| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 165,787 | T→G | 5.5% | M353R (ATG→AGG) | mrcB → | fused glycosyl transferase and transpeptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 165,787 | 0 | T | G | 5.5% | 2482.6 / 62.2 | 739 | M353R (ATG→AGG) | mrcB | fused glycosyl transferase and transpeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (353/336); new base G (3/47); total (356/383) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.71e-11 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 746 total aligned reads displayed.
AGACCGTATTCTTGAGCTGTATATGAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCCCGTCCGCTGGGGGTTCAGC > NC_000913/165638‑165936 | gACCGTATTCTTGAGCTGTATATGAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATg < 1:2899725/150‑1 (MQ=255) ccGTATTCTTGAGCTGTATATGAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGt > 1:4196183/1‑150 (MQ=255) ccGTATTCTTGAGCTGTATATGAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGt > 2:1433635/1‑150 (MQ=255) cGTATTCTTGAGCTGTATATGAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTg > 1:7691537/1‑150 (MQ=255) tATTCTTGAGCTGTATATGAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGaa > 1:7828022/1‑150 (MQ=255) aTTCTTGAGCTGTATATGAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAGATCCGCGGCTTCCCGCTGGCGAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGaaa > 1:5157828/1‑150 (MQ=255) cTTGAGCTGTATATGAACTAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAggg < 2:6063795/150‑1 (MQ=255) cTTGAGCTGTATATGAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAggg < 2:1903691/150‑1 (MQ=255) ttGAGCTGTATATGAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAgggg < 1:5433568/150‑1 (MQ=255) ttGAGCTGTATATGAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAgggg < 1:3568450/150‑1 (MQ=255) aGCTGTATATGAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGt < 2:8565499/150‑1 (MQ=255) gCTGTATATGAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTc < 2:5629831/150‑1 (MQ=255) cTGTATATGAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTcc > 1:2760850/1‑150 (MQ=255) gTATATGAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCTGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCAt < 1:9949383/150‑1 (MQ=255) atatGAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCt < 2:9179675/150‑1 (MQ=255) tatGAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTa > 1:1460754/1‑150 (MQ=255) tGAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACa > 2:4860517/1‑150 (MQ=255) gAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACaa > 1:7270753/1‑150 (MQ=255) gAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCg > 2:3346669/1‑150 (MQ=255) gtgtATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATGCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTgg < 1:6084040/150‑1 (MQ=255) tctcGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTaa < 1:1340929/150‑1 (MQ=255) tctcGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTaa < 2:8838870/150‑1 (MQ=255) ctcGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAAc > 2:4431710/1‑150 (MQ=255) tcGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAAcc > 2:4060825/1‑150 (MQ=255) tcGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAAcc > 1:10211048/1‑150 (MQ=255) tcGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCGGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAAcc > 2:1087542/1‑150 (MQ=255) ggTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTCTTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCa > 2:7280471/1‑150 (MQ=255) gTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCaa > 1:9248710/1‑150 (MQ=255) gagCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACt > 2:4712024/1‑150 (MQ=255) agCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTg < 1:8755145/150‑1 (MQ=255) ggcgACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGgcg > 1:6216809/1‑150 (MQ=255) cgACAACGACATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCt < 2:2277683/150‑1 (MQ=255) cgACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCt > 2:3912062/1‑150 (MQ=255) aCAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTgg > 2:9019086/1‑150 (MQ=255) cGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCg > 2:6475592/1‑150 (MQ=255) cGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCg > 2:8415449/1‑150 (MQ=255) gAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGa < 2:776946/150‑1 (MQ=255) ccGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTaa > 2:9228787/1‑150 (MQ=255) gcgGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATc > 2:5088389/1‑150 (MQ=255) gcgGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATc < 1:8201479/150‑1 (MQ=255) gcgGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATc > 2:5339600/1‑150 (MQ=255) gCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTgg < 2:2387285/150‑1 (MQ=255) ttCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGtg < 1:9678577/150‑1 (MQ=255) tCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGtgc < 2:9482216/150‑1 (MQ=255) cccGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGtgct < 2:7575903/150‑1 (MQ=255) cccGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTAGGGTGAAAGGGTCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGtgct < 1:5576208/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGtgctg > 2:1275772/1‑150 (MQ=255) cGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGtgctgc < 2:10214433/150‑1 (MQ=255) gCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCg > 2:1630418/1‑150 (MQ=255) cAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTctgc < 2:3588404/150‑1 (MQ=255) aaGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGGGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCAAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTctgct < 1:738690/150‑1 (MQ=255) aGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTctgctg < 2:7644795/150‑1 (MQ=255) aGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTctgctg < 2:6954901/150‑1 (MQ=255) aGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTAGGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTctgctg < 1:6300225/150‑1 (MQ=255) ttGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTAGGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTgcaa < 1:3928932/150‑1 (MQ=255) ttGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTAGGGGGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTgcaa < 1:8987509/150‑1 (MQ=255) gTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTAGGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTgcaaca < 1:10049250/150‑1 (MQ=255) gaTTACTGTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAGGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTgcaacag < 1:6973202/149‑1 (MQ=255) tACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTgcaacagcaa > 1:800880/1‑150 (MQ=255) tttGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGcaacagcaacag > 2:811703/1‑150 (MQ=255) tttGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGcaacagcaacag > 1:2311543/1‑150 (MQ=255) gTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTAGGGGGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGatta < 1:4715271/150‑1 (MQ=255) tCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGc < 2:8684738/63‑1 (MQ=255) tCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTAGGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGattat < 1:4060825/150‑1 (MQ=255) cccGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGa > 2:9619041/1‑150 (MQ=255) cccGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGa < 2:2543397/150‑1 (MQ=255) ccGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGAttatttat < 1:8909947/150‑1 (MQ=255) ccGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGAt > 2:7432044/1‑150 (MQ=255) ccGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGAt < 1:3845579/150‑1 (MQ=255) gTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCaa > 2:4589772/1‑150 (MQ=255) tAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAg < 1:8477268/150‑1 (MQ=255) agagCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAAct > 2:4225787/1‑150 (MQ=255) agCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAActct < 2:311307/150‑1 (MQ=255) gCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTa < 2:7922484/150‑1 (MQ=255) cTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTAt > 1:1836959/1‑150 (MQ=255) cTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTAt > 1:5301230/1‑150 (MQ=255) tAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTAGGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATg < 1:5767786/150‑1 (MQ=255) ccTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACAt > 1:266191/1‑150 (MQ=255) tCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCACCAGATTCTTGATCAAGAACTCTATGACATGt > 1:5893216/1‑150 (MQ=255) cagcagGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGt > 2:5925429/1‑150 (MQ=255) cagcagGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGt > 2:8931354/1‑150 (MQ=255) gcagGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGc > 1:2182403/1‑150 (MQ=255) cagGCGCTGTTAGTCGGTATTGTGAAATGGGCGTCCATATACAAACCGTGGCGTAACCCAAAAAAGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTTCGTCTGCAGCAACAACAACAGAATATTGATCAAGAAATCTATGACATGTTGAGTGcc > 1:7569526/1‑150 (MQ=255) cagGCGCGGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCGTCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGcc > 1:3354668/1‑150 (MQ=255) agGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGccc < 1:111228/150‑1 (MQ=255) cgcTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCACCAGCAACAGATTCTTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCCCGTc > 2:1533015/1‑150 (MQ=255) cgcTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCCCGTc > 1:1744521/1‑150 (MQ=255) gcTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCCCGTcc > 1:4327542/1‑150 (MQ=255) tGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTCTGACATGTTGAGTGCCCGTCCGc > 2:6261463/1‑150 (MQ=255) gTTAGTCGGTAGGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCCCGTCCGCt < 1:9510243/150‑1 (MQ=255) ttAGTCGGTATGGTGAAATGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGAAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCCCGTCCGCTg > 1:4857730/1‑150 (MQ=255) tAGTCGGTATGTTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACGCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCATCAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCCCGTCCGCTgg < 1:3107539/150‑1 (MQ=255) aGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCCCGTCCGCTggg < 2:2652698/150‑1 (MQ=255) aGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCCCGTCCGCTggg < 2:3729327/150‑1 (MQ=255) tCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTACTCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCCCGTCCGCTggggg > 1:4407185/1‑150 (MQ=255) tCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCCCGTCCGCTggggg > 1:2047003/1‑150 (MQ=255) ggTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCCCGTCCGCTGGGGGtt > 1:6589447/1‑150 (MQ=255) gTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCCCGTCCGCTGGGGGTTc < 2:7036086/150‑1 (MQ=255) gTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCCCGTCCGCTGGGGGTTc > 1:9128437/1‑150 (MQ=255) tGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACACTATGACAACGAGAGTGCCCGTCCGCGGGGGGTTCAGc > 2:6625821/1‑150 (MQ=255) | AGACCGTATTCTTGAGCTGTATATGAACGAGGTGTATCTCGGTCAGAGCGGCGACAACGAAATCCGCGGCTTCCCGCTGGCAAGCTTGTATTACTTTGGTCGCCCGGTAGAAGAGCTAAGCCTCGACCAGCAGGCGCTGTTAGTCGGTATGGTGAAAGGGGCGTCCATCTACAACCCGTGGCGTAACCCAAAACTGGCGCTGGAGCGACGTAATCTGGTGCTGCGTCTGCTGCAACAGCAACAGATTATTGATCAAGAACTCTATGACATGTTGAGTGCCCGTCCGCTGGGGGTTCAGC > NC_000913/165638‑165936 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |