Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,052,264 | 0 | A | G | 5.8% | 806.7 / 24.6 | 243 | intergenic (+24/+25) | gnsA/yccM | putative phosphatidylethanolamine synthesis regulator/putative 4Fe‑4S membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (118/110); new base G (8/6); total (126/117) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.87e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
TTTATCGCGCAAAAAATCGCCGAGCTGAACAAGAATACAGGGAAAGAAGTCTCTGAAATTCGCTTCACCGCACGAGAAAAAATGACCGGGCTTGAAAGTTATGATGTCAAAATCAAAATAATGTGATTTTGTGAACATCACCCCGTGCGAGGTGATGTTCCGCTTGTTGCTAATTTAGTGACCAATCATTGGCGCTTGTGGAATTAAGCGTCGGTACAATTCCTCCGGCACCGGGCTTTGCCATACTCCCGCATACATTGCGTAACCAATCACCGCAAACATAATCCCCAGAACCAGTA > NC_000913/1052115‑1052413 | tttATCGCGCAAAAAATCGCCGAGCTGAACAAGAATACAGGGAAAGAAGTCTCTGAAATTCGCTTCACCGCACGAGAAAAAATGACCGGGCTTGAAAGTTATGATGTCAAAATCAAAATAATGTGATTTTGTGAACATCACCCCGTGCGa < 2:1742742/150‑1 (MQ=255) tttATCGCGCAAAAAATCGCCGAGCTGAACAAGAATACAGGGAAAGAAGTCTCTGAAATTCGCTTCACCGCACGAGAAAAAATGACCGGGCTTGAAAGTTATGATGTCAAAATCAAAATAATGTGATTTTGTGAACATCACCCCGTGCGa > 2:1156749/1‑150 (MQ=255) ttATCGCGCAAACAATCGCCGAGCTGAACCAGACGACCGGGACCGAAGTCTCTGAAATTCGCTTCACCGCACGAGAAAAAATGACCGGGCTTGAAAGTTATGATGTCAAAATCAAAATAACGTGATTTTGTGAACATCACCCCGTGCGAg < 1:3440107/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |