| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,239,611 | 0 | C | A | 5.1% | 1398.8 / 47.0 | 426 | intergenic (+66/‑333) | alx/sstT | putative membrane‑bound redox modulator/sodium:serine/threonine symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (239/163); new base A (4/18); total (243/183) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.03e-04 | |||||||||||
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Only 100 of 433 total aligned reads displayed.
GGCGTGGTGTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATC‑TGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACA‑TGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTGGCTTTATTTT > NC_000913/3239462‑3239760 | ggCGTGGTGTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCGGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATC‑TGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACA‑TGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTcc > 1:10164867/1‑150 (MQ=255) gCGTGGTGTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATC‑TGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACA‑TGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCa < 2:1367606/150‑1 (MQ=255) gtggtgTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATC‑TGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACA‑TGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAgg < 1:663769/150‑1 (MQ=255) 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tttCCCCCCCCCCCTCCCTGGGTGGGGGTGGGGGTGCGGGAAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCg < 1:8751641/150‑1 (MQ=25) tctccctctcccTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCAAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGACGCa > 1:716575/1‑150 (MQ=255) ctccctctccctTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGAAAATTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAAACCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCAGGAAGCCGCAc > 2:7992528/1‑150 (MQ=255) ccctctccctGGAAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTACCCTCTACCTAAACCTCTACCCAAACGGGGCGAGGGGACTTACCGAGTGCTTTTTTGATGTTTTATTAAGTCTGGAATACGCACGt > 1:9099127/1‑150 (MQ=255) cctctccctTCCTGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGtt < 2:10269280/150‑1 (MQ=255) ctctccctTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAAcc < 1:1839563/76‑1 (MQ=255) 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ttCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCACCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTGGCTTTAt > 1:2303817/1‑150 (MQ=255) | GGCGTGGTGTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATC‑TGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACA‑TGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTGGCTTTATTTT > NC_000913/3239462‑3239760 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |