| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,076,880 | C→A | 5.2% | D193Y (GAT→TAT) | yggP ← | putative Zn‑binding dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,076,880 | 0 | C | A | 5.2% | 426.1 / 6.3 | 116 | D193Y (GAT→TAT) | yggP | putative Zn‑binding dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (54/56); new base A (3/3); total (57/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
TTCACATACACCAGCTCAATGCCTTTACTGGCCGCCAGTTCCACCGGCAGCAGCTTCTGTACCTGCGCCAGACGTTTGTCGTCGATATCGACCACCACCACCCGCGACGGTTGTATGCCGCCGTTAATGGCGTAATCGATAGCGCCAATGCCCATCGGACCTGCACACGCCAGCAGTGCAATATTGCCGCCAGGTTTGACGCCCATGCGATGCTCATAAACATATTGCGTGGTGTGATAATTGGCATGATAAGCACCAATAATGCAGCAC > NC_000913/3076744‑3077013 | ttCACATACACCAGCTCAATGCCTTTACTGGCCGCCAGTTCCACCGGCAGCAGCTTCTGTACCTGCGCCAGTCGTTTGTCGTCGATATCGACCACCACCACCCGCGACGGTTGTATGCCGCCGTTAATGGCGTAATCGAt > 1:1640084/1‑140 (MQ=255)ttCACATACACCAGCTCAATGCCTTTACTGGCCGCCAGTTCCACCGGCAGCAGCTTCTGTACCTGCGCCAGACGTTTGTCGTCGATATCGACCACCACCACCCGCGACGGTTGTATGCCGCCGTTAATGGCGTAATCGAt > 2:341601/1‑140 (MQ=255)ttCACATACACCAGCTCAATGCCTTTACTGGCCGCCAGTTCCACCGGCAGCAGCTTCTGTACCTGCGCCAGACGTTTGTCGTCGATATCGACCACCACCACCCGCGACGGTTGTATGCCGCCGTTAATGGCGTAATCGAt > 1:1639985/1‑140 (MQ=255)ttCACATACACCAGCTCAATGCCTTTACTGGCCGCCAGTTCCACCGGCAGCAGCTTCTGTACCTGCGCCAGACGTTTGTCGTCGATATCGACCACCACCACCCGCGACGGTTGTATGCCGCCGTTAATGGCGTAATCGAt > 1:1551024/1‑140 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(MQ=255) ccgTTAATGGCGTAATCGATAGCGCCAATGCCCATCGGACCTGCACACGCCAGCAGTGCAATATTGCCGCCAGGTTTGACGCCCATGCGATGCTCATAAACATATTGCGTGGTGTGATAATTGGCATGATAAGCACCaat > 1:6616/1‑140 (MQ=255) ccgTTAATGGCGTAATCGATAGCGCCAATGCCCATCGGACCTGCACACGCCAGCAGTGCAATATTGCCGCCAGGTTTGACGCCCATGCGATGCTCATAAACATATTGCGTGGTGTGATAATTGGCATGATAAGCACCaat > 2:1238419/1‑140 (MQ=255) ttaTGGCGTAATCGATAGCGCCAATGCCCATCGGACCTGCACACGCCAGCAGTGCAATATTGCCGCCAGGTTTGACGCCCATGCGATGCTCATAAACATATTGCGTGGTGTGATAATTGGCATGATAAGCACCAATAATg < 1:978364/138‑1 (MQ=255) tAATGGCGTAATCGATAGCGCCAATGCCCATCGGACCTGCACACGCCAGCAGTGCAATATTGCCGCCAGGTTTGACGCCCATGCGATGCTCATAAACATATTGCGTGGTGTGATAATTGGCATGATAAGCACCAATAATg < 1:1262580/140‑1 (MQ=255) tAATGGCGTAATCGATAGCGCCAATGCCCATCGGACCTGCACACGCCAGCAGTGCAATATTGCCGCCAGGTTTGACGCCCATGCGATGCTCATAAACATATTGCGTGGTGTGATAATTGGCATGATAAGCACCAATAATg < 1:474858/140‑1 (MQ=255) tAATGGCGTAATCGATAGCGCCAATGCCCATCGGACCTGCACACGCCAGCAGTGCAATATTGCCGCCAGGTTTGACGCCCATGCGATGCTCATAAACATATTGCGTGGTGTGATAATTGGCATGATAAGCACCAATAATg < 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |