Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,653,693 | 0 | A | G | 6.0% | 384.4 / 11.6 | 118 | intergenic (+354/‑162) | sseA/ryfA | 3‑mercaptopyruvate sulfurtransferase/novel sRNA, function unknown |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (49/60); new base G (3/4); total (52/66) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.14e-01 |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
CGCCGTGTTCGGTAATAAAATAACCTGGCTTATTAGTCCGAATTCAGACAAATATAAATAAATCCTGCTCAAAATTAAAAATTCTAACCGGTAAAAGATATTACTTAAACATGTAAATTCACTTTCCTTTAAAAAACAAAAAACCGCCAAAATCAGGCGGTTTTTTGTTGCTGGTCCGGTTCGCGGCCTTTCCAGCAGGTTGTATTACCGTAGTAATGCAAGCGCGTCTCAGCGGAGACAATACTCGCCAGTAACTCTCTTTTTGTCAAGCAAAAGAGAGTTATTATTGTTCTGTTAGT > NC_000913/2653544‑2653842 | ccgTGTTCGGTAATAAAATAACCTGGCTTATTAGTCCGAATTCAGACAAATATAAATAAATCCTGCTCAAAATTAAAAATTCTAACCGGTAAAAGATATTACTTAAACATGTAAATTCACTTTCCTTTAAAAAACAAAAAACCGCCaaaa < 2:393145/150‑1 (MQ=255) gtTCTGTATTAAAATATCCTGGCTTATTATTCCGAATTCAGAAAAATATAAATAAATCCTGCTCAAAATTAAAATTTCTAACCGTTAAAATATTTTAATTAACCATGTAAATTCACTGTCCTTTAAAAAACAAAAAACCGCCAAAATCAg < 1:1813196/150‑1 (MQ=255) ttCGGTAATAAAATAACCTGGCTTATTAGTCCGAATTCAGACAAATATAAATAAATCCTGCTCAAAATTAAAAATTCTAACCGGTAAAAGATATTACTTAAACATGTAAATTCACTTTCCTTTAAAAAACAAAAAACCGCCAAAATCAgg < 1:1455879/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |