| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 248,221 | T→C | 5.7% | intergenic (+87/+137) | rayT → / ← lfhA | RAYT REP element‑mobilizing transposase; TnpA(REP)/pseudogene, flagellar system protein, promoterless fragment; flagellar biosynthesis |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 248,221 | 0 | T | C | 5.7% | 250.4 / 2.9 | 83 | intergenic (+87/+137) | rayT/lfhA | RAYT REP element‑mobilizing transposase; TnpA(REP)/pseudogene, flagellar system protein, promoterless fragment; flagellar biosynthesis |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/38); new base C (3/2); total (43/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGCGGGGGACGTAACGGATTTTAGTGCCGGGGAGCGTATCATTTCATAATTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTGCACCAATGCTGGATACT > NC_000913/248086‑248358 | ggCGGGGGACGTACCGGATTTTAGTGCCGGGGAGCGTATCATGTCATAATTGTGCGCAGAGGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCg < 1:1498365/140‑1 (MQ=255)ggCGGGGGACGTAACGGATTTTAGTGCCGGGGAGCGTATCATTTCATAATTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCg > 2:1395738/1‑140 (MQ=255) cgtgctaCGTAACTGATATTAGTGCCGGGGAGCGTATCATTTCATAATTGTGCGCAGATGCCTGATGCGTCGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCa < 2:1270623/134‑1 (MQ=25) cGGGGGACGTAACGGATTTTAGTGCCGGGGAGCGTATCATTTCATAATTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCa > 1:828364/1‑140 (MQ=255) gACGTAACGGATTTTAGTGCCGGGGAGCGTATCATTTCATAATTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCgg < 1:1580767/140‑1 (MQ=255) gTAACTGATTTTAGTGCCGGGGAGCGTCTCATTTGATAATTGTGCGCAGCGGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAg < 2:180721/140‑1 (MQ=21) gTAACGGATGTTAGTGCCGGGGAGCGTATCATTTCACACTTGTGCGCAGCTGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAg < 2:1435672/140‑1 (MQ=255) tttAGTGCCGGGGAGCGTATCATTTCATAATTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCa < 2:660932/140‑1 (MQ=255) gtAGTTCCGGGGTGCGTATCATTTCATAAGTGTGCGCTGCTGGCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTTTCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAg < 2:1257042/139‑1 (MQ=21) aGTGCCGGGGAGCGTATCATTTCATAATTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGAt > 1:1149543/1‑140 (MQ=255) gggAGCGTATCATTTCATAATTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGAt > 1:1650561/1‑140 (MQ=255) ggAGCGTATCATTTCATAATTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATg < 1:1235654/140‑1 (MQ=255) cATTTCATAATTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTgg < 2:244017/140‑1 (MQ=255) cATTTCATAATTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTgg < 2:1486673/140‑1 (MQ=255) aTTTCATAATTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGgc < 1:740872/140‑1 (MQ=255) aTTTCATAATTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGgc < 1:233312/140‑1 (MQ=255) aTTTCATAATTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGgc < 1:56857/140‑1 (MQ=255) aTTTCATAATTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGgc < 1:804186/140‑1 (MQ=255) aTTTCATAATTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGgc < 1:1077593/140‑1 (MQ=255) cATAATTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGt > 2:1292162/1‑140 (MQ=255) gtgCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCa < 1:1624242/140‑1 (MQ=255) tgCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAt > 1:176576/1‑140 (MQ=255) tgCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAt > 2:1370050/1‑140 (MQ=255) tgCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAt > 2:536753/1‑140 (MQ=255) tgCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAt > 2:1434444/1‑140 (MQ=255) tgCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAt > 1:439772/1‑140 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGc > 2:1603793/1‑140 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGc > 1:1019970/1‑140 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGc > 1:138824/1‑140 (MQ=255) gcAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGcc > 1:575940/1‑140 (MQ=255) cAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTACGCAGGTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCt > 1:56714/1‑140 (MQ=14) cAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTACGCAGGTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCt > 1:229763/1‑140 (MQ=14) cAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTACGCAGGTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCt > 1:54157/1‑140 (MQ=14) tGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTtgtg > 1:73861/1‑140 (MQ=255) tGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTtgtg > 1:73617/1‑140 (MQ=255) aCGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTg < 1:257804/140‑1 (MQ=255) cGCTAGCGCCTCTTCACAGGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTTTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGa < 1:1112804/140‑1 (MQ=21) gCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGaa < 1:448593/140‑1 (MQ=255) gTCTTCTCATGCCTACAAACTTGGGCCGGATCGGGAGGCCGGATAAGGCGTTTCTGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTTCAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGa < 2:539022/140‑1 (MQ=25) gTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGa < 2:828364/140‑1 (MQ=255) gTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGa < 1:1443150/140‑1 (MQ=255) aTCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGGAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGAt < 1:1129817/140‑1 (MQ=255) cATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATaa < 2:424754/140‑1 (MQ=255) aTGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAg > 1:106528/1‑140 (MQ=255) aTGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAg > 1:1597897/1‑140 (MQ=255) aTGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAg > 1:1597646/1‑140 (MQ=255) tGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAgg > 2:331665/1‑140 (MQ=255) gCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAGGGc > 1:1644062/1‑140 (MQ=255) gCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGc > 2:1532333/1‑140 (MQ=255) gCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGc > 1:591350/1‑140 (MQ=255) gCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGc > 1:593508/1‑140 (MQ=255) ccTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCg > 2:501491/1‑140 (MQ=255) aaCTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCAcg < 2:1268102/140‑1 (MQ=255) gtgCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCa > 1:584707/1‑140 (MQ=255) gtgCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCa > 1:695308/1‑140 (MQ=255) gtgCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCa > 1:695140/1‑140 (MQ=255) gtgCAGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGATCACGCCGCa > 2:841158/1‑140 (MQ=255) tgCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCAt > 1:385115/1‑140 (MQ=255) gtaTCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTTTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCgg < 1:139034/138‑1 (MQ=255) ggATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCgg < 1:13805/140‑1 (MQ=255) ggATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAACATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCgg < 1:943545/140‑1 (MQ=255) ggATCGGTAGGACGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGAGCAGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTCTCAGGCCTACACACTTGTGCCTTAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCgg < 2:116048/140‑1 (MQ=21) aGGCCGGATATGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAGTTCTTCGCAGTTGCCAGCTGCGACTCTGGCGCGTCTTTTCATTACTACACACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTtgtg < 2:328937/140‑1 (MQ=18) ccGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGTACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTGCAc < 2:176576/140‑1 (MQ=255) ccGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTGCAc < 2:695308/140‑1 (MQ=255) ccGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTGCAc < 2:695140/140‑1 (MQ=255) ccGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTGCAc < 2:1285483/140‑1 (MQ=255) cGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTGCAcc > 2:530669/1‑140 (MQ=255) gATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTGCACCaa < 1:102739/140‑1 (MQ=255) aaGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTGCACCAATGc < 2:1650561/140‑1 (MQ=255) gCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTGCACCAATGCTgg < 1:686194/140‑1 (MQ=255) gCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTGCACCAATGCTgg < 1:586989/140‑1 (MQ=255) gCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTGCACCAATGCTgg < 1:686213/140‑1 (MQ=255) gCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTGCACCAATGCTgg > 2:1187278/1‑140 (MQ=255) gCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTGCACCAATGCTgg > 2:148022/1‑140 (MQ=255) gCGTTTATGCAGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTGCACCAATGCTgg > 1:725499/1‑140 (MQ=255) cGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTGCACCAATGCTGGa < 2:212513/140‑1 (MQ=255) ttATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTGCACCAATGCTGGATAc > 1:428187/1‑140 (MQ=255) ttATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTGCACCAATGCTGGATAc > 1:139321/1‑140 (MQ=255) ttATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTGCACCAATGCTGGATAc > 2:549681/1‑140 (MQ=255) tATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTGCACCAATGCTGGATACt > 2:254375/1‑140 (MQ=255) tATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTGCACCAATGCTGGATACt > 2:254361/1‑140 (MQ=255) tATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTGCACCAATGCTGGATACt > 2:768739/1‑140 (MQ=255) | GGCGGGGGACGTAACGGATTTTAGTGCCGGGGAGCGTATCATTTCATAATTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGGCAGTTATGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAAACTTGTGCCTGAACGGTAGGACGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTTGTGCACCAATGCTGGATACT > NC_000913/248086‑248358 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |