Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 1,052,260 | T→C | 6.0% | intergenic (+20/+29) | gnsA → / ← yccM | putative phosphatidylethanolamine synthesis regulator/putative 4Fe‑4S membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,052,260 | 0 | T | C | 6.0% | 823.6 / 27.9 | 251 | intergenic (+20/+29) | gnsA/yccM | putative phosphatidylethanolamine synthesis regulator/putative 4Fe‑4S membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (125/110); new base C (8/7); total (134/117) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.00e-01 |
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
GACTTTATCGCGCAAAAAATCGCCGAGCTGAACAAGAATACAGGGAAAGAAGTCTCTGAAATTCGCTTCACCGCACGAGAAAAAATGACCGGGCTTGAAAGTTATGATGTCAAAATCAAAATAATGTGATTTTGTGAACATCACCCCGTGCGAGGTGATGTTCCGCTTGTTGCTAATTTAGTGACCAATCATTGGCGCTTGTGGAATTAAGCGTCGGTACAATTCCTCCGGCACCGGGCTTTGCCATACTCCCGCATACATTGCGTAACCAATCACCGCAAACATAATCCCCAGAAC > NC_000913/1052112‑1052408 | tttATCGCGCAAAAAATCGCCGAGCTGAACAAGAATACAGGGAAAGAAGTCTCTGAAATTCGCTTCACCGCACGAGAAAAAATGACCGGGCTTGAAAGTTATGATGTCAAAATCAAAATAATGTGATTTTGTGAACATCACCCCGTGCGa > 2:1156821/1‑150 (MQ=255) tttATCGCGCAAAAAATCGCCGAGCTGAACAAGAATACAGGGAAAGAAGTCTCTGAAATTCGCTTCACCGCACGAGAAAAAATGACCGGGCTTGAAAGTTATGATGTCAAAATCAAAATAATGTGATTTTGTGAACATCACCCCGTGCGa < 2:1742742/150‑1 (MQ=255) tATCGCGCAAAAAATCGCCGAGCTGAACAAGAATACAGGGAAAGAAGTCTCTGAAATTCGCTTCACCGCACGAGAAAAAATGACCGGGCTTGAAAGTTATGATGTCAAAATCAAAATAATGTGATTTTGTGAACATCACCCCGTGCGAgg < 2:66767/150‑1 (MQ=255) 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aaaatAATGTGATTTTGTGAACATCACCCCGTGCGAGGTGATGTTCCGCTTGTTGCTAATTTAGTGACCAATCATTGGCGCTTGTGGAATTAAGCGTCGGTACAATTCCTCCGGCACCGGGCTTTGCCATACTCCAGCATACATTGCGTa > 1:80283/1‑150 (MQ=255) aaaatAATGTGATTTTGTGAACATCAACCCGTGCGAGGTGAAGTTCCGCTTGTTGCTAAATTACTGACCAATCATTGGCGCTTTTGGAATTAAGCGTCGTAACAAATCCTACGGCACCGGGCTATGCCAAACTCCCGCATACCGTGCgaa > 2:791464/1‑148 (MQ=255) aataatGTGATTTTGAGAACATCACCCCGTGCGAGGTGATGTTCCGCTAGTTGCTAATTTATTGACCAATCATAGGCGCTTGTGGAATTAAGCGTCGGTACAATTCCTACGGCACCGGGCTATGCCATACTCCCGCATACATTGCGTAAc > 2:1081880/1‑150 (MQ=255) tgtgATTTTGTGAACATCACCCCGTGCGAGGTGATGTTCCGCTTGTTGCTAATTTAGTGACCAATCATTGGCGCTTGTGGAATTAAGCGTCGGTACAATTCCTCCGGCACCGGGCTTTGCCATACTCCCGCATACATTGCGTAACCAATc > 2:641874/1‑150 (MQ=255) aTTTTGTGAACATCACCCCGTGCGAGGTGATGTTCCGCTTGTTGCTAATTTAGTGACCAATCATTGGCGCTTGTGGACTTAAGCGTCGGTACAATTCCTCCGGCACCGGGCTTTGCCATACTCCCGCATACATTGCGTAACCAATCACCg > 2:4205083/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |