| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 4,640,551 | IS1 (–) +9 bp | 90.9% | intergenic (+9/‑383) | yjjY → / → yjtD | uncharacterized protein/putative methyltransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 3583428 = | NA (NA) | 72 (0.800) | 40/256 | NT | 89.3% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 4640551 = | 8 (0.100) | intergenic (+9/‑391) | yjjY/yjtD | uncharacterized protein/putative methyltransferase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 88 (0.990) | 46/254 | NT | 91.1% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 4640559 | 8 (0.100) | intergenic (+17/‑383) | yjjY/yjtD | uncharacterized protein/putative methyltransferase | |||||
Only 100 of 191 total aligned reads displayed.
TGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTATTTTAATAATCCAACTAGTTGCATCATACAA > NC_000913/4640420‑4640695 | cggcggtgcttttgcctttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCg > 2:1508227‑M2/132‑140 (MQ=255)cggcggtgctttagccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccctcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCg > 2:1390339‑M2/132‑140 (MQ=255) ttCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggta < 1:1268930‑M2/140‑5 (MQ=255) ggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGaca < 1:1615490‑M2/13‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |