| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 1,743,931 | C→T | 12.0% | P159S (CCG→TCG) | mdtK → | multidrug efflux system transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,743,931 | 0 | C | T | 12.0% | 348.2 / 29.3 | 117 | P159S (CCG→TCG) | mdtK | multidrug efflux system transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (49/53); new base T (7/7); total (57/60) | |||||||||||
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Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
GTTACATTATCCGCTCCATGGAAAACATCGATCCGGCTCTGGCGGACAAAGCCGTGGGTTATCTGCGTGCGTTGTTGTGGGGCGCGCCGGGATATCTGTTCTTCCAGGTTGCCCGTAACCAGTGTGAAGGTCTGGCAAAAACCAAGCCGGGTATGGTAATGGGCTTTATCGGCCTGCTGGTGAACATCCCGGTGAACTATATCTTTATTTATGGTCATTTCGGTATGCCTGAGCTCGGTGGCGTTGGTTGTGGCGTGGCTACTGCGGCGGTGTATTGGGTCATGTTCCT > NC_000913/1743785‑1744073 | gTTACATTATCCGCTCCATGGAAAACATCGATCCGGCTCTGGCGGACAAAGCCGTGGGTTATCTGCGTGCGTTGTTGTGGGGCGCGCCGGGATATCTGTTCTTCCAGGTTGCCCGTAACCAGTGTGAAGGTCTGGCAAAAACCAAGCCgg < 1:1899950/150‑1 (MQ=255) ttACATTATCCGCTCCATGGAAAACATCGATCCGGCTCTGGCGGACAAAGCCGTGGGTTATCTGCGTGCGTTGTTGTGGGGCGCGCCGGGATATCTGTTCTTCCAGGTTGCCCGTAACCAGTGTGAAGGTCTGGCAAAAACCAAGCCggg > 2:1725760/1‑150 (MQ=255) ttACATTATCCGCTCCATGGAAAACATCGATCCGGCTCTGGCGGACAAAGCCGTGGGTTATCTGCGTGCGTTGTTGTGGGGCGCGCCGGGATATCTGTTCTTCCAGGTTGCCCGTAACCAGTGTGAAGGTCTGGCAAAAACCAAGCCggg > 2:410810/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |