New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 511333 = | 51 (0.860) | 3 (0.050) | 3/266 | NT | 5.9% | coding (47/2505 nt) | copA | copper transporter |
? | NC_000913 | 511361 = | 46 (0.810) | coding (19/2505 nt) | copA | copper transporter |
AGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGT > NC_000913/511188‑511481 | aGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGAc < 1:318363/149‑1 (MQ=255) aTGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCg > 1:210199/1‑149 (MQ=255) aTGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGCTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACCCATCCGCCTGCTCAACATCCGTACGCTGTTCTAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCg > 1:104619/1‑149 (MQ=255) tCATACCACGCTTGTTTTATTGTTTAGATAATCTGTTATGCCCTGGCAGTACCTTTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACTTCCGCCTGCTCAACATCCGTAAGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGAACGCAGGa < 2:186502/149‑1 (MQ=255) aTAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACa < 2:630592/149‑1 (MQ=255) ccGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCg > 1:729406/1‑149 (MQ=255) ccGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCg > 1:730560/1‑149 (MQ=255) ttGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGGTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCa < 2:558701/149‑1 (MQ=255) gTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTCGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTGAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTGCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAgg < 2:818789/149‑1 (MQ=255) ttacggacgtttacccgcctggtttataaatttcttgaccttccccttgctggaaggtttaacctttatcacagccagtcaaaactgtcttaaaggagtgttttatgtcacaaactatcgaccTGACC‑CTGGACAGGCCGTCCAGGGTc > 1:140307‑M1/124‑149 (MQ=255) ggTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAggg > 1:763901/1‑148 (MQ=255) gTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTc < 2:735291/149‑1 (MQ=255) gTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCAGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCAGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTATCGCAGTGCCCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTc > 2:1007245/1‑149 (MQ=255) ttCGCTCAGCTGTTCTGCACTGGAAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGa > 1:724126/1‑149 (MQ=255) ttCGATCAGCTGGTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCATCATCAGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGa < 2:593645/149‑1 (MQ=255) tttacccgcctggtttattaatttcttgaccttccccttgctggaaggtttaacctttatcacagccagtcaaaactgtcttaaaggagtgttttatgtcacaaactatcgaccTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGAt > 1:1025878‑M1/115‑149 (MQ=255) gATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCAGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTAAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAg > 1:634465/1‑149 (MQ=255) aTCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGt > 2:340487/1‑149 (MQ=255) aTCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGGTTCACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGt > 1:865133/1‑149 (MQ=255) aTCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCACAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCAGTCCAGGGTCAGGTCGATAGt > 1:135146/1‑149 (MQ=255) ccttgattattaatttcttgaccttccccttgctggaaggtttaacctttatcacacccagtcaaaactgtcttaaaggagtgttttatgtcacaaactatcgaccTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTtgtg > 1:902758‑M1/107‑149 (MQ=255) ttCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACa > 1:784393/1‑149 (MQ=255) cACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGGGCAAGACGTTCTTTCACGCGATTAACGCAGTGACCGAAGTACAGGCCGTCGAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATaaaa < 2:169532/149‑1 (MQ=255) aCTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAac > 2:983962/1‑149 (MQ=255) aCTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACCCAGTCCCCGCAGCACTGCCCGGCAGGGGGCCGTGCGTTAGTTTGTGCCTTaaacc > 1:358918/1‑147 (MQ=255) gCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTc > 2:186962/1‑149 (MQ=255) gTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGAGCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCtt < 1:282508/149‑1 (MQ=255) gTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTACACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGTCAGGCCGTCCAGGGTCAGGGCGATAGTTTGTGACATAAAACACTACtt > 2:925873/1‑149 (MQ=255) cGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAg > 1:344566/1‑149 (MQ=255) ggTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGa < 1:235486/149‑1 (MQ=255) ggTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGGTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGa < 1:629153/149‑1 (MQ=255) aGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCt < 1:943765/149‑1 (MQ=255) tGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCtgg > 1:741032/1‑148 (MQ=255) gATAGACACATCCGCCTGCTCAACATACGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCtgtg < 2:724126/149‑1 (MQ=255) gACCCATCCGCCTGCTCACCATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGGTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGTCCTTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACAAAAAACCATCCTTTAAGACAGATTTGACTGGCTGTGATaa > 1:205774/1‑149 (MQ=255) acacATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATaaa > 2:1024416/1‑149 (MQ=255) tCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTa < 2:763901/149‑1 (MQ=255) cGCCTGCTCAAAAACCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCATGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTaaa < 1:583981/149‑1 (MQ=255) cAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGCCATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAg > 1:977150/1‑149 (MQ=255) cAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAg > 1:265855/1‑149 (MQ=255) cAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTGTGTGACATAAAACGCTCCTTTAAGACAGTTTAGACTCGCTGTGAGTAAGGTTAGCCCTTCGAg > 1:950855/1‑149 (MQ=255) aaCATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTCACATAAAACACTCCTTTAAGACACTTATGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCacc > 1:471609/1‑147 (MQ=255) aCATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGCACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGATGTTATAAAGGTTAAAACTTACAGCa > 1:119394/1‑149 (MQ=255) aTCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAg < 1:340487/149‑1 (MQ=255) gCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGt > 1:141651/1‑149 (MQ=255) cAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGaa < 2:344566/149‑1 (MQ=255) cAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGAAATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTCTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGaa > 1:333655/1‑149 (MQ=255) ataCTTTCTTTCACGCGTATAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATCGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAAt < 2:604725/147‑1 (MQ=255) aGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGCTCAAGAAAt > 2:553774/1‑149 (MQ=255) tttctttcACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTTATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATtaat > 2:544060/1‑149 (MQ=255) tttctttcACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATtaat > 1:544700/1‑149 (MQ=255) ttcACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAAcc > 1:510540/1‑149 (MQ=255) cgTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCgg < 1:983962/149‑1 (MQ=255) tAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTaa < 2:293039/149‑1 (MQ=255) aCGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTaaaa > 1:976584/1‑149 (MQ=255) gTGAACGCAGGTCAGGCCGTCCAGGGTCATGTAGATAGTTTGTCACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGTGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCg < 2:471609/149‑1 (MQ=255) TGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGt < 1:586657‑M1/149‑1 (MQ=255) | AGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGT > NC_000913/511188‑511481 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |