| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,525,571 | C→A | 6.7% | P149T (CCG→ACG) | yfeN → | putative outer membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,525,571 | 0 | C | A | 6.7% | 309.0 / 5.9 | 89 | P149T (CCG→ACG) | yfeN | putative outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (27/56); new base A (3/3); total (30/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.01e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
TGGGTGACACCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAGCGAGAAATTCACTCTTACCAACTGGAACGAGTACGAG > NC_000913/2525437‑2525705 | tGGGTGACACCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTc < 2:1637343/140‑1 (MQ=255) ggTGACACCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCtt > 1:690483/1‑140 (MQ=255) ggTGACACCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCtt > 2:869081/1‑140 (MQ=255) ggTGACACCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCtt > 1:979300/1‑140 (MQ=255) ggTGACACCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAAACGTTCtt > 2:942449/1‑140 (MQ=255) ggTGACACCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAAACGTTCtt > 2:942441/1‑140 (MQ=255) ggTGACACCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAAACGTTCtt > 2:942241/1‑140 (MQ=255) acacCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCt < 1:1530959/140‑1 (MQ=255) acacCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCt < 2:1624843/140‑1 (MQ=255) acacCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCt < 2:1624645/140‑1 (MQ=255) acacCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCt < 1:918905/140‑1 (MQ=255) acacCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCt < 1:1009379/140‑1 (MQ=255) acacCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCt < 1:253044/140‑1 (MQ=255) acacCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCt < 1:1347671/140‑1 (MQ=255) acacCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCt < 1:1347591/140‑1 (MQ=255) acacCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCt < 1:1320983/140‑1 (MQ=255) acacCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCt < 1:1228913/140‑1 (MQ=255) acacCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCt < 1:1230798/140‑1 (MQ=255) cacCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAATCCGTTCTTTGCTa > 2:77012/1‑140 (MQ=255) acCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTaa < 2:1164608/140‑1 (MQ=255) acCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTaa < 2:101266/140‑1 (MQ=255) ccGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAg < 1:439054/140‑1 (MQ=255) ccGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAg < 1:440644/140‑1 (MQ=255) ggATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCg < 1:1216819/140‑1 (MQ=255) ggATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCg < 1:1216967/140‑1 (MQ=255) gATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGt > 2:1305603/1‑140 (MQ=255) tAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTtata < 1:1424159/140‑1 (MQ=255) aTCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACa > 2:1142818/1‑140 (MQ=255) tcTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTATGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCATTGCTAAGCGTTATACAGATCaa < 1:700415/139‑1 (MQ=255) aCTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCaa < 2:1017295/140‑1 (MQ=255) aCTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAAACGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCaa < 1:942241/140‑1 (MQ=255) aCTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAAACGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCaa < 1:942441/140‑1 (MQ=255) aCTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAAACGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCaa < 1:942449/140‑1 (MQ=255) cTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCaaa > 1:1385625/1‑140 (MQ=255) tGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAAcc < 2:1179601/140‑1 (MQ=255) tGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAAcc < 2:1127749/140‑1 (MQ=255) cGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTac > 2:634987/1‑140 (MQ=255) gTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTaca < 1:1079730/140‑1 (MQ=255) aCGGTTCTGCGAATCGCTTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGAACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAATCGTTATACAGCTCAAACCTATAAAACAGGCGACAAc > 2:1238110/1‑140 (MQ=255) aCGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACAGGCGACAAc > 2:341680/1‑140 (MQ=255) cTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTAt > 2:1389963/1‑140 (MQ=255) cTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTAt > 2:1389901/1‑140 (MQ=255) tGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATg > 1:941576/1‑140 (MQ=255) cGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTc < 2:574802/140‑1 (MQ=255) cGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTACACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTc < 2:40729/140‑1 (MQ=255) aaTCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGc > 1:457857/1‑140 (MQ=255) cgcgTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCgg < 1:635099/140‑1 (MQ=255) gAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTggg > 1:1313439/1‑140 (MQ=255) tttCCACGTCGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTg < 2:707848/140‑1 (MQ=255) tttCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTg < 2:767133/140‑1 (MQ=255) tttCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTg < 1:1389963/140‑1 (MQ=255) tttCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTg < 1:1389901/140‑1 (MQ=255) ttgccACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGATCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTg < 1:536687/137‑1 (MQ=255) gacgaTATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTa < 2:526710/140‑1 (MQ=255) gacgaTATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTa < 2:289642/140‑1 (MQ=255) gacgaTATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTa < 1:94842/140‑1 (MQ=255) gacgaTATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTa < 1:121126/140‑1 (MQ=255) gacgaTATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTa < 1:799826/140‑1 (MQ=255) gacgaTATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTa < 1:72898/140‑1 (MQ=255) gacgaTATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTa < 1:477311/140‑1 (MQ=255) gacgaTATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTa < 1:670869/140‑1 (MQ=255) gacgaTATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTa < 1:670833/140‑1 (MQ=255) gacgaTATGTTCCACAACGCTATCGGCAACAATTTCACCGCCACCGGTTGGAGGTTCAAACCGTACTTTGCAAACCGTTATACAGATCAAACCAATAACACTCCCCACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTa < 2:1541910/140‑1 (MQ=255) tatGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACt < 1:1272765/140‑1 (MQ=255) tatGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACt < 2:724108/140‑1 (MQ=255) tACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTggg > 1:1021436/1‑140 (MQ=255) tACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTggg < 2:765163/140‑1 (MQ=255) tACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTggg < 2:331552/140‑1 (MQ=255) ggTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAg > 2:1125294/1‑140 (MQ=255) ggTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAg > 2:1125178/1‑140 (MQ=255) tATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAGCg < 1:754571/140‑1 (MQ=255) tCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGGCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAGCgag > 2:130084/1‑140 (MQ=255) tCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAGCgag > 2:179550/1‑140 (MQ=255) gCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAGCGAGaaa > 1:1307462/1‑140 (MQ=255) cAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACTACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAGCGAGAAATTCa < 2:1687535/140‑1 (MQ=255) aaTTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAGCGAGAAATTCAc > 1:1625588/1‑140 (MQ=255) aaTTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCGATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAGCGAGAAATTctc > 1:1625479/1‑138 (MQ=255) tttCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAGCGAGAAATTCActc < 2:1307671/140‑1 (MQ=255) tttCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAGCGAGAAATTCActc > 1:595389/1‑140 (MQ=255) aCCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAGCGAGAAATTCACTCTTAc > 2:423203/1‑140 (MQ=255) aCCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAGCGAGAAATTCACTCTTAc > 2:401959/1‑140 (MQ=255) cGGTTGGTGGTTCACACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAGCGAGAAATTCACTCTTACCAACTGGa < 2:1627505/140‑1 (MQ=255) cGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACTACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAGCGAGAAATTCACTCTTACCAACTGGa < 2:1044819/140‑1 (MQ=255) cGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAGCGAGAAATTCACTCTTACCAACTGGa < 1:1654277/140‑1 (MQ=255) cGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAGCGAGAAATTCACTCTTACCAACTGGa > 2:348756/1‑140 (MQ=255) ggTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAGCGAGAAATTCACTCTTACCAACTGGaa < 2:910915/140‑1 (MQ=255) tggtTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAGCGAGAAATTCACTCTTACCAACTGGAacgagta < 1:584651/140‑1 (MQ=255) ggtTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAGCGAGAAATTCACTCTTACCAACTGGAacgagtac < 1:469274/140‑1 (MQ=255) tCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAGCGAGAAATTCACTCTTACCAACTGGAacgagtacgag < 1:990710/140‑1 (MQ=255) | TGGGTGACACCGGATTTAATCTCTACTTGCATGCGTATGGCACCTACGGTTCTGCGAATCGCGTGAATTTCCACGACGATATGTTCCTGTACGGTATCGGCTACAATTTCACCGGCAGCGGTTGGTGGTTCAAACCGTTCTTTGCTAAGCGTTATACAGATCAAACCTATTACACTGGCGACAACGGCTATGTCGCCGGCTGGGTTGCAGGTTACAACTTTATGCTGGGCAGCGAGAAATTCACTCTTACCAACTGGAACGAGTACGAG > NC_000913/2525437‑2525705 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |