| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,704,723 | T→C | 5.8% | intergenic (+47/‑226) | blr → / → cnu | beta‑lactam resistance membrane protein; divisome‑associated protein/nucleoid‑associated oriC‑binding protein; H‑NS and StpA stabilizing factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,704,723 | 0 | T | C | 5.8% | 192.4 / 2.9 | 69 | intergenic (+47/‑226) | blr/cnu | beta‑lactam resistance membrane protein; divisome‑associated protein/nucleoid‑associated oriC‑binding protein; H‑NS and StpA stabilizing factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (24/40); new base C (2/2); total (27/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.33e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.32e-01 | |||||||||||
GGTTGGATCGTTCTTGTCGTTTCAGTCATTCTTCTTGGCGTGGCGAGTCACATTGACAACTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCATCAGCGCATTCTTATTATTGTAATAAC > NC_000913/1704575‑1704868 | ggTTGGATCGTTCTTGTCGTTTCAGTCCTTCTTCATGGCGTGGCGAGTCACATTGACAACTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGtttt < 2:87801/149‑1 (MQ=255) gTTGGATCGTTCGTGTCGTTTCAGTCATTCTTCTTGGCGTGGCGAGTCACATTGACAACTATCAGCCACCTGACCAGAGTGCTTAGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTc > 2:722367/1‑149 (MQ=255) ttGGATCGTTCTTGTCGTTTCAGTCATTCTTCTTGGCGTGGCGAGTCACATTGACAACTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCa < 1:511891/149‑1 (MQ=255) gtGGATCGTTCTTGTCGTTTCAGTCATTCTTCTTGGCGTGGCGAGTCACATTGACCACTCTCAGCCACCTGAACAGAGTGCTGCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCa < 1:739017/148‑1 (MQ=255) gATCGTTCTTGTCGTTTCAGTCATTCTTCTTGGCGTGGCGAGTCACATTGACATCTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACAGAAGTTAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACtt < 1:101351/149‑1 (MQ=255) gTTCTTGTCGTTGCAGTCATTCTTCTTGGCGTGGCGAGTCACATTGCCAACTATCAGCGACCTGAACAGAGGGCTTCGGTACACCACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCg < 1:869817/149‑1 (MQ=255) ttCTTGTCGTTTCAGTCATTCTTCTTGGCGTGGCGAGTCACATTGACAACTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCgg > 1:912977/1‑149 (MQ=255) gTCGTTTCAGTCATTCTTCTTGGCGTGGCGAGTCACATTGACAACTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATAtt < 1:198718/149‑1 (MQ=255) gTTTCAGTCATTCTTCTTGGCGTGGCGAGTCACATTGACAACTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTCCACTTGTCGGATATTaaa > 1:845207/1‑149 (MQ=255) gTTTCAGTCATTCTTCTTGGCGTGGCGAGTCACATTGACAACTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTCCACTTGTCGGATATTaaa > 1:849408/1‑149 (MQ=255) cAGTCATTCTTCTTGGCGTGGCGAGTCACATTGACAACTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAg < 1:665243/149‑1 (MQ=255) tCATTCTTCTTGGCGTGGCGAGTCACATTGACAACTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa > 2:182611/1‑149 (MQ=255) tCATTCTTCTTGGCGTGGCGAGTCACATTGACAACTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCAGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa > 1:73677/1‑149 (MQ=255) tcttctTGGCGTGGCGAGTCACATTGACAACTATCAGCCACCTGAACCGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATtta < 2:182823/149‑1 (MQ=255) ttGGCGTGGCGAGTCACATTGACAACTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATc < 1:39981/149‑1 (MQ=255) tggcgtggcgAGTCACATTGACAACTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCt > 1:972924/1‑149 (MQ=255) ggcgtggcgAGGCACATTGACAACTAGCATCCACCTGACCCGAGTGCTTCGGTACAACACTAGTCACCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCCGGAATTTATTATCtt < 2:259258/149‑1 (MQ=255) ggcggggcgAGTCACATTGACAACTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCtt < 2:377096/149‑1 (MQ=255) gtggcgAGTCACATTGACAACTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTTTGCACTTGTGGAGCGACATGCAGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGtt < 1:498381/149‑1 (MQ=255) tggcgAGTCACATTGACAACTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTc < 1:172964/149‑1 (MQ=255) cgAGTCACATTGACAACTATCATCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGAt < 2:138388/149‑1 (MQ=255) cgAGTCACATTGACAACTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGAt < 1:975566/149‑1 (MQ=255) gAGTCACATTGACAACTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGAtg < 1:1010329/149‑1 (MQ=255) caTTGACAACTATCAGCCCCCTGAACAGAGGGCGTCGGTACAACACCAGTACGCTCTGCACTTGTGGCGCGCCATGCTGCCCGACCGGGTGCCGGTGTGCCCTTGTCGGATCTTAAACCAGGAATTTATTATCTTGGTCGAGGttgatg > 2:690034/1‑149 (MQ=255) caTTGACAACTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGttgttg < 2:158892/149‑1 (MQ=255) aaTTGACAACTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGttgttg < 1:1007707/148‑1 (MQ=255) aTTGCCAACTATCAGCCTCCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCTCTAGTCGGTTATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTgg < 1:685288/149‑1 (MQ=255) aCAACTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTAGGGGAGCGACATGCTGCCCGTCGGGGGGCATGTTTTCACTTGTCGGCGATGAAACCAGGAAGTTAGTATCTTGGACGATggtgatggtgat > 2:217949/1‑149 (MQ=255) cAACTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGAtt < 1:67550/149‑1 (MQ=255) aaCTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTg < 2:118560/149‑1 (MQ=255) aCTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGt < 1:239586/149‑1 (MQ=255) tATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCa > 2:150134/1‑149 (MQ=255) aTCAGCAACCTGAACAGAGTTCTTCGGTAGAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGAATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAg < 2:521928/149‑1 (MQ=255) tgCCACCTGTACAGAGTGCTTCGGTACAACACTAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACGAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAggca < 2:392748/148‑3 (MQ=255) gCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGGGATTGTCAGGGAt > 1:577769/1‑149 (MQ=255) aaCAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAATCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGGTTGTGATTGTCAGGGATAGTAAAgc < 1:632998/149‑1 (MQ=255) ttCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAg < 2:235814/127‑1 (MQ=255) ttCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAg > 1:235814/1‑127 (MQ=255) ttCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTActct > 1:583736/1‑149 (MQ=255) cGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCttt > 2:126513/1‑149 (MQ=255) gTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTc < 1:998248/149‑1 (MQ=255) acaacaCAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCTGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTGCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGGTTCTCTTTTCag < 2:599250/149‑1 (MQ=255) acaacaCAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGGCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCag > 2:745459/1‑149 (MQ=255) caacaaAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCAGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTTTTATGTTGTTCGATGTTGTTGGTGAGTGTCAGGGATTGTAATGCGCGTTAATCTTTTCaga > 2:590298/1‑149 (MQ=255) aacaCAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCagag < 1:748780/149‑1 (MQ=255) acacAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGc > 2:849123/1‑149 (MQ=255) aaGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTGGGATATTAACCCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATATAAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCACtt > 2:682556/1‑149 (MQ=255) cgTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCTCTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTTTTATCTTGTTCGATGGTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGttt < 1:314273/148‑1 (MQ=255) gTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGtttt < 1:926506/149‑1 (MQ=255) tctGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATcc > 1:367368/1‑149 (MQ=255) tctGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTATTTCATcc > 1:655756/1‑149 (MQ=255) tGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATACCt > 1:657826/1‑149 (MQ=255) cACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGa > 1:456814/1‑149 (MQ=255) aCTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGaa < 1:337063/149‑1 (MQ=255) ggAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTg < 2:912977/149‑1 (MQ=255) ggAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGGTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTg < 1:805942/149‑1 (MQ=255) gACATTCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTTTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCTATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCATc < 1:25524/149‑1 (MQ=255) aCATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGTGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCATCa < 1:461759/149‑1 (MQ=255) cATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCTGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCAACac > 1:374692/1‑148 (MQ=255) gctgcCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATGTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAACTCTCGTTAATATTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCGTGAATATTTGCCATCAgcgc > 1:566091/1‑149 (MQ=255) cccGTCCGAGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCATAAGCGAATTc > 1:754045/1‑149 (MQ=255) gTCCGGGTGCATGTTTCCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCATCAGCGCATTCtta < 2:845207/149‑1 (MQ=255) gTCCGGGTGCATGTTTCCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCATCAGCGCATTCtta < 2:849408/149‑1 (MQ=255) ggTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCATCAGCGCATTCTTattatt > 2:538233/1‑149 (MQ=255) ggTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCATCAGCGCATTCTTattatt < 2:425082/149‑1 (MQ=255) gTGCATGTTTTCACTTGGCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCATCAGCGCATTCTTATTATTg < 1:633964/149‑1 (MQ=255) tGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAAGCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCATCAGCGCATTCTTATTATTGt < 2:577769/149‑1 (MQ=255) cATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCATCAGCGCATTCTTATTATTGtaa < 1:866861/149‑1 (MQ=255) gTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCATCAGCGCATTCTTATTATTGtaataa > 2:253475/1‑149 (MQ=255) gTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGATGTTGGTGATAGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTGTTTCATCCCTGAATAATTGCCATCAGCGCATTCTTATTATTGtaataa < 2:49555/149‑1 (MQ=255) ttttCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCATCAGCGCATTCTTATTATTGTAATAac > 2:495246/1‑149 (MQ=255) | GGTTGGATCGTTCTTGTCGTTTCAGTCATTCTTCTTGGCGTGGCGAGTCACATTGACAACTATCAGCCACCTGAACAGAGTGCTTCGGTACAACACAAGTAAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCAGAGCAGTTTTTCATCCCTGAATATTTGCCATCAGCGCATTCTTATTATTGTAATAAC > NC_000913/1704575‑1704868 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |