1‑150 (MQ=255) acaaTCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCg < 1:2894598/150‑1 (MQ=255) acaaTCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCg > 1:5898821/1‑150 (MQ=255) caaTCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCgg > 2:1132325/1‑150 (MQ=255) 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gCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCAt > 2:1752911/1‑150 (MQ=255) aGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATtc < 1:2552747/150‑1 (MQ=255) aGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATtc > 1:6051878/1‑150 (MQ=255) gTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTTAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATtct < 2:829272/150‑1 (MQ=255) cGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGTCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTa < 2:2303189/150‑1 (MQ=255) gCTCACCAGgcaggttgccatatcccgaccgttgatgactggatccgcatcaacaagcgcgtgccccgactggtgagcgtactgcctaatggcccggtttatcatccaacggtcaatgcctttatggcaggtggtgtgccggaagtcatg > 2:5534504‑M1/1‑9 (MQ=255) gCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTAt > 2:261120/1‑150 (MQ=255) cTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATc < 1:5813220/150‑1 (MQ=255) tCACCAGgcaggttgccatatcccgaccgttgatgactggatccgcatcaacaagcgcgtgccccgactggtgagcgtactgcctaatggcccggtttatcatccaacggtcaatgcctttatggcaggtggtgtgccggaagtcatgtt < 1:4675259‑M1/150‑144 (MQ=255) tCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCg > 2:4646203/1‑150 (MQ=255) 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aCCAGgcaggttgccatatcccgaccgttgatgactggatccgcatcaacaagcgcgtgccccgactggtgagcgtactgcctaatggcccggtttatcatccaacggtcaatgcctttatggcaggtggtgtgccggaagtcatgttca < 2:3807470‑M1/150‑146 (MQ=255) aggcaggttgccatatcccgaccgttgatgactggatccgcatcaacaagcgcgtgccccgactggtgagcgtactgcctaatggcccggtttatcatccaacggtcaatgcctttatggcaggtggtgtgccggaagtcatgttgcatc > 1:1861210‑M1/1‑2 (MQ=255) | TTCTTTCAGCGTGCTGCCGGTAACCGTCATAACGTCTTCATGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCATAAAGGCATTGACCGTTGGATGATAAACCGGGCCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTAT > NC_000913/4522919‑4523217 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |