| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,296,380:1 | +CG | 100% | intergenic (+586/+56) | gltP → / ← yjcO | glutamate/aspartate:proton symporter/Sel1 family TPR‑like repeat protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,296,380 | 1 | . | C | 98.6% | 1479.8 / 3.4 | 443 | intergenic (+586/+56) | gltP/yjcO | glutamate/aspartate:proton symporter/Sel1 family TPR‑like repeat protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/4); major base C (245/182); minor base T (3/3); total (252/191) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.04e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| * | NC_000913 | 4,296,380 | 2 | . | G | 98.6% | 1527.9 / 12.1 | 443 | intergenic (+586/+56) | gltP/yjcO | glutamate/aspartate:proton symporter/Sel1 family TPR‑like repeat protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/4); new base G (250/187); total (252/191) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.10e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 443 total aligned reads displayed.
TGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑A‑‑C‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTT > NC_000913/4296293‑4296520 || tGCGACGCTTTCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑AAGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAAc < 1:1767854/150‑1 (MQ=11) gCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAAcc < 1:4681117/150‑1 (MQ=2) cGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCg > 2:8434700/1‑150 (MQ=9) cGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCg > 1:2356977/1‑150 (MQ=9) gACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCCGGCCTATCTTAACCGt > 1:9848546/1‑150 (MQ=255) aCGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGGGTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGtt > 2:5969490/1‑150 (MQ=11) aCGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGtt < 1:5686551/150‑1 (MQ=12) aCGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGtt > 2:2221773/1‑150 (MQ=12) aCGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGtt > 1:3760275/1‑150 (MQ=12) cGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGTTTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGTCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTg < 1:2209408/150‑1 (MQ=11) cGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTg < 1:1535763/150‑1 (MQ=255) cGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTGT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTg < 1:6097611/150‑1 (MQ=255) cTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGt > 1:7002549/1‑150 (MQ=255) ttAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGtt > 1:9448990/1‑150 (MQ=255) ttAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGtt < 1:4425495/150‑1 (MQ=255) ttAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCGTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGtt > 1:8789163/1‑150 (MQ=255) gttaagcgTCGCATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGtt > 2:3211671/6‑150 (MQ=11) tatcgcgTCTTATCAGGGATCCGCCATAGAGCGCTTTAGCCTGATTTTGCGTGATTGTTTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTa < 1:7144293/147‑1 (MQ=11) aaCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTaa < 2:9511950/150‑1 (MQ=255) aaCGCGACTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTTATTTAGCTTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTaa < 2:7981178/150‑1 (MQ=11) gcgTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAttt > 2:9139569/1‑150 (MQ=255) gcgTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAttt > 1:6559952/1‑150 (MQ=255) gcgTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAttt < 1:9715430/150‑1 (MQ=255) gcgTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCGAGCTTAACCGTGGGTTAAttt > 1:9980263/1‑150 (MQ=11) cgTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGTGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAtttt < 2:8269611/150‑1 (MQ=255) cgTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAtttt > 2:5760431/1‑150 (MQ=255) gTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAttttt < 1:5918730/150‑1 (MQ=255) tCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑c < 2:10264141/150‑1 (MQ=255) ttATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑Caa > 1:902679/1‑150 (MQ=255) tATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑Caaa < 2:7894150/150‑1 (MQ=255) aTCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAAc > 2:7272484/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAAct > 2:6491979/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAAct > 2:3964040/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAAct > 2:1300718/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAAct > 1:4099013/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAAct > 1:242988/1‑150 (MQ=255) cAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAActc < 2:7617902/150‑1 (MQ=255) aGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAActct > 1:2952863/1‑150 (MQ=255) aGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAActct > 1:3684363/1‑150 (MQ=255) aGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAAAGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAActct > 2:265383/1‑150 (MQ=255) aGGCCTACGCCAGACAGCGCAAGAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAActct < 1:10147528/150‑1 (MQ=255) ggCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGCTCGGATAAGTAGTTT‑‑A‑‑CGGAGCTTCCTAGATCGATGCCAGTATCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCtt < 1:3917203/150‑1 (MQ=17) gCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTc < 2:7001428/150‑1 (MQ=255) gCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTc < 1:8847104/150‑1 (MQ=255) gCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATGTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTc > 2:2162660/1‑150 (MQ=255) ccTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTca < 1:1988470/150‑1 (MQ=255) tACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTcaca > 1:6975100/1‑150 (MQ=255) tACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTcaca > 1:8081481/1‑150 (MQ=255) ccAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTCACACCCg < 1:7969901/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=14) tGATTTTGTAGGTCGGTTAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCTTCCGACATCTTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCGTATCTTAAGGGTTGGTTAATTTTT‑CAATCTCTTCTCACGCGGTATCAATGCCTTCCATAGAGCTCAGGt > 2:1789040/1‑150 (MQ=18) tGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ATGC‑‑CGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑Ca < 2:2417176/107‑1 (MQ=14) tGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGt < 1:7834512/150‑1 (MQ=255) tGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTACCATACAGATCAGGt > 1:7750431/1‑150 (MQ=21) aTTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTc < 1:9907183/150‑1 (MQ=255) tttGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTACCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCaa > 1:4330631/1‑150 (MQ=255) ttGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAAc < 2:4717607/150‑1 (MQ=255) ttGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAAc < 2:5404026/150‑1 (MQ=255) tAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAg < 1:6732054/150‑1 (MQ=255) aGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGt < 1:856244/150‑1 (MQ=255) ggTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTg < 1:9317448/150‑1 (MQ=255) gTCGGATAAGGCGTTT‑‑ATGC‑‑CGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTCACACCCGGTa < 1:2752408/114‑1 (MQ=18) gTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCTGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGc > 2:2633877/1‑150 (MQ=255) gTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGc > 2:1210389/1‑150 (MQ=255) gTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGc > 1:5320367/1‑150 (MQ=255) 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ggATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAgc > 1:4237850/1‑150 (MQ=255) ggtAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGAGGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CTATCTCTTCACACCCGGTCTCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCTgcg > 1:620857/3‑150 (MQ=25) gATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAgcg > 2:4347203/1‑150 (MQ=255) gATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAgcg > 2:7741911/1‑150 (MQ=255) gATAAGGCGTTT‑‑ACGC‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAgcg > 1:1341190/1‑150 (MQ=255) 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TGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑A‑‑C‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTT‑CAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTT > NC_000913/4296293‑4296520 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |