| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3726887 = | 91 (1.540) | 5 (0.090) | 5/254 | NT | 5.6% | intergenic (+5/+37) | wecH/yiaA | O‑acetyltransferase for enterobacterial common antigen (ECA)/YiaAB family inner membrane protein, tandem domains |
| ? | NC_000913 | 3726917 = | 85 (1.560) | intergenic (+35/+7) | wecH/yiaA | O‑acetyltransferase for enterobacterial common antigen (ECA)/YiaAB family inner membrane protein, tandem domains | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CCATGCGCTGCGCACCCGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAGAAGAAAGCC > NC_000913/3726741‑3727035 | ccATGCGCTGCGCACCCGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAAAACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACATTCTATGCTGCTACAACGAATCGACAGATACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAg > 1:276487/1‑149 (MQ=255) ttcatctaaaaagttttttatggactggctttcttctttagcttgtttggtgcagtagcggttcagaaaaatattcgtgatgccggaataaacccaccaacagaaacacaggttacccaggaagaatacagcgaataactcacgtAAGc > 1:773111‑M1/146‑149 (MQ=255) ccagcgaaaaaggtttttatggactggctttcttcttaagcttgtttggtgcagtatcggtgcagaaaaatattcgtgatgccggaataaacccaccaaaagaaacacaggttacccaggaagaatacagcgaaaaactcacgtAAGcc > 2:500718‑M1/145‑149 (MQ=255) aTGCGCTGCGCACCCGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGTGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGcc > 1:839329/1‑149 (MQ=255) aTGCGCTGCGCACCCGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGcc > 2:175157/1‑149 (MQ=255) agcgaaaaaggtttttatggactggctttcttcttaagcttgtttggtgcagtagcggtgcagaaaaatattcgtgatgccggaataaacccaccaaaagaaacacaggttacccaggaagaatacagcgaataactcacgtAAGCCCg < 2:255045‑M1/7‑1 (MQ=255) agcgaaaaaggtttttatggactggctttcttcttaagcttgtttggtgcagtagcggtgcagaaaaatattcgtgatgccggaataaacccaccaaaagaaacacaggttacccaggaagaatacagcgaataactcacgtAAGCCCg < 2:277157‑M1/7‑1 (MQ=255) agcgaaaaagggttttatggactggctttcttctttagcttgtgtggtgcagtagcggtgcagaaaaatattcgtgatgccggaataaacccaccaaaagaaacacaggttacccaggaagaatacagcgaataactcacgtAAGCCCg > 1:484115‑M1/143‑149 (MQ=255) ctgcgcACCCGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTc > 2:34062/1‑149 (MQ=255) aaaaaggtttttatggactggctttcttcttaagcttgtttggtgcagtagcggtgcagaaaaatattcgtgatgccggaataaacccaccaaaagaaacacaggttacccaggaagaatacagcgaataactcacgtAAGCCCGGTca < 2:1006568‑M1/11‑1 (MQ=255) aaaaaggtttttatggactggctttcttcttaagcttgtttggtgcagtagcggtgcagaaaaatattcgtgatgccggaataaacccaccaaaagaaacacaggttacccaggaagaatacagcgaataactcacgtAAGCCCGGTca < 1:299407‑M1/11‑1 (MQ=255) aaaaaggtttttatggactggctttcttcttaagcttgtttggtgcagtagcggtgcagaaaaatatacgtgatgcctgaataaacccaccaaaagaaacacaggttacccaggaagaaaacagcgaataactcacgtAAGCCCGGTca < 2:752491‑M1/11‑1 (MQ=255) aCCCGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGAGTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTg < 1:928259/149‑1 (MQ=255) aCCCGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGATACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACACATTAGTGATTTAAGAAAAAGCCCTTTCACATTg > 1:155443/1‑149 (MQ=255) ccGGGTAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGa < 2:243993/149‑1 (MQ=255) ccGGGGTATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGGCACATTGGa < 1:655608/149‑1 (MQ=255) ccGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTTGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGa < 1:1009835/149‑1 (MQ=255) ccGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGCTCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACTGAACCAGATTAGTGAGTTATGTAAAAGCCCGGTCACATTGGa > 2:578946/1‑149 (MQ=255) 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ttAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGCCGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCTGTCACATTGTACTGACAGGGCTTAc > 1:590006/1‑149 (MQ=255) ttAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTAc > 1:885161/1‑149 (MQ=255) ataaaaTGGCCAATACTGGATTTTATTTGGATCTTTCGCGCGACGTTGGCCGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACTAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGt < 1:672303/147‑1 (MQ=255) ataTTGGCCAATACTGGATTTTATTTGGATCTTTTTCGCGACGGTGGCAGCGTGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACATCGATTCTACATAATCAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGa < 1:1006253/147‑1 (MQ=255) aaaTTGGCCAATACTGGATATTATTTGTATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTAATTTCTATGCTGGAACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAACGACCGTTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGa < 2:492089/149‑1 (MQ=255) 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aaTACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGc > 1:255045/1‑149 (MQ=255) tACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTg > 2:742869/1‑149 (MQ=255) tGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTAt > 2:299407/1‑149 (MQ=255) ttattTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTcc < 1:919912/149‑1 (MQ=255) tattTGGATCTTTTGCTCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCt < 1:513891/149‑1 (MQ=255) 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aGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTTTTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTaa > 1:143162/1‑149 (MQ=255) gTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCTGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTaag < 1:436431/149‑1 (MQ=255) ttAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGCCCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGGGGGTGTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTaaga > 2:926482/1‑149 (MQ=255) ttAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTaaga > 2:452160/1‑149 (MQ=255) ttAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTACGGCATCACCAATATTTTTATGCACCGCTAATGCACCAAACAACATTaaga > 2:1014402/1‑149 (MQ=255) ttAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGAGCTTACGTAAGTTATTCGCTGTAATCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTATTGGTGGGTTTATTCCGCCATAACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGGACCAAACAAGCTTaaga > 2:92088/1‑149 (MQ=255) aaGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTaagaag > 1:683131/1‑149 (MQ=255) aGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACGGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGGATCTTTTGGTGGGGTTAGTCCGGCATCCCGAATATTGATCTGGACCGCTACTGCACCCAACAGGCTTaagaagc > 1:576068/1‑148 (MQ=255) gTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTTTTCTTCCTGGGTAACCTGTGGTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCGCCGCTACTGCACCAAACAAGCTgaagaagaa > 1:851576/1‑149 (MQ=255) gTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAgaagaa > 1:49542/1‑149 (MQ=255) tAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAGAAGaaa < 1:884660/149‑1 (MQ=255) AAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGCGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAGAAGAAAGcc < 2:516277‑M1/149‑1 (MQ=255) | CCATGCGCTGCGCACCCGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAGAAGAAAGCC > NC_000913/3726741‑3727035 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |