| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 127,605 | A→C | 5.3% | intergenic (+18/‑307) | aceF → / → lpd | pyruvate dehydrogenase, dihydrolipoyltransacetylase component E2/dihydrolipoyl dehydrogenase; E3 component of pyruvate and 2‑oxoglutarate dehydrogenases complexes; glycine cleavage system L protein; dihydrolipoamide dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 127,605 | 0 | A | C | 5.3% | 894.6 / 5.2 | 372 | intergenic (+18/‑307) | aceF/lpd | pyruvate dehydrogenase, dihydrolipoyltransacetylase component E2/dihydrolipoyl dehydrogenase; E3 component of pyruvate and 2‑oxoglutarate dehydrogenases complexes; glycine cleavage system L protein; dihydrolipoamide dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (152/172); new base C (8/22); total (161/211) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.58e-02 | |||||||||||
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Only 100 of 378 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |