| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,048,338 | G→T | 5.2% | V118V (GTC→GTA) | gfcC ← | putative O‑antigen capsule production periplasmic protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,048,338 | 0 | G | T | 5.2% | 320.3 / 2.3 | 85 | V118V (GTC→GTA) | gfcC | putative O‑antigen capsule production periplasmic protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (50/30); new base T (3/2); total (53/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CAGGGCAATTGCCCGGCCCCAGAAACCGCACCCAGCAGAGTAATAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGCAAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCG > NC_000913/1048201‑1048471 | cAGGGCAATTGCCCGGCCCCAGAAACCGCACCCAGCAGAGTAATAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGAc > 1:1017897/1‑140 (MQ=255) tGCCCGGCCCCAGAAACCGCACCCAGCAGAGTAATAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCg < 2:147130/140‑1 (MQ=255) cccGGCCCCAGAAACCGCACCCAGCAGAGTAATAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGAc < 1:754016/140‑1 (MQ=255) cccGGCCCCAGAAACCGCACCCAGCAGAGTAATAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGAc < 1:1459295/140‑1 (MQ=255) cccGGCCCCAGAAACCGCACCCAGCAGAGTAATAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGAc < 1:1396214/140‑1 (MQ=255) cccGGCCCCAGAAACCGCACCCAGCAGAGTAATAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGAc < 1:1393636/140‑1 (MQ=255) gAAACCGCACCCAGCAGAGTAATAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCAATCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATatt < 1:282950/140‑1 (MQ=255) aaCCGCACCCAGCAGAGTAATAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATattga < 1:497049/140‑1 (MQ=255) aCCGCACCCAGCAGAGTAATAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATattgag < 1:25794/140‑1 (MQ=255) aCCGCACCCAGCAGAGTAATAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATattgag < 1:267148/140‑1 (MQ=255) ccGCACCCAGCAGAGTAATAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATattgaga < 1:215235/140‑1 (MQ=255) ccGCACCCAGCAGAGTAATAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATattgaga < 1:705390/140‑1 (MQ=255) cACCCAGCAGAGTAATAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGAATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCAACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGAGattgagtatg > 2:980505/1‑136 (MQ=255) ccAGCAGAGTAATAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATGGAGt < 2:1066856/140‑1 (MQ=255) agcagAGTAATAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTTACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTaa > 2:1568667/1‑140 (MQ=255) agcagAGTAATAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTTACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGAGTGAGTaa > 2:1568758/1‑140 (MQ=255) tAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGgcgc > 1:671939/1‑140 (MQ=255) tAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGgcgc > 1:671877/1‑140 (MQ=255) tAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGgcgc > 1:1017923/1‑140 (MQ=255) tAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGgcgc > 1:1184209/1‑140 (MQ=255) tAGTCACCGGACGCTGTACCGTATAGAGCGAATAGTCCCCGACCAACGGGGGAGTGATGTTCTCATCCACGCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTACGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTCACTGCTGgcgc > 1:28019/1‑140 (MQ=255) aGTCCCCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTTAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCTCa < 2:913997/140‑1 (MQ=255) gTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCAc < 1:979604/140‑1 (MQ=255) aCCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGa > 1:1286344/1‑140 (MQ=255) cGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGAtt > 1:897357/1‑140 (MQ=255) cGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGAtt > 1:1222909/1‑140 (MQ=255) cGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGAtt > 1:313313/1‑140 (MQ=255) cGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGAtt > 2:460028/1‑140 (MQ=255) cGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGAtt > 2:442073/1‑140 (MQ=255) tGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGt > 2:1139459/1‑140 (MQ=255) taGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCcac > 2:1231983/1‑140 (MQ=255) taGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCcac > 2:1231989/1‑140 (MQ=255) agagCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTTACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCcaca < 1:1568758/140‑1 (MQ=255) agagCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTTACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCcaca < 1:1568667/140‑1 (MQ=255) agagCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCcaca > 2:37726/1‑140 (MQ=255) agagCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCcaca > 2:481564/1‑140 (MQ=255) agagCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCcaca > 2:746784/1‑140 (MQ=255) agagCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCcaca > 1:1254535/1‑140 (MQ=255) agCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACAtc > 1:636420/1‑140 (MQ=255) tataGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACAtcgtcg > 1:1662569/1‑140 (MQ=255) ataGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCCGTGATCTTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATcgtcgt > 2:1332210/1‑140 (MQ=255) ataGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGTGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATcgtcgt > 1:365741/1‑140 (MQ=255) ataGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCa > 1:1684361/1‑110 (MQ=255) ataGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATcgtcgt > 2:1511581/1‑140 (MQ=255) ataGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATcgtcgt > 2:1511361/1‑140 (MQ=255) ataGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATcgtcgt > 2:1359537/1‑140 (MQ=255) ataGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATcgtcgt > 2:968077/1‑140 (MQ=255) ataGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATcgtcgt > 1:1086460/1‑140 (MQ=255) ataGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATcgtcgt > 1:978553/1‑140 (MQ=255) ataGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATcgtcgt > 1:1558845/1‑140 (MQ=255) ataGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATcgtcgt > 1:331950/1‑140 (MQ=255) ataGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATcgtcgt > 1:467635/1‑140 (MQ=255) ataGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATcgtcgt > 1:847480/1‑140 (MQ=255) ataGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATcgtcgt > 1:729888/1‑140 (MQ=255) aaaGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCa < 2:1684361/108‑1 (MQ=255) aGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTTACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGATGCCGCCACATCGGCGTCa > 2:512278/1‑140 (MQ=255) tCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGc > 2:56181/1‑140 (MQ=255) tCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGc > 2:179938/1‑140 (MQ=255) cccGACCTACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCCGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCtt < 1:989507/140‑1 (MQ=255) cccGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCtt < 1:926998/140‑1 (MQ=255) cccGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCtt < 1:520268/140‑1 (MQ=255) cccGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCtt > 1:1371404/1‑140 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1:926918/1‑140 (MQ=255) gTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGCAAGCt < 2:1406397/140‑1 (MQ=255) ttCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGCAAGCtg > 2:1561310/1‑140 (MQ=255) aTCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGCAAGCTGTGCCa > 2:355998/1‑140 (MQ=255) aTCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGCAAGCTGTGCCa > 2:815796/1‑140 (MQ=255) cTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGCAAGCTGTGCCCTGACa > 1:1231507/1‑140 (MQ=255) cTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGCAAGCTGTGCCATGACa > 1:822116/1‑140 (MQ=255) cTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGCAAGCTGTGCCATGACa > 1:1476564/1‑140 (MQ=255) gTACAAACTCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGCAAGCTGTGCCATGACATGt < 1:1146343/140‑1 (MQ=255) gTACAAAATCACGGTCCAGATTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGACAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGCAAGCTGTGCCATGACATGt < 1:1427365/140‑1 (MQ=255) cAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGCAAGCTGTGCCATGACATGTTgg < 1:968077/140‑1 (MQ=255) cAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGCAAGCTGTGCCATGACATGTTgg < 2:872025/140‑1 (MQ=255) aaaaaTCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGTGATTGATGCACTGCTGGCTCACGGATTTAATCGTTTCCGCCACATCGTCGTCAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGCAAGCTGTGCCTTGACATGTTgg < 2:1050756/139‑1 (MQ=255) aTCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGCAAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGt < 1:442073/140‑1 (MQ=255) ggTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGCAAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTa > 1:1522197/1‑140 (MQ=255) tCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGCAAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAg < 2:1078473/140‑1 (MQ=255) cAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGCAAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAgcg > 2:1157233/1‑140 (MQ=255) cAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCTACTGCTTCCCAGGAAGCAAGCTGTGCCATGACATGATGGTAGTCTTTAAgcg > 2:1157519/1‑140 (MQ=255) | CAGGGCAATTGCCCGGCCCCAGAAACCGCACCCAGCAGAGTAATAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGCAAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCG > NC_000913/1048201‑1048471 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |