| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,279,147 | G→T | 5.1% | L78F (TTG→TTT) | kbaZ → | tagatose 6‑phosphate aldolase 1, kbaZ subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,279,147 | 0 | G | T | 5.1% | 286.3 / 2.2 | 78 | L78F (TTG→TTT) | kbaZ | tagatose 6‑phosphate aldolase 1, kbaZ subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (27/47); new base T (2/2); total (29/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.25e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.94e-01 | |||||||||||
CTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGGAT > NC_000913/3279008‑3279274 | cTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTGATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTGTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTg > 2:421108/1‑140 (MQ=255) cAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAAt > 2:1214527/1‑140 (MQ=255) cAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAAt > 1:1198964/1‑140 (MQ=255) cAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAAt > 1:638845/1‑140 (MQ=255) cGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAgg > 1:1687282/1‑140 (MQ=255) gCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGa < 1:871194/140‑1 (MQ=255) gCCACTGCAAACCAAACGCCCTTACTCATTGAAGCAACCTCCAAACACGTAGACCAGTTCGCCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCACGa < 2:792329/140‑1 (MQ=255) cAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATg > 1:817677/1‑140 (MQ=255) gTGCAAACCAATCGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTGTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCg > 2:1175176/1‑140 (MQ=255) gTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCg > 1:1252156/1‑140 (MQ=255) gTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCg > 1:961713/1‑140 (MQ=255) tGCAAACCAAACGCCGTTAATGATTGAAGCAAACTCCAATCAGTTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTAAGCGGCTTAGTTTGTCAGCACGCCGACTCGATGAATTTCCCGCAGGATGCGt > 2:287002/1‑140 (MQ=255) tGCAAACCAAACGCCGATACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGCTGCGt > 2:287230/1‑140 (MQ=255) caaaccaaacGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTg < 1:883307/140‑1 (MQ=255) caaaccaaacGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTg < 1:883314/140‑1 (MQ=255) accaaacGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGAtt > 1:1476891/1‑140 (MQ=255) accaaacGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGAtt > 1:1624613/1‑140 (MQ=255) accaaacGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGAtt < 2:1465656/140‑1 (MQ=255) accaaacGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGAtt > 2:1525276/1‑140 (MQ=255) caaacGCCGGTACTGATTGAAGCAACCTCCAAGCAGCTAGACCAGTTCGGCGGTGATACCGGACTGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCGGGATGCCTGGATTCt > 2:1219686/1‑140 (MQ=255) gTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGgtggtg < 2:320104/140‑1 (MQ=255) gTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGgtggtg < 2:323174/140‑1 (MQ=255) cttACTGATTGAATCAACCAACAACAAGTAAGACCTGTTCGTCGGTTATACCGGCCAGACTCCCGCCGATTTTCGCGGATATGTTTGACAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCACGATGCGATGATTCTGGgtggtg < 2:1644444/139‑1 (MQ=255) tacagcctGAAGCAACCACCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGCTTATACCGGTATGACGCCCGCAGTTTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGATCGCCGAATCGTTGAATTTCCCGCAGGATTCGTTGATTCTGGGTGGTGAc < 1:1656350/133‑1 (MQ=255) tACTGATTGAAGCTAGCTCCAATCAGGTAGACCATTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAAGTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGAc < 2:381880/140‑1 (MQ=255) tACTGATTGAAGCAACCTCCCTTCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTGATACCGGACTGACGCCCGCCGAATTGCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCCTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGAc < 2:381933/140‑1 (MQ=255) tACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTTAATTTCCCGCAGTATGCGTTGATTCTGGGTGGTGAc > 2:1316254/1‑140 (MQ=255) tACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTTAATTTCCCGCAGTATGCGTTGATTCTGGGTGGTGAc > 2:659380/1‑140 (MQ=255) tACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACACGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGAc < 2:1514792/140‑1 (MQ=255) gATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATc < 1:955622/140‑1 (MQ=255) aTTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATGCTGGGTGGTGACCATCt > 1:257734/1‑140 (MQ=255) tGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTgg > 2:302393/1‑140 (MQ=255) tGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTgg > 1:515033/1‑140 (MQ=255) tCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCg < 1:1011753/140‑1 (MQ=255) aGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCaa < 1:1014336/140‑1 (MQ=255) aGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCaa < 1:1521983/140‑1 (MQ=255) aGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTATGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCaa < 1:526144/140‑1 (MQ=255) aGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAActgcccg < 1:1367911/140‑7 (MQ=255) gTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTgccgg < 1:1083393/140‑1 (MQ=255) gTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTgccgg < 1:232653/140‑1 (MQ=255) gTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGAGTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTgccgg > 2:241794/1‑140 (MQ=255) cgtCGGCGGGTCGACCGGCATGACGCCCGCCGCTTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTgccgg < 1:1083516/138‑1 (MQ=255) ttCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTgccggc < 1:36117/140‑1 (MQ=255) ttCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTgccggc < 1:36159/140‑1 (MQ=255) ttCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTgccggc < 1:36139/140‑1 (MQ=255) ttCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTgccggc < 1:36125/140‑1 (MQ=255) ttCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTgccggc < 1:1312801/140‑1 (MQ=255) ttCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGGGGTGTCCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTgccggc > 1:1687913/1‑140 (MQ=255) tCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTgccggcc > 1:1169620/1‑140 (MQ=255) cgtttATAACGGAAAGACGCCCGCAGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCACGCAGGATGCGTTGTTTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAATCCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTc < 2:368246/137‑1 (MQ=255) cggTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTc < 1:951114/140‑1 (MQ=255) ttATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAgg > 2:1278876/1‑140 (MQ=255) ataCCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCa < 1:1534180/140‑1 (MQ=255) ataCCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCa > 1:296211/1‑140 (MQ=255) ataCCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCa < 1:755584/140‑1 (MQ=255) ataCCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCa < 1:745835/140‑1 (MQ=255) ataCCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCa < 1:744904/140‑1 (MQ=255) taCCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCaa < 2:415652/140‑1 (MQ=255) taCCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCaa < 2:1184158/140‑1 (MQ=255) taCCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCaa < 2:1181565/140‑1 (MQ=255) ggAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGc < 1:837574/140‑1 (MQ=255) ggAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGc < 2:1070042/140‑1 (MQ=255) aTGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCaa > 1:607328/1‑140 (MQ=255) aTGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCaa > 1:607206/1‑140 (MQ=255) cgcccgccGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGcc > 1:756141/1‑140 (MQ=255) gcccgccGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTTAATTTCCCGCAGTATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCg < 1:1316254/140‑1 (MQ=255) gcccgccGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTTAATTTCCCGCAGTATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCg < 1:659380/140‑1 (MQ=255) cgATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGAtgatt < 2:1102984/140‑1 (MQ=255) cgATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGAtgatt < 2:1103484/140‑1 (MQ=255) cgATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGAtgatt < 2:163615/140‑1 (MQ=255) cgATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGAtgatt < 2:718900/140‑1 (MQ=255) cgATTTTCGCGGCTTTGTTTGACAGCTCGCCGACACTATGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGACATACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCTGCCAATGGCCAATGCCGAtgatt < 2:1500786/140‑1 (MQ=255) ttCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGAtgatttgatt < 1:1104149/140‑1 (MQ=255) ttCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGAtgatttgatt < 2:696522/140‑1 (MQ=255) tttgtttgTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTa < 2:690649/140‑1 (MQ=255) cttgtttgtCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCTTAGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACATGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTa < 2:377719/139‑1 (MQ=255) attgtttgtCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCTCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGTGCCAAACCTCTGGCAAAACCTGCCGGCCGATAAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCtt < 2:377743/139‑2 (MQ=255) tgtttgtCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACg > 2:1578553/1‑140 (MQ=255) cGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGGAt > 1:1153349/1‑140 (MQ=255) | CTGCAATCCGCTACGCCAGTGCAAACCAAACGCCGTTACTGATTGAAGCAACCTCCAATCAGGTAGACCAGTTCGGCGGTTATACCGGAATGACGCCCGCCGATTTTCGCGGCTTTGTTTGTCAGCTCGCCGACTCGTTGAATTTCCCGCAGGATGCGTTGATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGGAT > NC_000913/3279008‑3279274 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |