| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,412,791 | 0 | G | T | 31.1% | 140.2 / 26.9 | 74 | L135F (TTG→TTT) | yjfM | DUF1190 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (12/39); new base T (23/0); total (35/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.01e-10 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CAACGCCAAAACGGCATTTTATGCCGATGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGCCCAGTCTGGCGCAGCACTTCTGGTGATTACTCCTGGCGCTCCGGTTCTGGCAAAAAAGAGTCT > NC_000913/4412662‑4412929 | caacGCCAAAACGGCATTTTATGCCGATGTTCCGAAGACTATGACACAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGGTGGATCCCGGTCGTTTAGGGA‑TTTTTTTTAAG‑cacgg > 1:1546099/1‑136 (MQ=255) aacGCCAAAACGGCATTTTATGCCGATGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGt < 2:1372790/140‑1 (MQ=255) aacGCCAAAACGGCATTTTATGCCGATGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGt < 2:1373742/140‑1 (MQ=255) cGCCAAAACGGCATTTTATGCCGATGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGTTCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTTTTTAT‑CCggggtt > 2:1516402/1‑137 (MQ=255) cGCCAAAACGGCATTTTATGCCGATGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGT‑TTTTTGTTAAT‑CCggggtt > 1:116954/1‑137 (MQ=255) cGCCAAAACGGCATTTTATGCCGATGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTATGGT‑TTTTTTTTTAG‑ACGGGGTa > 1:116910/1‑140 (MQ=255) cGCCAAAACGGCATTTTATGCCGATGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTGTCTGGC‑TTTTTTTTAAG‑GCGGGTTa > 2:311319/1‑140 (MQ=255) cGCCAAAACGGCATTTTATGCCGATGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTGTCTGGA‑TTTTTTTTAAG‑ACGGGTTa > 1:289641/1‑140 (MQ=255) aaaCGGCATTTTATGCCGATGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑ATTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGt > 2:768372/1‑140 (MQ=255) cATTTTATGCCGATGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCAACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTGTGGA‑TTTTTTTTTAA‑CCCGGGTATTCGTTAAgtt > 1:1727998/1‑138 (MQ=255) aTTTTATGCCGATGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATc < 2:1017436/140‑1 (MQ=255) aTGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTTGT‑TTTTTTTTTAT‑ACGGGTTATTAGTTAAAATAGCGATGATCCg > 1:1023200/1‑140 (MQ=255) aTGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTGTCTGGA‑TTTTTTTTTAT‑ACCGGGTATTATTAAAGATAGCGAttttccg > 1:1022997/1‑134 (MQ=255) tGTTCCGAAGACTATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAAGTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTTAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCgt < 2:1484664/140‑1 (MQ=255) tGTTCCGAAGAATATGTCTCAGCAGAACTGTCAGTCTATGTACGAAAATTGCTACTACGACATTGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCgt < 2:1554330/140‑1 (MQ=255) tGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACTGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCgt < 2:914014/140‑1 (MQ=255) tGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCgt < 2:913763/140‑1 (MQ=255) tGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCgt < 2:963807/140‑1 (MQ=255) tGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCgt < 1:672546/140‑1 (MQ=255) tGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCgt < 2:975788/140‑1 (MQ=255) tGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCgt < 2:1246429/140‑1 (MQ=255) tGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCgt < 1:295592/140‑1 (MQ=255) tGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCgt < 2:1562891/140‑1 (MQ=255) tGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCgt < 2:1060753/140‑1 (MQ=255) tGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCgt < 1:1078415/140‑1 (MQ=255) tGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTGTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCgt < 2:1554336/140‑1 (MQ=255) ttCCGACGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTAGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCgttt < 2:1387904/140‑1 (MQ=255) ttCCGAAGAATATGTCTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCgttt < 2:1246235/140‑1 (MQ=255) gaaTATGACACAGCAGAACTGTCAGTCTAAGAACGAAAATTGCTACTACGACACTGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCGGGA‑TTTTTGTTAAT‑CCGGGTTTTTGGTTAAGTAGGCGATGATCCGTTTGTTtata > 2:647474/1‑140 (MQ=255) cTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTGTGTGGATTTTTTTTTAAC‑CCGGGTT‑TTAGTAAAGATAGCGCTGAGCCCTTTGTTTTTaaaaaccgc > 1:1328891/1‑133 (MQ=255) cTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTGTGTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGGTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAgcggc > 1:839749/1‑140 (MQ=255) agcagAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTGTGGG‑TTTTTTTTTAT‑GCGGGGTATTGGTGAAGATCGCGATGTGCCGTTTGTTTTTTAAAGCGGCGGt > 1:4482/1‑140 (MQ=255) agcagAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTTTTAAG‑CCGGGTTATTAGGAAAGATAGCGATGAGCCGTTTGTTTATAAAAGCGGCGGt > 1:730067/1‑140 (MQ=255) agcagAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGt < 1:31198/140‑1 (MQ=255) agcagAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTATGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTTTTGGTAAAGATAGCGATTAGCCGGTTGTTTATAAAAGcggcggg > 1:872871/1‑139 (MQ=255) agcagAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTGTGTGGG‑TTTTTTTTAAT‑GCGGGGTATTAGTTAAGATCGCGGTGAGCCGTTTGTTTTTAAAAACGGCGGt > 1:941536/1‑140 (MQ=255) agcagAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTGTGTGGG‑TTTTTGTTAAGCCCGGGTTA‑TCGGAAAGATCGCGATTGGCCGGGTGTTTTTAACAGcggcggg > 1:729521/1‑139 (MQ=255) agcagAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTGTGTGGA‑GTTTTTTTAAG‑GCGGGGTATGAGTAAATATAGCGGTGGGGCGGGTGGTTTTAACAACGGGGGt > 1:1016645/1‑140 (MQ=255) agcagAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTGTGGGGA‑TTTTTTTTAAT‑CCCGGGTTTTAGTAAAGATAGCGTTGTGCCGGTTTTTTTTAAAAAcggcggg > 1:1719000/1‑139 (MQ=255) agcagAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTGTCTGGA‑TTTTTTTTAAT‑CCGGGGTATTAGTTAATATAGCGATGAGCCGGTTGTTTATAAAAACGGCGGt > 1:623619/1‑140 (MQ=255) agcagAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTGGTTGGG‑TTTTTTTTAAG‑CCCGGGTTTTAGTAAAGATCGCGGTGATGCGGTTGTTTATAACAGCGGCGGt > 1:1039194/1‑140 (MQ=255) cagAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTGTTGA‑TTTTTTTTTAT‑GCGGGGTTTTAGTAAATATCGCGCTGAGCCGGGTGTTTTTAAAAGcggggggtg > 1:1006965/1‑137 (MQ=255) cagAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTGTGTGGA‑TTTTTTTTAAA‑CCCGGTTATTAGTAAAAATCACGATGAGCCGGTTGTTTATAAAAGccgcgggta > 1:1009101/1‑137 (MQ=255) cagAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTGTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCCGGGTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGGTTGTTTATAACAGCGGCGGTTc > 1:830096/1‑140 (MQ=255) gTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGGGGTTCCTCtttt < 2:166827/140‑1 (MQ=255) aGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTGTGGGGA‑TTTTTTTTAAT‑CCGGGGTGTTCGTAAAGAAAGCCAAGAGCCCGTTGTTTTTTAAAACGGCGGGTCCGAATTTGCt > 1:356823/1‑140 (MQ=255) gTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCtt < 1:93715/140‑1 (MQ=255) gTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCtt < 1:918332/140‑1 (MQ=255) gTACGATAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGcc < 2:1741866/140‑1 (MQ=255) gTACGAAAATTGCTACTACGACATTGTAGAACAGAGTTGGTTCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTTAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGcc < 2:1485904/140‑1 (MQ=255) gTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGcc < 1:1003202/140‑1 (MQ=255) gTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGcc < 1:1471679/140‑1 (MQ=255) gTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGcc < 1:1094022/140‑1 (MQ=255) gTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGcc < 1:467144/140‑1 (MQ=255) aaaaTTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAT‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACATCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGCCCAGTc > 2:1641210/1‑140 (MQ=255) aaaaTTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTGTGTGGT‑TTTTTTTTTAT‑CCGGGGTTTTAGTTAAGATAGCGATGATGCGTTTGTTTTTAAAAACGGCGGGTCCTCGTTTGGGTAGCGcccccgc > 1:1132634/1‑136 (MQ=255) gCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTTTTAAG‑CCGGGTTTTTAGTAAAGATCGCGATTAGCCGCTTTTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTTCTTCGCGCCCAGTCTGgcgc > 2:1576195/1‑140 (MQ=255) gCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGCCCAGTCTGgcgc < 2:696238/140‑1 (MQ=255) gCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGCCCAGTCTGgcgc < 1:1026913/140‑1 (MQ=255) cGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGCCCAGTCTGGCGCAGCACtt < 2:655007/140‑1 (MQ=255) agTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTTTTAAT‑CCGGGGTATTAGTAAAGATCGCCATGATCCGGTTGTTTATAACAGCGGCGGTTACACTTTTGCTTAGCGCCCAGTCTGGCGCAGCACATCTGGTGATTaaaccag > 2:541156/1‑134 (MQ=255) agTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTTTTAAG‑CCGGGTTATTCGGAAAGATCGCGATGAGCCGGTTGTTTATTAAAGCGGCGGTTGCTCTTTTGCTTCGCGCCCAGTCTGGCGCAGCACTTCTGGTGATTACTccag > 2:1719753/1‑138 (MQ=255) cGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCCGGTTATTAGGAAATATAGCGCTGAGCCCTTTTTTTATAACATCGGCGGTTCCACTTTTTCTTAGCGCCCAGTCTGGCGCACCACATCAGGTGTTTACTCCAGGCGCACCCGt > 2:528343/1‑140 (MQ=255) gTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGCCCAGTCTGGCGCAGCTCTTCTGGTGATTACTCCTGGCGCTCCGGTTc < 2:206094/140‑1 (MQ=255) gTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGCCCAGTCTGGCGCAGCACTTCTGGTGATTACTCCTGGCGCTCCGGTTc < 2:206231/140‑1 (MQ=255) ttCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGCCCAGTCTGGCGCAGCACTTCTGGTGATTACTCCTGGCGCTCCGGTTCTGGCa < 1:1672716/140‑1 (MQ=255) tGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGCCCAGTCTGGCGCAGCACTTCTGGTGATTACTCCTGGCGCTCCGGTTCTGGCaaaa < 1:1119028/140‑1 (MQ=255) tGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGCCCAGTCTGGCGCAGCACTTCTGGTGATTACTCCTGGCGCTCCGGTTCTGGCaaaa < 1:1116173/140‑1 (MQ=255) tGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGCCCAGTCTGGCGCAGCACTTCTGGTGATTACTCCTGGCGCTCCGGTTCTGGCaaaa < 1:794049/140‑1 (MQ=255) ttGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGCCCAGTCTGGCGCAGCACTTCTGGTGATTACTCCTGGCGCTCCGGTTCTGGCAAAAAAGAGTc > 1:941611/1‑140 (MQ=255) ttGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGCCCAGTCTGGCGCAGCACTTCTGGTGATTACTCCTGGCGCTCCGGTTCTGGCAAAAAAGAGTc > 1:1677748/1‑140 (MQ=255) ttGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGCCCAGTCTGGCGCAGCACTTCTGGTGATTACTCCTGGCGCTCCGGTTCTGGCAAAAAAGAGTc > 1:941601/1‑140 (MQ=255) tGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGCCCAGTCTGGCGCAGCACTTCTGGTGATTACTCCTGGCGCTCCGGTTCTGGCAAAAAAGAGTCt < 2:1550313/140‑1 (MQ=255) tGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGCCCAGTCTGGCGCAGCACTTCTGGTGATTACTCCTGGCGCTCCGGTTCTGGCAAAAAAGAGTCt < 2:93803/140‑1 (MQ=255) | CAACGCCAAAACGGCATTTTATGCCGATGTTCCGAAGAATATGACTCAGCAGAACTGTCAGTCTAAGTACGAAAATTGCTACTACGACAATGTTGAACAGAGTTGGATCCCGGTCGTTTCTGGA‑TTTTTGTTAAG‑CCGGGTTATTCGTAAAGATCGCGATGAGCCGTTTGTTTATAACAGCGGCGGTTCCTCTTTTGCTTCGCGCCCAGTCTGGCGCAGCACTTCTGGTGATTACTCCTGGCGCTCCGGTTCTGGCAAAAAAGAGTCT > NC_000913/4412662‑4412929 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |