| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 576,400 | 0 | T | G | 10.6% | 1704.1 / 84.1 | 548 | pseudogene (426/1040 nt) | nmpC | DLP12 prophage; truncated outer membrane porin (pseudogene);IS, phage, Tn; Phage or Prophage Related; outer membrane porin protein; locus of qsr prophage |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (278/202); new base G (2/66); total (280/268) | |||||||||||
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Only 100 of 567 total aligned reads displayed.
CCGTTACCTTCAGTGTAGTTATCGAAATCGCTACGATCGTTTTTGCCTTGGTACTGAGCAGCAAAGTTCAGACCATCAACCAGACCAAAGAAGTCGTTGTTACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCAGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAGGCAAGACGGGTTTTATCTTTGGAGGA > NC_000913/576251‑576549 | cGTTACCTTCAGTGTAGTTATCGAAATCGCTACGATCGTTTTTGCCTTGGTACTGAGCAGCAAAGTTCAGACCATCAACCAGACCAAAGAAGTCGTTGTTACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGttt < 1:4670875/150‑1 (MQ=255) cGTTACCTTCAGTGTAGTTATCGAAATCGCTACGATCGTTTTTGCCTTGGTACTGAGCAGCAAAGTTCAGACCATCAACCAGACCAAAGAAGTCGTTGTTACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGttt < 2:4556987/150‑1 (MQ=255) cGTTACCTTCAGTGTAGTTATCGAAATCGCTACGATCGTTTTTGCCTTGGTACTGAGCAACAAAGTTCAGACCATCAACCAGACCAAAGAAGTCGTTGTTACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGttt < 2:9824303/150‑1 (MQ=255) 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ggTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCAGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGTATTTCAGGCCAGCGAAGGCTAGACGGGTTTTATCTTTgga < 2:8615436/150‑1 (MQ=255) ggTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCAGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAGGCAAGACGGGTTTTATCTTTgga > 2:6739960/1‑150 (MQ=255) | CCGTTACCTTCAGTGTAGTTATCGAAATCGCTACGATCGTTTTTGCCTTGGTACTGAGCAGCAAAGTTCAGACCATCAACCAGACCAAAGAAGTCGTTGTTACGATAGGTTGCAACACCAGTTGCACGTTGAGTCATGAACACGTCGGTTTGAGTCCAAGTGTCACCACCGAATTCTGGCAGGACGTCAGTCCACGCACCGATGTCGTATGCTACACCGTAGTTACGGCCGTAATCGATGGAGCCGTAGTCACCGAATTTCAGGCCAGCGAAGGCAAGACGGGTTTTATCTTTGGAGGA > NC_000913/576251‑576549 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |