| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,331,561 | G→A | 5.4% | D172N (GAC→AAC) | topA → | DNA topoisomerase I, omega subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,331,561 | 0 | G | A | 5.4% | 257.4 / 3.9 | 74 | D172N (GAC→AAC) | topA | DNA topoisomerase I, omega subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/35); new base A (2/2); total (37/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.06e-01 | |||||||||||
TGATTGGGGGTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAA > NC_000913/1331424‑1331698 | tGATTGGGGGTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGAc > 2:1104473/1‑140 (MQ=255) gATTGGGGGTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGAcc < 1:1614752/140‑1 (MQ=255) ttGGGGGTGATGATGCGCGCTATCGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCACCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAAGGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACcgc < 1:896423/140‑1 (MQ=255) tGGGGGTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACcgcg < 2:1171174/140‑1 (MQ=255) ggggTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCgtg < 1:522231/140‑1 (MQ=255) ggggTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCgtg < 1:1500245/140‑1 (MQ=255) ggggTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCgtg < 1:1453485/140‑1 (MQ=255) ggTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACACACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCgtggt < 2:944413/140‑1 (MQ=255) ggTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCgtggt < 2:1503051/140‑1 (MQ=255) ggTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCgtggt < 1:891916/140‑1 (MQ=255) ggTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCgtggt < 2:520866/140‑1 (MQ=255) ggTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCgtggt < 1:434908/140‑1 (MQ=255) ggTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCgtggt < 1:432116/140‑1 (MQ=255) ggTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCgtggt < 1:1421687/140‑1 (MQ=255) ggTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCgtggt < 1:1373598/140‑1 (MQ=255) ggTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAAGGCCTACAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACACACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCgtggg < 2:168428/140‑2 (MQ=255) gTGATGATGCGAGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCgtggtg < 1:17046/140‑1 (MQ=255) tgatgaTGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGAACCGCgtggtg > 1:1115678/1‑139 (MQ=255) tgatgaTGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGAACCGCgtggtg > 1:1115753/1‑139 (MQ=255) tgatgaTGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGAACCGCgtggtg < 2:1115678/139‑1 (MQ=255) tgatgaTGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGAACCGCgtggtg < 2:1115753/139‑1 (MQ=255) tgatgCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGt < 2:1083080/140‑1 (MQ=255) gcgcgcTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTatat > 1:392656/1‑140 (MQ=255) gcgcgcTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTatat > 1:614519/1‑140 (MQ=255) cTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGttt < 2:774554/140‑1 (MQ=255) gCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTcgccg < 2:696521/140‑1 (MQ=255) gAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCgctg > 1:1332506/1‑140 (MQ=255) aGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGTCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAAAATTGATCGTTTTAATGCCCAGCAGGCGCGTAGCTATATGGACCGCGTGGTGGGGTATAAGGTTTCGCCgctgc > 2:1427462/1‑140 (MQ=255) aGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCgctgc > 2:1112001/1‑140 (MQ=255) aGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCgctgc > 1:1267359/1‑140 (MQ=255) aGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCgctgc > 2:1112036/1‑140 (MQ=255) tggtgTTTAACGAAATTACTAAACACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTa < 1:1109271/140‑1 (MQ=255) tggtgTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTa > 1:321150/1‑140 (MQ=255) tggtgTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTa < 1:1109282/140‑1 (MQ=255) tggtgTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTa > 1:68443/1‑140 (MQ=255) tggtgTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTa > 1:68442/1‑140 (MQ=255) tggtgTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTa < 2:582067/140‑1 (MQ=255) gtgtTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATg > 1:178700/1‑140 (MQ=255) gtTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGTATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGa < 2:1686671/140‑1 (MQ=255) tttAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATAAGGTTTCGCCGCTGCTATGGaa > 2:279159/1‑140 (MQ=255) gAACTTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGACTATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCGTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGAt < 2:572789/140‑1 (MQ=255) gAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGAt < 1:1032712/140‑1 (MQ=255) gAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGAt < 2:1356277/140‑1 (MQ=255) aaCGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGAACGTGTTAATGCCCAGCAGCCGCGTCGCTATATGGACCGCGTGGTGGGGAATATGGTTACGCCGCTGCTAAGGAAAAAGATCGCTCGAGGCCt > 2:812504/1‑140 (MQ=255) aTCCGCCAGTCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGATTATTGATCGTGTTAATGCCCATCATGCGCGTCTATTTATGGACCTCGTTGTGGGTTATATTTTTTCGCCGCTGCTATGTAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTATGc < 2:1080993/140‑1 (MQ=255) aTCCGCCAGGCATTTAACACACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGc < 1:297207/140‑1 (MQ=255) aTCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATAGTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGGTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGc < 1:297249/140‑1 (MQ=255) ccGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCg < 2:653716/140‑1 (MQ=255) cATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGtgtg < 1:1407604/140‑1 (MQ=255) aaCCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTg > 2:1225337/1‑140 (MQ=255) aaCCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTg > 2:800961/1‑140 (MQ=255) aaCCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTg > 2:1542485/1‑140 (MQ=255) aaCCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGACGGTg > 2:1225285/1‑140 (MQ=255) aCCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTgg > 1:970917/1‑140 (MQ=255) gggTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCgg > 1:329052/1‑140 (MQ=255) aTCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCgag > 2:99353/1‑140 (MQ=255) cGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCgagcg > 1:1021941/1‑140 (MQ=255) cGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCgagcg > 1:1022628/1‑140 (MQ=255) gtgtTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCTTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGTCGGTTCGCCTGGTGGTCgagcgt > 2:116026/1‑140 (MQ=255) gtgtTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCTGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCgagcgt > 2:116028/1‑140 (MQ=255) gtgtTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCgagcgt > 2:325853/1‑140 (MQ=255) gtgtTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCgagcgt > 1:1689827/1‑140 (MQ=255) gtgtTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCgagcgt > 2:800969/1‑140 (MQ=255) gtgtTAATGACCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCgagcgt > 2:904063/1‑140 (MQ=255) gtTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCgagcgtga > 1:737351/1‑140 (MQ=255) tGCCCAGCAGGAGCGTCTCTTTATGGACCTCGTGCTTGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTAGGGAAAAAGAAGGCTCGTGGCCTGACTTCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTAGCCTGTTGGTAGagcgtgatcgtg < 2:432882/140‑1 (MQ=255) cccAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGaa > 1:1557896/1‑140 (MQ=255) gcagGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTa > 2:1429895/1‑140 (MQ=255) gcagGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTa > 1:660901/1‑140 (MQ=255) gcagGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTa > 1:197065/1‑140 (MQ=255) cgTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGGGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGtt < 1:142459/140‑1 (MQ=255) aTGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGa > 2:1249916/1‑140 (MQ=255) tGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGaa < 1:51525/140‑1 (MQ=255) tGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGaa < 1:790650/140‑1 (MQ=255) | TGATTGGGGGTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAGCTGAATATTGATCGTGTTAATGCCCAGCAGGCGCGTCGCTTTATGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAA > NC_000913/1331424‑1331698 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |