| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,928,373 | G→T | 5.1% | G49C (GGT→TGT) | sdaC → | putative serine transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,928,373 | 0 | G | T | 5.1% | 291.0 / 2.2 | 78 | G49C (GGT→TGT) | sdaC | putative serine transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/36); new base T (2/2); total (40/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.51e-01 | |||||||||||
ACGACTCAAACCAGCACGATTGCGTCGAAAGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATCACCGAGGTTGTAGAAGA > NC_000913/2928235‑2928500 | aCGACTCAAACCAGCACGATTGCGTCGAAAGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCgg > 2:254579/1‑140 (MQ=255) aaaCCAGCACGATTGCGTCGAAAGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATc < 2:792047/140‑1 (MQ=255) aaaCCAGCACGATTGCGTCGAAAGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATc < 2:608104/140‑1 (MQ=255) aaaCCAGCACGATTGCGTCGAAAGACTCTCGTAGAGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATc < 2:1673124/140‑1 (MQ=255) gctcGATTGCGTTGAAAGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCCAGTCAGACCCCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTg < 2:1626198/137‑1 (MQ=255) gCACGATTGCGTCGAAAGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTg < 2:217022/140‑1 (MQ=255) cACGATTGCGTCGAAAGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCTGTATGATCCCGCTGa > 2:1181516/1‑140 (MQ=255) cACGATTGCGTCGAAAGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCTGTATGATCCCGCTGa > 2:1183605/1‑140 (MQ=255) cACGATTGCGTCGAAAGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGa > 1:1435839/1‑140 (MQ=255) aCGATTGCGTCGAAAGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGat < 2:757215/140‑1 (MQ=255) gATTGCGTCGAAAGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGatca < 1:67642/140‑1 (MQ=255) cctGCGTCGAAAGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGatcat < 1:861055/138‑1 (MQ=255) aTTGCGTCGAAAGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGatcat < 1:1186804/140‑1 (MQ=255) aTTGCGTCGAAAGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGatcat < 1:1185994/140‑1 (MQ=255) ttGCGTCGAAAGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGatcatc < 2:1075605/140‑1 (MQ=255) ttGCGTCGAAAGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGatcatc > 1:1188279/1‑140 (MQ=255) gTCGAAAGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATgg < 1:1335206/140‑1 (MQ=255) gTCGAAAGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATgg < 1:1065038/140‑1 (MQ=255) tCGAAAGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGc < 1:613484/140‑1 (MQ=255) tCGAAAGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGc < 1:613142/140‑1 (MQ=255) aaaGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTAt > 2:502323/1‑140 (MQ=255) aaaGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTAt > 2:502271/1‑140 (MQ=255) tcGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGt > 1:266222/1‑140 (MQ=255) tGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGa > 1:1569475/1‑140 (MQ=255) tGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGa > 1:484704/1‑140 (MQ=255) tGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGa > 1:1648780/1‑140 (MQ=255) tGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGa > 1:198764/1‑140 (MQ=255) ccTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATg > 2:1276593/1‑140 (MQ=255) ccTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATg > 1:1457766/1‑140 (MQ=255) tGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCg > 2:844727/1‑105 (MQ=255) tGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCg < 1:844727/105‑1 (MQ=255) tGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGAc > 1:1176321/1‑140 (MQ=255) acagacaCCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGc < 1:404719/140‑1 (MQ=255) acagacaCCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGc < 1:1553215/140‑1 (MQ=255) acacCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCAc > 1:1168659/1‑140 (MQ=255) acacCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCAc > 1:630671/1‑140 (MQ=255) tgtgGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGc > 1:1030763/1‑140 (MQ=255) tgtgGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGc > 1:1030721/1‑140 (MQ=255) tgtgGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGc > 1:1620551/1‑140 (MQ=255) aTGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGAc < 1:78831/140‑1 (MQ=255) aTGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGAc < 1:1464240/140‑1 (MQ=255) aTGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGAc < 1:1627727/140‑1 (MQ=255) aTGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGAc < 1:1627726/140‑1 (MQ=255) cTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCTGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCg > 1:1041063/1‑140 (MQ=255) cTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCg > 2:1351970/1‑140 (MQ=255) gggCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCt < 2:1611073/140‑1 (MQ=255) tttACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCTGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTa < 1:1181516/140‑1 (MQ=255) tttACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCTGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTa < 1:1183605/140‑1 (MQ=255) tttACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTa < 1:65116/140‑1 (MQ=255) tttACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTa < 1:1316852/140‑1 (MQ=255) tttACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTa < 1:1318083/140‑1 (MQ=255) tttACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTa < 2:1618587/140‑1 (MQ=255) tttACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTa < 1:65115/140‑1 (MQ=255) tttACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTa < 1:663560/140‑1 (MQ=255) tttACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTa < 1:45831/140‑1 (MQ=255) tttACGGCACGGCAATCGGCGCGGGAGTGCTGTTACTGCCTATCTACGCCGTTGTTGGCGGTATGATACCGCTGATCATCATGGATATCCTTGCGTTCCCGATGACTTTTTTTGCTCACCGCTGCCTGACTCGCTTCGTa < 1:344756/140‑1 (MQ=255) ggcacggcaATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTc < 1:350191/140‑1 (MQ=255) ggcacggcaATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTc < 1:350099/140‑1 (MQ=255) gcacggcaATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCTGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACTTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCt > 1:1481921/1‑140 (MQ=255) cggcaATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGt > 1:158080/1‑140 (MQ=255) ggCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAAccc > 2:1100288/1‑140 (MQ=255) ggCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAAccc > 2:266652/1‑140 (MQ=255) ggCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAAccc > 2:266775/1‑140 (MQ=255) ggCGCGGGCGTGCGGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTCTCCTTGCGTTCCCGAGGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCGTCGTACTGTCTGGTAAAAAccc > 2:332574/1‑140 (MQ=255) gcgGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCggg > 2:510405/1‑140 (MQ=255) gggCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCg > 2:293335/1‑140 (MQ=255) gggCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCg > 2:1117847/1‑140 (MQ=255) cTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGAGAAGACAt > 2:817490/1‑140 (MQ=255) gCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGATTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATCAACGAgg > 2:190231/1‑140 (MQ=255) ccAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATCACCGAGGt < 1:1276593/140‑1 (MQ=255) tCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCTTGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATCACCGAGGTTGTa > 1:807265/1‑140 (MQ=255) tCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATCACCGAGGTTGTa > 2:398937/1‑140 (MQ=255) tCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATCACCGAGGTTGTa > 2:399384/1‑140 (MQ=255) tCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATCACCGAGGTTGTa > 2:1061373/1‑140 (MQ=255) tCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATCACCGAGGTTGTa > 2:55322/1‑140 (MQ=255) tCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATCACCGAGGTTGTa > 2:1660644/1‑140 (MQ=255) tCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATCACCGAGGTTGTa > 2:1393738/1‑140 (MQ=255) gCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATCACCGAGGTTGTagaaga < 2:569722/140‑1 (MQ=255) gCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATCACCGAGGTTGTagaaga < 2:570072/140‑1 (MQ=255) | ACGACTCAAACCAGCACGATTGCGTCGAAAGACTCTCGTAGTGCCTGGCGCAAGACAGACACCATGTGGATGCTGGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATCACCGAGGTTGTAGAAGA > NC_000913/2928235‑2928500 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |