| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 737,043 | T→C | 5.5% | pseudogene (219/1137 nt) | ybfL → | pseudogene, DDE domain transposase family;putative factor; Not classified; putative receptor protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 737,043 | 0 | T | C | 5.5% | 355.8 / 9.3 | 108 | pseudogene (219/1137 nt) | ybfL | pseudogene, DDE domain transposase family;putative factor; Not classified; putative receptor protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (47/55); new base C (3/3); total (50/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
CAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGA > NC_000913/736904‑737182 | cAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACt < 1:702827/140‑1 (MQ=255) gttattctacttTTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTAt < 2:373808/134‑1 (MQ=255) ggCATCCTACTCTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAATGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTAt < 2:1170810/140‑1 (MQ=255) ggCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTTGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTAt < 1:381230/140‑1 (MQ=255) ggCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGTGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTAt < 1:401740/140‑1 (MQ=255) tctacttTTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAATGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCa < 1:960763/139‑1 (MQ=255) tctactgTTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAATGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCa < 2:183074/139‑1 (MQ=16) ccTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCa < 2:786998/140‑1 (MQ=255) ccTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCa < 1:891870/140‑1 (MQ=255) ccTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCa < 2:183098/140‑1 (MQ=255) ccTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCa < 2:947605/140‑1 (MQ=255) tactaTTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCaga > 2:506100/1‑140 (MQ=255) tactaTTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCaga > 2:506422/1‑140 (MQ=255) tGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTa < 2:72278/140‑1 (MQ=40) tGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTa > 1:485935/1‑140 (MQ=40) tGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTa > 1:84369/1‑140 (MQ=40) tGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATATCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGGTGTa > 2:894095/1‑140 (MQ=255) aCTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATc > 1:1330788/1‑140 (MQ=40) aCTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATc > 2:620689/1‑140 (MQ=40) aCTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATc > 2:1211865/1‑140 (MQ=40) aCTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATc < 1:809924/140‑1 (MQ=40) cTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATcc < 2:118898/140‑1 (MQ=40) cTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATcc < 2:1142783/140‑1 (MQ=40) gCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATctg < 1:1028632/140‑3 (MQ=255) gCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATctg < 1:1028920/140‑3 (MQ=255) gCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATctg < 1:1029294/140‑3 (MQ=255) tATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTg > 1:1365307/1‑140 (MQ=40) tATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTg > 1:1365406/1‑140 (MQ=40) aTTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGc > 1:427832/1‑140 (MQ=40) aTTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGc > 1:242057/1‑140 (MQ=40) tGGTGCAGAATGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAAt < 2:692885/140‑1 (MQ=17) tGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAAt < 2:692881/140‑1 (MQ=40) tGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAAt < 2:1641348/140‑1 (MQ=40) tGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAAt < 2:1155801/140‑1 (MQ=40) tGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAAt < 2:1156603/140‑1 (MQ=40) tGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTATTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAAt < 2:692683/140‑1 (MQ=37) cAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCAc > 2:1530786/1‑140 (MQ=40) gAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGa < 1:596028/140‑1 (MQ=40) aaGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGt < 2:1085135/140‑1 (MQ=39) aaGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGt < 2:308960/140‑1 (MQ=39) aaGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGACACCATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGt < 2:149423/140‑1 (MQ=18) aaGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGACACCATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGt < 2:149093/140‑1 (MQ=18) aGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTg < 2:52383/140‑1 (MQ=38) aGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTg < 1:1206852/140‑1 (MQ=38) tGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCtt < 2:1628596/140‑1 (MQ=37) aaGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTttatt < 1:1253147/140‑1 (MQ=37) aGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTttatta > 1:615466/1‑140 (MQ=37) gATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTaa < 2:74760/140‑1 (MQ=37) atatAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGc < 2:340655/88‑1 (MQ=38) atatAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAAc > 2:784541/1‑140 (MQ=37) atatAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAAc > 2:1098133/1‑140 (MQ=37) atatAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTATTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGc < 2:340866/88‑1 (MQ=18) ataGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTg > 1:421854/1‑140 (MQ=37) ataGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTg > 1:1232102/1‑140 (MQ=17) gagGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGAt < 1:430426/140‑1 (MQ=37) ggATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTTAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGc < 2:820720/140‑1 (MQ=37) ggATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGc < 1:1101483/140‑1 (MQ=37) aTTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGt < 1:1652183/140‑1 (MQ=37) tttCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTg > 2:683813/1‑140 (MQ=37) tttCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTg > 1:99620/1‑140 (MQ=37) tttCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTg > 1:569349/1‑140 (MQ=37) ttCTGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGTGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAAATGGATGCGTGa > 2:983179/1‑140 (MQ=255) ttCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATTCGTGa > 1:1634154/1‑140 (MQ=37) ttCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGa > 1:975181/1‑140 (MQ=37) ttCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGAGCGTTATTAACTGGATGCGTGa > 1:1634021/1‑140 (MQ=255) ttCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGCATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGa > 1:450742/1‑140 (MQ=37) aaaCACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCAt > 2:329764/1‑140 (MQ=37) aaCACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCAtt < 1:1563075/140‑1 (MQ=37) acacATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATtc > 2:1550283/1‑140 (MQ=37) tctcGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGcc < 2:1586108/64‑1 (MQ=40) ctcGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCaaa > 1:856833/1‑140 (MQ=255) ctcGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCaaa > 1:856521/1‑140 (MQ=255) ctcGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCaaa > 1:856393/1‑140 (MQ=255) ctcGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCaaa > 2:488016/1‑140 (MQ=255) cGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATg < 2:1524660/140‑1 (MQ=255) cTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAg > 2:904632/1‑140 (MQ=40) aTTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGAt > 1:768823/1‑140 (MQ=40) ttGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGa > 1:933872/1‑140 (MQ=40) ttGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGa > 1:44606/1‑140 (MQ=40) ttGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGa > 2:599709/1‑140 (MQ=40) gAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGaaa < 1:1039075/140‑1 (MQ=40) gAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGaaa < 2:798293/140‑1 (MQ=40) gAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGaaa < 2:1326651/140‑1 (MQ=21) aaaTGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGaaaaa < 1:1355989/140‑1 (MQ=40) gTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTc > 1:609381/1‑140 (MQ=40) aTTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCg < 2:713279/140‑1 (MQ=40) ccTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCa < 1:441479/140‑1 (MQ=40) tGTTCACGATTCTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCAct < 2:964843/140‑1 (MQ=255) tGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCAct < 1:1411614/140‑1 (MQ=40) gTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCAttc < 1:102615/140‑1 (MQ=255) ttCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCActct > 1:581612/1‑140 (MQ=40) ttCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCActct > 2:885624/1‑140 (MQ=40) ttCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCActct < 1:652609/140‑1 (MQ=40) ttCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCActct < 1:653494/140‑1 (MQ=40) tCACGACACCATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCtt > 1:461739/1‑140 (MQ=21) cACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTa > 1:1175554/1‑140 (MQ=40) cGATACCATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATg > 1:1451742/1‑140 (MQ=21) gATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGa > 2:501082/1‑140 (MQ=40) tACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCACCGGCACTCTTATGACa > 2:390417/1‑140 (MQ=255) tATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAaga > 1:1358534/1‑140 (MQ=38) | CAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGA > NC_000913/736904‑737182 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |