| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3153895 = | 54 (0.910) | 3 (0.050) | 3/266 | NT | 5.7% | coding (333/660 nt) | yghB | general envelope maintenance protein; DedA family inner membrane protein; putative multidrug efflux transporter |
| ? | NC_000913 | 3153945 = | 47 (0.820) | coding (383/660 nt) | yghB | general envelope maintenance protein; DedA family inner membrane protein; putative multidrug efflux transporter | |||||
GCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGGTTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTAAG > NC_000913/3153797‑3154089 | acttaaccagttgaaaaactggaagcggcggtttggcagaccggaaattcccgccatggttggcagcagcgtacggacaaatgcaagaaaacgtccagCCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTgctggc > 1:444522‑M1/99‑149 (MQ=255) caAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGGTTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTgctggct < 2:2578/149‑1 (MQ=255) gTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGGTTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGa < 1:147520/149‑1 (MQ=255) gTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGGTTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGa > 2:597865/1‑149 (MQ=255) accatatgaaaaactggaagcggcccttgtgcagaccggaaattcccgccatggctggcagcagcgtacggacaaatgcaagaaaccgtccagCCAGCGCGCCACCTGCATGGTGGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGAc > 1:647521‑M1/94‑149 (MQ=255) gctgctGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGGTTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGtttt > 2:154174/1‑149 (MQ=255) gctgGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGGTTAGGGAATACCACAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCtt < 1:887076/149‑1 (MQ=255) aGTTATATTCCGGGGCGCTGGTTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGt < 2:825151/149‑1 (MQ=255) ttATATTCAGGGGCGCTGGTTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTcc > 2:333675/1‑149 (MQ=255) ttATATTCAGGGGCGCTGGTTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTcc > 1:506565/1‑149 (MQ=255) tCAGGGGCGCTGGTTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACgc > 2:535405/1‑149 (MQ=255) gTTAGGAAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCa > 1:1018393/1‑149 (MQ=255) aGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATgg < 2:803911/149‑1 (MQ=255) gAATACCAAAACGGTGACAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGAATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCgg < 2:325792/149‑1 (MQ=255) tACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGaa < 1:333675/149‑1 (MQ=255) cAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAAttt > 1:175290/1‑149 (MQ=255) cAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAAttt > 1:815673/1‑149 (MQ=255) gAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGc < 2:506565/149‑1 (MQ=255) gctggcACAGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCCCGGTCTGCTGGCGCGGCTGGCTGGACGTTGTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAAccgcc > 2:964660/1‑149 (MQ=255) aggcACAGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGAGCCACCTGCATGATTGACAGCCACGGTCTTCTGGCGCTGCTGGCTGGACGATTTGTTGCTTTTGTCCGTACGCTGCTGCCAGCCATGCGGGGTAGTTCCGGTGTGCCTAAcgggcgg > 2:696746/2‑143 (MQ=255) gcACAGCTTCCTGCTAAATATCCCCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCCCGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTCCGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAAGTTCCGGTCTGCCAAGCCGCCGCtt > 2:902412/1‑149 (MQ=255) gcACAGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCtt > 1:754671/1‑149 (MQ=255) cacaGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAACCCGCCGCTTc > 1:597359/1‑149 (MQ=255) acaGCTTCCTGCTATATATCACCAGCGCGCCCCCGGGATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGGTGGCTGGCCGTGTTCTTGCGGTTGTCCGTACGCTGCTGCCAGCCAGGGCGGGAATTTCGGGTCTGCGAGACCGCCGCTTcc > 2:720213/1‑149 (MQ=255) aGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAg > 2:310768/1‑149 (MQ=255) cTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGtt > 2:43484/1‑149 (MQ=255) gtCCAGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTGTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGttt < 1:316891/148‑1 (MQ=255) cgtGCAAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGGTTGACCGCCACGGTCTGCAGGCGCTGCTGGCTGGACGTGTTCATGCTTTTGACCGTACGCGGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGGCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGttttt < 2:779481/147‑1 (MQ=255) cTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTTCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAACCCGCCGCTTCCTGGTTTTc > 1:100052/1‑149 (MQ=255) cTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTc < 1:154174/149‑1 (MQ=255) tGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCACCCATGGCGGGAAGTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGATTCCAGTTTTTCa > 2:343866/1‑149 (MQ=255) tGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGTTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCa < 1:253505/149‑1 (MQ=255) gCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCaa > 2:782647/1‑149 (MQ=255) cTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGGTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAAc < 1:782647/149‑1 (MQ=255) tAACTATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACt < 2:734782/149‑1 (MQ=255) tAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACt > 1:346952/1‑149 (MQ=255) aaaTCTCACCCGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCTAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTg < 2:100942/149‑1 (MQ=255) gtccagccagcagcgccagcagaccgtggcggtccaccatgcaggtggcgcgctggCTGGACGGTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAGCCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCACAAGGGCCGCTTCCAGTTTTTCATATGGt > 1:647521‑M2/57‑149 (MQ=255) tatCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGtt < 2:815673/149‑1 (MQ=255) tCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTaa > 2:59496/1‑149 (MQ=255) tCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTaa < 1:597865/149‑1 (MQ=255) gccagcagcgccagcagaccgtggcggtcaaacatgcaggtggcgcgctggCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGt > 1:444522‑M2/52‑149 (MQ=255) aCCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCAGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGt > 2:357687/1‑149 (MQ=255) ccagcagcgccagcagaccgtggcggtcaaacatgcaggtggcgcgctggCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCACCGGGTGAAGTg > 2:1014053‑M2/51‑149 (MQ=255) gcgcCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTg < 1:434324/149‑1 (MQ=255) cACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCtgt < 1:664033/149‑1 (MQ=255) gCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGt > 2:15592/1‑134 (MQ=255) gCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGt < 1:15592/134‑1 (MQ=255) cATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCa < 1:535405/149‑1 (MQ=255) gTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGAGGGAATTTCCGGTCTGCCAACCCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCg > 2:737006/1‑149 (MQ=255) gTTTGACCGCCACGGGCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCg < 2:988217/149‑1 (MQ=255) ctgctgGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTgg < 1:361957/149‑1 (MQ=255) atgctgGCGCTGCTGGCTGGACGCTGTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCAGCCAACCAAGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGATTTgg < 2:229649/148‑1 (MQ=255) ctgGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTa > 1:546281/1‑149 (MQ=255) tgGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTAt < 2:1018393/149‑1 (MQ=255) gcgcTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGTAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTGAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGc < 2:202468/149‑1 (MQ=255) gcgcTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGc < 1:136881/149‑1 (MQ=255) gcgggCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTaa < 2:298240‑M2/144‑1 (MQ=255) ctggCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAAACATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAACCCGCCGCTCCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGCATTGCTGTGGGTCAGCGTGCTAACCAGTTTTCGCTATGCCTAAAg > 1:506161‑M2/5‑149 (MQ=255) | GCAAGTCTGGGCTGCTGGCTAAGTTATATTCAGGGGCGCTGGTTAGGGAATACCAAAACGGTGAAAGGCTGGCTGGCACAGCTTCCTGCTAAATATCACCAGCGCGCCACCTGCATGTTTGACCGCCACGGTCTGCTGGCGCTGCTGGCTGGACGTTTTCTTGCATTTGTCCGTACGCTGCTGCCAACCATGGCGGGAATTTCCGGTCTGCCAAACCGCCGCTTCCAGTTTTTCAACTGGTTAAGTGGATTGCTGTGGGTCAGCGTGGTAACCAGTTTTGGCTATGCCTTAAG > NC_000913/3153797‑3154089 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |