| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 222,958 | Δ1 bp | 100% | coding (126/576 nt) | gmhB → | D,D‑heptose 1,7‑bisphosphate phosphatase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 222,958 | 0 | A | . | 88.4% | 233.8 / 27.9 | 69 | coding (126/576 nt) | gmhB | D,D‑heptose 1,7‑bisphosphate phosphatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/3); new base . (33/28); total (37/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Polymorphic indel expands or contracts a homopolymer stretch. | |||||||||||
TTATTAAGGAGCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCGAGATGTCGATCTGGATGGTATCTAT > NC_000913/222813‑223102 | ttattaAGGAGCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaa > 1:31767/1‑149 (MQ=255) attaAGGAGCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaa > 2:902331/1‑149 (MQ=255) taAGGAGCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaaat < 1:751112/149‑2 (MQ=255) taAGGAGCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGGGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaaat < 1:469359/149‑2 (MQ=255) aGGAGCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaaatgg > 2:753659/1‑146 (MQ=255) aGGAGCTATAAAAGGCGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaaatgg > 1:873823/1‑146 (MQ=255) ggAGCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGATATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaaatggg < 1:673245/149‑5 (MQ=255) gCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGGGTTTTTGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGCt > 2:185694/1‑149 (MQ=255) ctttaAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGAAATTTTTCTTGACCGTGATGGCTCCATTAATGTCGATCACGGCTATGGCCATGAGTTCGACAACTTTGAATTTATCGCCGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGTCttt < 1:316404/146‑1 (MQ=255) cTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCttt > 1:300437/1‑149 (MQ=255) tataAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGCTCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGCttt < 1:295948/149‑1 (MQ=255) taAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTgcg > 1:39176/1‑149 (MQ=255) aaaGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCt > 2:750907/1‑149 (MQ=255) aaaGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCt < 2:80192/149‑1 (MQ=255) aaGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGCTTTGCGCt > 2:165557/1‑149 (MQ=255) aaGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCtg > 2:720019/1‑149 (MQ=255) aGGTGGCGAAGAGCGTTCCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACTACTTTGAATTTATCTACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑TAATAAATGGGCTTTGCGCtgg > 2:1016715/1‑149 (MQ=255) gggCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCtggtgg < 1:302382/148‑1 (MQ=255) ggCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTggtggt > 1:723479/1‑149 (MQ=255) ggCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTggtggt < 2:288537/149‑1 (MQ=255) gCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGCCCGTGATCGCACCATTAATGTCGCTCACGGCTATGTCCATTAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGTGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGgta < 2:910297/149‑1 (MQ=255) cGAAGAGCGTAGCCGCAATTGTGCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGGCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACCGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTGGCGCTGGTGggag < 2:216167/149‑1 (MQ=255) cGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGgtag > 2:302567/1‑149 (MQ=255) gAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGgtagt > 2:487549/1‑149 (MQ=255) aaGACCGTACCCGCAATTTATCATGACCGTGAAGGCACCAATAATGTCGATCCCGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTAGAATTTAACGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGgtagta < 2:714876/149‑1 (MQ=255) gTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTaaccaac < 2:300437/149‑1 (MQ=255) ccGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGt > 1:974344/1‑149 (MQ=255) cGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACAAGTc > 2:639488/1‑149 (MQ=255) gCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGAAACCAACCAGTCt > 2:14056/1‑149 (MQ=255) cattttttCTTGACCGTTAGGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCTTGAGATCGACAACTTTGATTTTATCGACGGTGTTATTGACGCCAGGCGCGAGCT‑AAAAAAATTGGCTTTGCGCGGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTg < 1:581503/146‑1 (MQ=255) tttCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCAtt > 2:370670/1‑149 (MQ=255) tttCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGAAtt > 1:289112/1‑149 (MQ=255) tttCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCAAGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGTATTTATCGACGGTGTTATTGACTCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCAtt < 2:919101/149‑1 (MQ=255) ttGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACCGCTATGTACATGAGATCGACAACATTGATTTAATCGACGGTGTAATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGCTGGTAGTAACCAACCTGTCTGGCATTGCTc > 2:152408/1‑149 (MQ=255) tGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTACCCCACCAGTCTGGCATTGCTcg > 1:936063/1‑149 (MQ=255) gATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTaaa > 1:845147/1‑149 (MQ=255) ccccATTCATCCCGATCCCGGCTATGGCCCTGAGATCGACAACTAGGAATATATCGCCGGTGGTCTTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAACACTGGGCTTTGCGCTGGGGGTAGTCACCAACCCGTCTGGCAGTGCTCGCGGTAACTTTAc < 2:12127/147‑1 (MQ=255) cACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTAc < 2:873823/149‑1 (MQ=255) cACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTAGTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGACTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTAc > 2:82396/1‑149 (MQ=255) cccATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCCTGATAGCGACAACTTTCTATTAATCGACGGTGTTATTGACGCCAAGCGCGAGCT‑AAAAACATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTAcc < 2:159270/148‑1 (MQ=255) aCCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTAcc > 1:885757/1‑149 (MQ=255) cATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGa > 1:314830/1‑149 (MQ=255) ttAATGTCTATCTCGGCTATGTCCTGGAGATCGACAACTTTGTATTTTTCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTGGGGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAg < 1:676341/149‑1 (MQ=255) ttAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAg < 1:134100/149‑1 (MQ=255) ttAATGTCGATCAAGTCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTAGCGGTAATTTTACCGAAg > 1:86707/1‑149 (MQ=255) tAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGc < 1:975978/149‑1 (MQ=255) tAATGTCGATCAAGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGACATTCTCGACTGTGTTATAGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGc < 1:979330/149‑1 (MQ=255) gTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAg > 2:46805/1‑149 (MQ=255) cGATCACGGGTATGTCCATTAGTTCGACAACTTTGAATTTATCGTCGGTGTTATTGACGCGATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCCGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGtt < 1:263372/149‑1 (MQ=255) tCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATTGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATATACAGAAGCACAGTTTGa > 1:746913/1‑149 (MQ=255) tCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGa > 1:332535/1‑149 (MQ=255) aCGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGaaa < 1:880692/149‑1 (MQ=255) ggCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACTGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGGCTGGCATTGCTCGCGGTAAAGTTAGCGAAGCACAGTTTGAAACg > 2:448222/1‑149 (MQ=255) gTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGAcc > 1:103848/1‑149 (MQ=255) tCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCg > 2:1007599/1‑149 (MQ=255) cATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAg < 1:750907/149‑1 (MQ=255) gaTCGCCAACTATGAATTCATCGACGGTGTTCATGCCGCCAGGCGCGAGC‑GAAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGGGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGGAACTTTACCGACGCACAGTTTGACACGCGGACCGCGtggat < 2:484707/149‑1 (MQ=255) gaTCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGAAGTAACCAACCAGACTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTCATCCGCTGACCTAGtgga > 2:506492/1‑149 (MQ=255) gaTCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTACCCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAACCGCTGACCGAGtggat > 2:948904/1‑149 (MQ=255) 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aaTTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTgg < 2:723479/149‑1 (MQ=255) ttATCGACGGTGTTATTGACTCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGTTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCgg > 1:369994/1‑149 (MQ=255) aTTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCGAGATGTCGAt < 2:974344/149‑1 (MQ=255) aTTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCGAGATGTCGAt > 2:699728/1‑149 (MQ=255) aCGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCGAGATGTCGATCTgg > 1:515820/1‑149 (MQ=255) gCCATGCGCGAGCT‑AAAAAACTGGGCTTTGCGCTGGTGGGAGTAACCAACCAGTCTCGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATCGACTGGGCGCTGGCGGACCGAGATGTCGATCTGGAt < 2:234371/149‑1 (MQ=255) gCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCGAGATGTCGATCTGGAt < 1:370670/149‑1 (MQ=255) gCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGAGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCGAGATGTCGATCTGGAt > 2:204124/1‑149 (MQ=255) gcgAGCTAAAAAAAATGGTCTTTGCTCTGGTTGTAGTAACCAACCAGTGTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCGAGATGTCGATCTGGATGGTATc < 1:166849/149‑1 (MQ=255) gAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCGAGATGTCGATCTGGATGGTATCtat < 1:46805/149‑1 (MQ=255) tAAAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCGAGATGTCGATCTGGATGGt > 1:524820/1‑140 (MQ=255) tAAAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCGAGATGTCGATCTGGATGGt < 2:524820/140‑1 (MQ=255) | TTATTAAGGAGCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCGAGATGTCGATCTGGATGGTATCTAT > NC_000913/222813‑223102 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |